Hi-C පාදක ජෙනෝම එකලස් කිරීම
Hi-C යනු සමීපත්වය මත පදනම් වූ අන්තර්ක්රියා සහ ඉහළ ප්රතිදාන අනුක්රමණය පරීක්ෂා කිරීම ඒකාබද්ධ කිරීමෙන් වර්ණදේහ වින්යාසය ග්රහණය කර ගැනීමට නිර්මාණය කර ඇති ක්රමයකි. මෙම අන්තර්ක්රියා වල තීව්රතාවය වර්ණදේහවල භෞතික දුර සමඟ සෘණාත්මකව සහසම්බන්ධ වන බව විශ්වාස කෙරේ. එබැවින්, කෙටුම්පත් ජෙනෝමයක එකලස් කරන ලද අනුපිළිවෙලවල් පොකුරු කිරීම, ඇණවුම් කිරීම සහ දිශානතියට මඟ පෙන්වීමට සහ ඒවා නිශ්චිත වර්ණදේහ ගණනකට නැංගුරම් ලෑමට Hi-C දත්ත භාවිතා කරයි. මෙම තාක්ෂණය ජනගහන පාදක ජාන සිතියමක් නොමැති විට වර්ණදේහ මට්ටමේ ජෙනෝම එකලස් කිරීමක් බලගන්වයි. සෑම ජෙනෝමයකටම Hi-C අවශ්ය වේ.
සේවා විශේෂාංග
● PE150 සමඟ Illumina NovaSeq හි අනුක්රමණය.
● සේවාව සඳහා ෆෝමල්ඩිහයිඩ් සමඟ හරස් සම්බන්ධ වීමට සහ DNA-ප්රෝටීන් අන්තර්ක්රියා සංරක්ෂණය කිරීමට නිස්සාරණය කරන ලද න්යෂ්ටික අම්ල වෙනුවට පටක සාම්පල අවශ්ය වේ.
● Hi-C අත්හදා බැලීමේදී බයෝටින් සමඟ ඇලෙන සුළු කෙළවර සීමා කිරීම සහ අවසන් අලුත්වැඩියා කිරීම සිදු කරන අතර, අන්තර්ක්රියා සංරක්ෂණය කරමින් ප්රතිඵලයක් ලෙස මොට කෙළවර චක්රලේඛනය කිරීම සිදු කෙරේ. ඉන්පසු DNA ස්ට්රෙප්ටාවයිඩින් පබළු සමඟ පහළට ඇද දමා පසුව පුස්තකාල සකස් කිරීම සඳහා පිරිසිදු කරනු ලැබේ.
සේවා වාසි
Hi-C පිළිබඳ දළ විශ්ලේෂණය
(ලයිබර්මන්-අයිඩන් ඊ සහ තවත් අය,විද්යාව, 2009)
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයජානමය ජනගහන දත්ත සඳහා ඇති අවශ්යතාවය ඉවත් කිරීම:Hi-C මගින් contig නැංගුරම් දැමීම සඳහා අවශ්ය අත්යවශ්ය තොරතුරු ආදේශ කරයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ සලකුණු ඝනත්වය:90% ට වඩා ඉහළ කොන්ටිග් නැංගුරම් අනුපාතයකට මග පාදයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් විශේෂඥතාව සහ ප්රකාශන වාර්තා:BMKGene සතුව විවිධ විශේෂ 1000 කින් සහ විවිධ පේටන්ට් බලපත්රවලින් 2000 කට අධික Hi-C ජෙනෝම් එකලස් කිරීමේ අවස්ථා සම්බන්ධයෙන් පුළුල් අත්දැකීම් තිබේ. ප්රකාශිත අවස්ථා 200 කට අධික සංඛ්යාවක සමුච්චිත බලපෑම් සාධකය 2000 ට වඩා වැඩිය.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ කුසලතා ඇති ජෛව තොරතුරු විද්යා කණ්ඩායම:Hi-C අත්හදා බැලීම් සහ දත්ත විශ්ලේෂණය සඳහා අභ්යන්තර පේටන්ට් බලපත්ර සහ මෘදුකාංග ප්රකාශන හිමිකම් සමඟින්, ස්වයං-සංවර්ධිත දෘශ්යකරණ දත්ත මෘදුකාංගය අතින් බ්ලොක් චලනය, ආපසු හැරවීම, අවලංගු කිරීම සහ නැවත කිරීම සක්රීය කරයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඅලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට විහිදෙන අතර අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලය මාස 3 කි. මෙම කාලය තුළ, ප්රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම ප්රශ්නයක් විසඳීම සඳහා අපි ව්යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය සහ ප්රශ්නෝත්තර සැසි පිරිනමන්නෙමු.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයවිස්තීර්ණ විවරණ: හඳුනාගත් වෙනස්කම් සහිත ජාන ක්රියාකාරීව විවරණය කිරීමට සහ අනුරූප පොහොසත් කිරීමේ විශ්ලේෂණය සිදු කිරීමට අපි බහු දත්ත සමුදායන් භාවිතා කරමු, බහු පර්යේෂණ ව්යාපෘති පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙන්නෙමු.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාල සූදානම | අනුක්රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත ප්රතිදානය | තත්ත්ව පාලනය |
| හයි-සී පුස්තකාලය | ඉලුමිනා නෝවාසෙක් PE150 | 100x 엄장 | Q30 ≥ 85% |
නියැදි අවශ්යතා
| පටක | අවශ්ය ප්රමාණය |
| සත්ව විස්සෙරා | ≥ 2 ග්රෑම් |
| සත්ව මාංශ පේශි | |
| ක්ෂීරපායී රුධිරය | ≥ 2 මිලි |
| කුකුළු මස්/මාළු ලේ | |
| ශාකය- නැවුම් කොළ | ≥ 3 ග්රෑම් |
| සංස්කෘතික සෛල | ≥ 1x107 |
| කෘමියා | ≥ 2 ග්රෑම් |
සේවා වැඩ ප්රවාහය
අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
1) අමු දත්ත QC
2) Hi-C පුස්තකාල QC: වලංගු Hi-C අන්තර්ක්රියා ඇස්තමේන්තු කිරීම
3) Hi-C එකලස් කිරීම: කණ්ඩායම් වශයෙන් කොන්ටිග් පොකුරු කිරීම, ඉන්පසු එක් එක් කණ්ඩායම තුළ කොන්ටිග් අනුපිළිවෙල සහ කොන්ටිග් දිශානතිය පැවරීම.
4) Hi-C ඇගයීම
Hi-C පුස්තකාල QC - Hi-C වලංගු අන්තර්ක්රියා යුගල ඇස්තමේන්තු කිරීම
Hi-C එකලස් කිරීම - සංඛ්යාලේඛන
එකලස් කිරීමෙන් පසු ඇගයීම - බඳුන් අතර සංඥා තීව්රතාවයේ තාප සිතියම
BMKGene හි Hi-C එකලස් කිරීමේ සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන ලද දියුණුව, තෝරාගත් ප්රකාශන එකතුවක් හරහා ගවේෂණය කරන්න.
ටියැන්, ටී. සහ තවත් අය (2023) 'ප්රමුඛ නියඟයට ඔරොත්තු දෙන බඩ ඉරිඟු විෂබීජ ප්ලාස්මයක ජෙනෝම එකලස් කිරීම සහ ජානමය විච්ඡේදනය', නේචර් ජෙනටික්ස් 2023 55:3, 55(3), පිටු. 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
වැන්ග්, ඉසෙඩ්එල් සහ තවත් අය (2020) 'ආසියානු මී මැසි ඒපිස් සෙරානා ජෙනෝමයේ වර්ණදේහ-පරිමාණ එකලස් කිරීම', ජාන විද්යාවේ මායිම්, 11, පි. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
ෂැං, එෆ්. සහ තවත් අය (2023) 'සොලනේසී පවුලේ ජෙනෝම දෙකක් විශ්ලේෂණය කිරීමෙන් ට්රොපේන් ඇල්කලෝයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණයේ පරිණාමය හෙළිදරව් කිරීම', නේචර් කොමියුනිකේෂන්ස් 2023 14:1, 14(1), පිටු 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ෂැං, එක්ස්. සහ තවත් අය (2020) 'නුග ගසේ සහ පරාග වාහක බඹරෙහි ජෙනෝම මගින් අත්තික්කා-බඹර සහ-පරිණාමය පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දේ', සෛලය, 183(4), පිටු. 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
