-
Metagenomic Sequencing (NGS)
මෙටජෙනෝමය යනු පාරිසරික මෙටජෙනෝමය, මානව මෙටජෙනෝමය වැනි මිශ්‍ර ජීවීන්ගේ ප්‍රජාවක සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි ද්‍රව්‍යවල එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්ර ජීවීන්ගේ ජෙනෝම අඩංගු වේ.Metagenomic sequencing යනු පාරිසරික සාම්පල වලින් ලබාගත් මිශ්‍ර ප්‍රවේණික ද්‍රව්‍ය විශ්ලේෂණය කිරීමට භාවිතා කරන අණුක මෙවලමකි, එය විශේෂ විවිධත්වය සහ බහුලත්වය, ජනගහන ව්‍යුහය, ෆයිලොජෙනටික් සම්බන්ධතාවය, ක්‍රියාකාරී ජාන සහ පාරිසරික සාධක සමඟ සහසම්බන්ධතා ජාලය පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක තොරතුරු සපයයි.
වේදිකාව:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-නැනෝපෝර්
Metagenomics යනු පාරිසරික සාම්පල වලින් ලබාගත් මිශ්‍ර ප්‍රවේණික ද්‍රව්‍ය විශ්ලේෂණය කිරීමට භාවිතා කරන අණුක මෙවලමකි, එය විශේෂ විවිධත්වය සහ බහුලත්වය, ජනගහන ව්‍යුහය, ෆයිලොජෙනටික් සම්බන්ධතාවය, ක්‍රියාකාරී ජාන සහ පාරිසරික සාධක සමඟ සහසම්බන්ධතා ජාලය යනාදිය පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක තොරතුරු සපයයි. නැනෝපෝර් අනුක්‍රමික වේදිකා මෑතකදී හඳුන්වා දී ඇත. metagenomic අධ්‍යයනයට.කියවීමේ දිගෙහි එහි කැපී පෙනෙන කාර්ය සාධනය බොහෝ දුරට පහළ ප්‍රවාහ මෙටජෙනොමික් විශ්ලේෂණය, විශේෂයෙන් මෙටජෙනොම් එකලස් කිරීම වැඩි දියුණු කළේය.කියවීමේ දිග ප්‍රයෝජන ගනිමින්, නැනෝපෝර් මත පදනම් වූ මෙටජෙනොමික් අධ්‍යයනයට වෙඩි-තුවක්කු මෙටජෙනොමික්ස් හා සසඳන විට වඩා අඛණ්ඩ එකලස් කිරීමක් ලබා ගත හැකිය.Nanopore-පදනම් වූ metagenomics ක්ෂුද්ර ජීවින් (Moss, EL, et. al,ස්වභාවික ජෛව තාක්ෂණය, 2020)
වේදිකාව:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
ඉතා සංරක්‍ෂිත සහ අධි-විචල්‍ය කලාප යන දෙකම අඩංගු 16S සහ 18S rRNA හි උප ඒකකය ප්‍රොකැරියෝටික් සහ යුකැරියෝටික් ජීවීන් හඳුනාගැනීම සඳහා පරිපූර්ණ අණුක ඇඟිලි සලකුණකි.අනුපිළිවෙලින් ප්‍රයෝජන ගනිමින්, මෙම ඇම්ප්ලිකෝන සංරක්ෂණය කරන ලද කොටස් මත පදනම්ව ඉලක්ක කළ හැකි අතර, ක්ෂුද්‍රජීවී විවිධත්ව විශ්ලේෂණය, වර්ගීකරණය, ෆයිලොජනි ආදිය ආවරණය කරන අධ්‍යයනයන්ට දායක වන ක්ෂුද්‍රජීවී හඳුනාගැනීම සඳහා අධි-විචල්‍ය කලාප සම්පූර්ණයෙන්ම සංලක්ෂිත කළ හැකිය. තනි අණු තත්‍ය කාලීන (SMRT ) PacBio වේදිකාවේ අනුපිළිවෙලින් සම්පූර්ණ දිග ඇම්ප්ලිකන් (ආසන්න වශයෙන්. 1.5 Kb) ආවරණය කළ හැකි ඉතා නිවැරදි දිගු කියවීම් ලබා ගැනීමට හැකියාව ලැබේ.ප්‍රවේණික ක්ෂේත්‍රය පිළිබඳ පුළුල් දැක්ම බැක්ටීරියා හෝ දිලීර ප්‍රජාව තුළ විශේෂ විවරණවල විභේදනය බෙහෙවින් වැඩි දියුණු කළේය.
වේදිකාව:PacBio අනුක්‍රමික II
-
16S/18S/ITS ඇම්ප්ලිකන් අනුක්‍රමණය-NGS
16S/18S/ITS ඇම්ප්ලිකොන් අනුක්‍රමය මගින් ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවක් තුළ ෆයිලොජනි, වර්ගීකරණය සහ විශේෂ බහුලත්වය හෙළිදරව් කිරීම අරමුණු කරගනු ලබන්නේ අතිශයින් සංවාද කළ සහ අධි විචල්‍ය කොටස් අඩංගු වන ගෘහ පාලන ජාන සලකුණු වල PCR නිෂ්පාදන විමර්ශනය කිරීමෙනි.Woeses et al,(1977) විසින් මෙම පරිපූර්ණ අණුක ඇඟිලි සලකුණු හඳුන්වාදීම හුදකලා-නිදහස් ක්ෂුද්ර ජීවී පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි.16S (බැක්ටීරියා), 18S (දිලීර) සහ අභ්‍යන්තර පිටපත් කරන ලද ස්පේසර් (ITS, දිලීර) අනුපිළිවෙලින් බහුල විශේෂ මෙන්ම දුර්ලභ සහ හඳුනා නොගත් විශේෂ හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි.මෙම තාක්ෂණය මිනිස් මුඛය, බඩවැල්, මලපහ ආදී විවිධ පරිසරවල අවකල්‍ය ක්ෂුද්‍රජීවී සංයුතිය හඳුනාගැනීම සඳහා බහුලව භාවිතා වන සහ ප්‍රධාන මෙවලමක් බවට පත්ව ඇත.
වේදිකාව:Illumina NovaSeq6000
-
බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ ජෙනෝමය නැවත අනුක්‍රමණය කිරීම
බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ ජෙනෝම ප්‍රති-අනුක්‍රමණය යනු දන්නා බැක්ටීරියා සහ දිලීර වල ප්‍රවේණි සම්පූර්ණ කිරීමට මෙන්ම බහු ජෙනෝම සංසන්දනය කිරීමට හෝ නව ජීවීන්ගේ ජෙනෝම සිතියම්ගත කිරීමට තීරණාත්මක මෙවලමකි.නිවැරදි විමර්ශන ජෙනෝමයන් ජනනය කිරීම සඳහා, ක්ෂුද්‍රජීවී හඳුනාගැනීම් සහ අනෙකුත් සංසන්දනාත්මක ජෙනෝම අධ්‍යයනයන් සිදු කිරීම සඳහා බැක්ටීරියා සහ දිලීර වල සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුක්‍රමණය කිරීම ඉතා වැදගත් වේ.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq 6000
-
දිලීර ජෙනෝමය
Biomarker Technologies විශේෂිත පර්යේෂණ ඉලක්කය මත පදනම්ව දිලීරයේ ජාන සමීක්ෂණය, සියුම් ජෙනෝමය සහ pene-complete genome සපයයි.ඉහළ මට්ටමේ ජෙනෝම එකලස් කිරීම සඳහා ඊළඟ පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙල + තුන්වන පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙල ඒකාබද්ධ කිරීමෙන් ජෙනෝම අනුක්‍රමණය, එකලස් කිරීම සහ ක්‍රියාකාරී විවරණ ලබා ගත හැක.වර්ණදේහ මට්ටමින් ජෙනෝම එකලස් කිරීම පහසු කිරීම සඳහා Hi-C තාක්ෂණය ද භාවිතා කළ හැක.
වේදිකාව:PacBio අනුක්‍රමික II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
බැක්ටීරියා සම්පූර්ණ ජෙනෝමය
Biomarker Technologies මගින් ශුන්‍ය පරතරයක් සහිත සම්පූර්ණ බැක්ටීරියා ජෙනෝමය තැනීම සඳහා අනුක්‍රමික සේවාවක් සපයයි.බැක්ටීරියා සම්පූර්ණ ජෙනෝම සෑදීමේ ප්‍රධාන කාර්ය ප්‍රවාහයට තුන්වන පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙල, එකලස් කිරීම, ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ විශේෂිත පර්යේෂණ ඉලක්ක සපුරාලන උසස් ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ.බැක්ටීරියා ජෙනෝමයේ වඩාත් සවිස්තරාත්මක පැතිකඩක් ඔවුන්ගේ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්ට යටින් පවතින මූලික යාන්ත්‍රණ හෙළි කිරීමට බල ගන්වයි, එමඟින් ඉහළ යුකැරියෝටික් විශේෂවල ප්‍රවේණික පර්යේෂණ සඳහා වටිනා සඳහනක් සැපයිය හැකිය.
වේදිකාව:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio අනුක්‍රමික II
