DNA/RNA අනුක්‍රමණය - නැනෝපෝර් අනුක්‍රමණය
සේවා විස්තර විශේෂාංග
| වේදිකාව | පුස්තකාල ප්රමාණය | න්‍යායාත්මක දත්ත අස්වැන්න (සෛලයකට) | තනි-පාදක නිරවද්යතාව | අයදුම්පත් |
| නැනෝපෝර් | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Cell | 85-92% | SV ඇමතුම්, De novo, පූර්ණ-දිග අනුපිළිවෙල, Iso-Seq, ජාන විවරණ, DNA මෙතිලේෂන් හඳුනාගැනීම |
සේවා වාසි
● විවිධ විශේෂයන් සහිත සංවෘත ව්යාපෘති දහස් ගණනක් සමඟ PacBio අනුක්‍රමික වේදිකාවේ වසර 5කට වැඩි පළපුරුද්ද.
● BMKGENE යනු ද්විත්ව වේදිකා RNA/DNA සහතිකය සහිත Oxford Nanopore හි නිල හවුල්කරුවෙකි.
● සම්පූර්ණ උපකරණ සහ ප්‍රමාණවත් අනුක්‍රමික ප්‍රතිදානයක් සහිත අනුක්‍රමිකයන්ගේ ප්‍රධාන ධාරාවේ ආකෘති ඇත.
● නැනෝපෝර් වේදිකාව මත පදනම්ව, සත්ව හා ශාක Denovo පර්යේෂණ 10 කට වැඩි ප්‍රමාණයක් ජාත්‍යන්තරව පිළිගත් සඟරාවල ප්‍රකාශයට පත් කර ඇත.
නියැදි අවශ්යතා
| නියැදි වර්ගය | ප්රමාණය | සාන්ද්රණය(Qubit ®) | පරිමාව | පිරිසිදුකම | අන් අය |
| ජානමය DNA | දත්ත අවශ්යතා මත රඳා පවතී | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm හි පැහැදිලි උපරිමය, දූෂණය නැත | Qubit සහ Qubit/Nanopore ≤ 2 මගින් සාන්ද්රණය මැනිය යුතුය |
| සම්පූර්ණ RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5；දූෂණයන් නොමැත | RIN අගය ≥7.5 |
සේවා කාර්ය ප්රවාහය
නියැදි පිළියෙල
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
ව්යාපෘති භාරදීම
DNA සාම්පලයේ දත්ත තත්ත්ව තක්සේරුව
වගුව 1. පිරිසිදු දත්ත පිළිබඳ සංඛ්යා ලේඛන.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 කි | 26.37 කි | 1,121,736 කි | 25.90 කි | 28,014 කි | 15,764 කි | 23,090 කි | 143,181 කි | 9 |
RNA සාම්පලයේ දත්ත තත්ත්ව තක්සේරුව
වගුව 1. පිරිසිදු දත්ත පිළිබඳ සංඛ්යා ලේඛන.
| ගොනු නාමය | සේවාලාභී හැඳුනුම්පත | ReadNum | BaseNum | N50 | මධ්යන්ය දිග | උපරිම දිග | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 කි | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 කි | Q12 |
රූපය 1. කියවීමේ දිග බෙදා හැරීම
රූපය 2. පිරිසිදු දත්තවල ගුණාත්මක ලකුණු බෙදා හැරීම
රූපය 3. පිරිසිදු දත්තවල දිග සහ ගුණාත්මක ලකුණු බෙදා හැරීම
