යුකැරියෝටික් mRNA අනුක්‍රමණය - ඉලුමිනා
වාසි
Øඉහළ පළපුරුදු: සෛල සංස්කෘතිය, පටක, ශරීර තරල, ආදිය ඇතුළු විවිධ නියැදි වර්ග ආවරණය වන පරිදි BMK හි සාම්පල 200,000කට අධික ප්‍රමාණයක් සකස් කර ඇති අතර විවිධ පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍ර ආවරණය වන පරිදි mRNA-Seq ව්‍යාපෘති 7,000කට වඩා වසා ඇත.
Øදැඩි තත්ත්ව පාලන පද්ධතිය: නියැදි සකස් කිරීම, පුස්තකාලය සකස් කිරීම, අනුක්‍රමණය කිරීම සහ ජෛව තොරතුරු ඇතුළු සියලුම පියවර හරහා මූලික තත්ත්ව පාලන ලක්ෂ්‍ය උසස් තත්ත්වයේ ප්‍රතිඵල ලබා දීම සඳහා සමීප අධීක්ෂණය යටතේ පවතී.
Øවිවිධ පර්යේෂණ ඉලක්ක සපුරා ගැනීම සඳහා ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ සාරවත් අධ්‍යයන සඳහා බහු දත්ත සමුදායන් තිබේ.
Øඅලෙවියෙන් පසු සේවා: ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, ගැටළු නිරාකරණය, ප්‍රතිඵල ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු යනාදිය ඇතුළුව, ව්‍යාපෘති අවසන් වූ පසු අලෙවියෙන් පසු සේවා මාස 3ක් සඳහා වලංගු වේ.
නියැදි අවශ්‍යතා සහ භාරදීම
| පුස්තකාලය | අනුපිළිවෙල උපාය | නිර්දේශිත දත්ත | තත්ත්ව පාලනය |
| Poly A පොහොසත් | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
නියැදි අවශ්‍යතා:
නියුක්ලියෝටයිඩ:
| පිරිසිදුකම | අඛණ්ඩතාව | ප්රමාණය |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5සීමිත හෝ ප්‍රෝටීන් හෝ DNA දූෂණය ජෙල් මත නොපෙන්වයි. | ශාක සඳහා: RIN≥6.5;සතුන් සඳහා: RIN≥7;28S/18S≥1.0;සීමිත හෝ මූලික උන්නතාංශයක් නැත | Conc≥30 ng/μl;වෙළුම ≥ 10 μl;මුළු ≥ 1.5 μg |
පටක: බර (වියළි):≥1 ග්රෑම්
*5 mg ට වඩා කුඩා පටක සඳහා, ෆ්ලෑෂ් ශීත කළ (ද්‍රව නයිට්‍රජන් වල) පටක සාම්පලයක් යැවීමට අපි නිර්දේශ කරමු.
සෛල අත්හිටුවීම:සෛල ගණන = 3×106- 1×107
* ශීත කළ සෛල ලයිසේට් නැව්ගත කිරීමට අපි නිර්දේශ කරමු.එම සෛලය 5×105 ට වඩා කුඩා නම්, ක්ෂුද්ර නිස්සාරණය සඳහා වඩාත් සුදුසු ද්‍රව නයිට්‍රජන් වල ශීත කළ ෆ්ලෑෂ් නිර්දේශ කෙරේ.
රුධිර සාම්පල:පරිමාව≥1 මිලි
ක්ෂුද්ර ජීවීන්:ස්කන්ධය ≥ 1 g
නිර්දේශිත සාම්පල භාරදීම
බහාලුම්: 2 ml කේන්ද්රාපසාරී නළය (ටින් තීරු නිර්දේශ නොකරයි)
නියැදි ලේබල් කිරීම: සමූහ+ප්‍රතිනිර්මාණය උදා: A1, A2, A3;B1, B2, B3......
නැව්ගත:
- වියළි අයිස්: සාම්පල බෑග්වල අසුරා වියළි අයිස්වල තැන්පත් කළ යුතුය.
- RNA ස්ථායී නල: RNA සාම්පල RNA ස්ථායීකරණ නලයෙන් වියළා ගත හැකිය (උදා: RNAstable®) සහ කාමර උෂ්ණත්වයේ දී නැව්ගත කළ හැක.
සේවා වැඩ ප්රවාහය
අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය
සාම්පල භාරදීම
RNA නිස්සාරණය
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
ජෛව තොරතුරු
යුකැරියෝටික් mRNA අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණ කාර්ය ප්රවාහය
ජෛව තොරතුරු
Øඅමු දත්ත තත්ත්ව පාලනය
Øයොමු ජාන පෙළගැස්ම
Øපිටපත් ව්යුහය විශ්ලේෂණය
Øප්රකාශන ප්‍රමාණකරණය
Øඅවකල ප්රකාශන විශ්ලේෂණය
Øකාර්යය විවරණ සහ පොහොසත් කිරීම
1.mRNA දත්ත සන්තෘප්තිය වක්‍රය
2.අවකල ප්රකාශන විශ්ලේෂණය-ගිනි කන්ද කුමන්ත්රණය
3.DEGs පිළිබඳ KEGG විවරණ
4.DEGs මත GO වර්ගීකරණය
