Hi-C පාදක ක්රොමැටින් අන්තර්ක්රියා
සේවා විශේෂාංග
● PE150 සමඟ Illumina NovaSeq හි අනුක්රමණය.
● සේවාව සඳහා ෆෝමල්ඩිහයිඩ් සමඟ හරස් සම්බන්ධ වීමට සහ DNA-ප්රෝටීන් අන්තර්ක්රියා සංරක්ෂණය කිරීමට නිස්සාරණය කරන ලද න්යෂ්ටික අම්ල වෙනුවට පටක සාම්පල අවශ්ය වේ.
● Hi-C අත්හදා බැලීමේදී බයෝටින් සමඟ ඇලෙන සුළු කෙළවර සීමා කිරීම සහ අවසන් අලුත්වැඩියා කිරීම සිදු කරන අතර, අන්තර්ක්රියා සංරක්ෂණය කරමින් ප්රතිඵලයක් ලෙස මොට කෙළවර චක්රලේඛනය කිරීම සිදු කෙරේ. ඉන්පසු DNA ස්ට්රෙප්ටාවයිඩින් පබළු සමඟ පහළට ඇද දමා පසුව පුස්තකාල සකස් කිරීම සඳහා පිරිසිදු කරනු ලැබේ.
සේවා වාසි
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයප්රශස්ත සීමා කිරීමේ එන්සයිම නිර්මාණය: 93% දක්වා වලංගු අන්තර්ක්රියා යුගල සහිත විවිධ විශේෂ මත ඉහළ Hi-C කාර්යක්ෂමතාවයක් සහතික කිරීම.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් විශේෂඥතාව සහ ප්රකාශන වාර්තා:BMKGene සතුව විවිධ විශේෂ 800 කින් සහ විවිධ පේටන්ට් බලපත්රවලින් 2000 කට අධික Hi-C අනුක්රමික ව්යාපෘති සම්බන්ධයෙන් පුළුල් අත්දැකීම් තිබේ. 900 ට වැඩි සමුච්චිත බලපෑම් සාධකයක් සහිත ප්රකාශිත නඩු 100 කට අධික සංඛ්යාවක් ඇත.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ කුසලතා ඇති ජෛව තොරතුරු විද්යා කණ්ඩායම:Hi-C අත්හදා බැලීම් සහ දත්ත විශ්ලේෂණය සඳහා අභ්යන්තර පේටන්ට් බලපත්ර සහ මෘදුකාංග ප්රකාශන හිමිකම් සහ ස්වයං-සංවර්ධිත දෘශ්යකරණ දත්ත මෘදුකාංගයක් සමඟ.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඅලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට විහිදෙන අතර අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලය මාස 3 කි. මෙම කාලය තුළ, ප්රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම ප්රශ්නයක් විසඳීම සඳහා අපි ව්යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය සහ ප්රශ්නෝත්තර සැසි පිරිනමන්නෙමු.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයවිස්තීර්ණ විවරණ: හඳුනාගත් වෙනස්කම් සහිත ජාන ක්රියාකාරීව විවරණය කිරීමට සහ අනුරූප පොහොසත් කිරීමේ විශ්ලේෂණය සිදු කිරීමට අපි බහු දත්ත සමුදායන් භාවිතා කරමු, බහු පර්යේෂණ ව්යාපෘති පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙන්නෙමු.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුපිළිවෙල උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත ප්රතිදානය | Hi-C සංඥා විභේදනය |
| හයි-සී පුස්තකාලය | ඉලුමිනා PE150 | ක්රොමැටින් ලූපය: 150x ටැඩ්: 50x | ක්රොමැටින් ලූප්: 10Kb TAD: 40Kb |
සේවා අවශ්යතා
| සාම්පල වර්ගය | අවශ්ය ප්රමාණය |
| සත්ව පටක | ≥2g |
| සම්පූර්ණ රුධිරය | ≥2මිලි |
| දිලීර | ≥1 ග්රෑම් |
| ශාක - තරුණ පටක | ඇල්කොහොල් 1g, ඇල්කොහොල් 2-4ක් නිර්දේශ කෙරේ |
| සංස්කෘතික සෛල | ≥1x107 |
පහත විශ්ලේෂණයන් ඇතුළත් වේ:
● අමු දත්ත QC;
● සිතියම්ගත කිරීම සහ Hi-C පුස්තකාල QC: වලංගු අන්තර්ක්රියා යුගල සහ අන්තර්ක්රියා ක්ෂය ඝාතක (IDEs);
● ජෙනෝමය පුරා අන්තර්ක්රියා පැතිකඩ: සිස්/ට්රාන්ස් විශ්ලේෂණය සහ Hi-C අන්තර්ක්රියා සිතියම;
● A/B මැදිරි ව්යාප්තිය විශ්ලේෂණය කිරීම;
● TAD සහ ක්රොමැටින් ලූප හඳුනා ගැනීම;
● සාම්පල අතර ත්රිමාණ ක්රොමැටින් ව්යුහ මූලද්රව්ය පිළිබඳ අවකල විශ්ලේෂණය සහ අදාළ ජානවල අනුරූප ක්රියාකාරී විවරණය.
Cis සහ ට්රාන්ස් අනුපාත ව්යාප්තිය
සාම්පල අතර වර්ණදේහ අන්තර්ක්රියා වල තාප සිතියම
A/B මැදිරිවල ජෙනෝමය පුරා ව්යාප්තිය
ක්රොමැටින් ලූපවල ජෙනෝමය පුරා ව්යාප්තිය
TADs දෘශ්යකරණය කිරීම
BMKGene හි Hi-C අනුක්රමික සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන ලද පර්යේෂණ දියුණුව, සංක්ෂිප්ත ප්රකාශන එකතුවක් හරහා ගවේෂණය කරන්න.
මෙන්ග්, ටී. සහ තවත් අය (2021) 'සංසන්දනාත්මක ඒකාබද්ධ බහු-ඔමික්ස් විශ්ලේෂණයක් CA2 කෝඩෝමා සඳහා නව ඉලක්කයක් ලෙස හඳුනා ගනී',ස්නායු-පිළිකා විද්යාව, 23(10), පි. 1709-1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
Xu, L. et al. (2021) 'ජෙනෝමයේ ත්රිමාණ අසංවිධානාත්මකභාවය සහ නැවත සකස් කිරීම ඒකාබද්ධ Hi-C, නැනෝපෝර් සහ RNA අනුක්රමණය මගින් NAFLD හි ව්යාධිජනකය පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි',ඇක්ටා ෆාමසියුටිකා සිනිකා බී, 11(10), පි. 3150-3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.
