අඩු කළ නියෝජන බයිසල්ෆයිට් අනුක්රමණය (RRBS)
අඩු කරන ලද නිරූපණ බයිසල්ෆයිට් අනුක්රමණය (RRBS) රඳා පවතින්නේ MspI බෙදීම මගින් CpG දූපත් බහුල කලාප පොහොසත් කිරීම සහ පසුව 200-500/600 bps කොටස්වල ප්රමාණය තෝරා ගැනීම මත ය. එහි ප්රතිඵලයක් ලෙස, CpG දූපත් වලට ආසන්න කලාප පමණක් අනුක්රමණය කරනු ලබන අතර, දුරස්ථ CpG දූපත් ඇති ඒවා විශ්ලේෂණයෙන් බැහැර කරනු ලැබේ. මෙම ක්රියාවලිය, බයිසල්ෆයිට් අනුක්රමණය සමඟ ඒකාබද්ධව, DNA මෙතිලේෂන් ඉහළ විභේදනයකින් හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි, සහ අනුක්රමික ප්රවේශය, PE150, මැදට වඩා ඇතුළු කිරීම් වල කෙළවර කෙරෙහි විශේෂයෙන් අවධානය යොමු කරයි, මෙතිලේෂන් පැතිකඩෙහි කාර්යක්ෂමතාව වැඩි කරයි.
මෙම තාක්ෂණය DNA මෙතිලේෂන් පර්යේෂණයේ දී Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) සඳහා පිරිවැය-ඵලදායී සහ කාර්යක්ෂම විකල්පයක් ලෙස මතු වී ඇත. WGBS තනි පාදක විභේදනයකින් සම්පූර්ණ ජෙනෝමය පරීක්ෂා කිරීමෙන් පුළුල් අවබෝධයක් ලබා දෙන අතර, එහි ඉහළ පිරිවැය සීමාකාරී සාධකයක් විය හැකි අතර, RRBS උපායමාර්ගිකව ජෙනෝමයේ නියෝජිත කොටසක් තෝරා බේරා විශ්ලේෂණය කිරීමෙන් මෙම අභියෝගය අවම කරයි. මෙම ක්රමවේදය යනු පිරිවැය-ඵලදායී DNA මෙතිලේෂන් පර්යේෂණ සක්රීය කරන සහ එපිජෙනටික් යාන්ත්රණ පිළිබඳ දැනුම දියුණු කරන අගනා මෙවලමකි.
සේවා විශේෂාංග
● ඉලුමිනා නෝවාසෙක් හි අනුක්රමණය.
● යොමු ජෙනෝමයක් අවශ්යයි.
● බයිසල්ෆයිට් පරිවර්තන කාර්යක්ෂමතාව නිරීක්ෂණය කිරීම සඳහා ලැම්ඩා DNA භාවිතා කරයි.
● MspI ජීර්ණ කාර්යක්ෂමතාව ද නිරීක්ෂණය කෙරේ.
● ශාක සාම්පල සඳහා ද්විත්ව එන්සයිම ජීර්ණය.
සේවා වාසි
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයWGBS සඳහා පිරිවැය-ඵලදායී සහ කාර්යක්ෂම විකල්පයක්: එය අඩු වියදමකින් සහ අඩු නියැදි අවශ්යතා සහිතව විශ්ලේෂණය සිදු කිරීමට හැකියාව ලබා දෙයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයසම්පූර්ණ වේදිකාව:අපි නියැදි සැකසීම, පුස්තකාල ඉදිකිරීම සහ අනුක්රමණය කිරීමේ සිට ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය දක්වා එක්-නැවතුම් විශිෂ්ට සේවාවක් සපයන්නෙමු.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් විශේෂඥතාව: විවිධ විශේෂ පරාසයන් හරහා අපට සාර්ථකත්වයක් ලැබී ඇත. BMKGENE දශකයකට වැඩි පළපුරුද්දක්, ඉහළ කුසලතා ඇති විශ්ලේෂණ කණ්ඩායමක්, පුළුල් අන්තර්ගතයක් සහ විශිෂ්ට අලෙවියෙන් පසු සහායක් ගෙන එයි.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුපිළිවෙල උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත ප්රතිදානය | තත්ත්ව පාලනය |
| MspI ජීර්ණය කර බයිසල්ෆයිට් ප්රතිකාර කළ පුස්තකාලය | ඉලුමිනා PE150 | 8 ජීබී | Q30 ≥ 85% බයිසල්ෆයිට් පරිවර්තනය > 99% MspI කැපීමේ කාර්යක්ෂමතාව > 95% |
නියැදි අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු ප්රමාණය (µg) |
| |
| ජානමය DNA | ≥ 30 යි | ≥ 1 | සීමිත පිරිහීම හෝ දූෂණය |
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
BI විශ්ලේෂණයට ඇතුළත් වන්නේ:
● අමු අනුපිළිවෙල තත්ත්ව පාලනය;
● යොමු ජෙනෝමයට සිතියම්ගත කිරීම;
● 5mC මෙතිලේටඩ් භෂ්ම හඳුනා ගැනීම සහ මෝස්තර හඳුනා ගැනීම;
● මෙතිලේෂන් ව්යාප්තිය සහ සාම්පල සංසන්දනය විශ්ලේෂණය කිරීම;
● වෙනස් ලෙස මෙතිලීකරණය කරන ලද කලාප (DMRs) විශ්ලේෂණය;
● DMR වලට සම්බන්ධ ජානවල ක්රියාකාරී විවරණය.
තත්ත්ව පාලනය: ආහාර දිරවීමේ කාර්යක්ෂමතාව (ජෙනෝම සිතියම්ගත කිරීමේදී)
තත්ත්ව පාලනය: බයිසල්ෆයිට් පරිවර්තනය (මෙතිලේෂන් තොරතුරු නිස්සාරණයේදී)
මෙතිලේෂන් සිතියම: 5mC මෙතිලේෂන් ජෙනෝමය පුරා ව්යාප්තිය
නියැදි සංසන්දනය: ප්රධාන සංරචක විශ්ලේෂණය
වෙනස් ලෙස මෙතිලේටඩ් කලාප (DMRs) විශ්ලේෂණය: තාප සිතියම
BMKGene හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම බයිසල්ෆයිට් අනුක්රමික සේවාවන් මගින් සපයන ලද පර්යේෂණ දියුණුව, සංක්ෂිප්ත ප්රකාශන එකතුවක් හරහා ගවේෂණය කරන්න.
Li, Z. et al. (2022) 'CRISPR සක්රිය කිරීම සහ පැරක්රීන් සාධක මගින් ලේඩිග් වැනි සෛල තුළට අධි-විශ්වාසනීය ප්රතික්රමලේඛනය',PNAS නෙක්සස්, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
ටියැන්, එච්. සහ තවත් අය (2023) 'චීන ඒකජෛව නිවුන් දරුවන්ගේ ශරීර සංයුතිය පිළිබඳ ජෙනෝම-පුළුල් DNA මෙතිලේෂන් විශ්ලේෂණය',සායනික විමර්ශන පිළිබඳ යුරෝපීය සඟරාව, 53(11), පි. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
වූ, වයි. සහ තවත් අය (2022) 'ඩීඑන්ඒ මෙතිලේෂන් සහ ඉණ-උකුල අනුපාතය: චීන ඒකජෛව නිවුන් දරුවන් තුළ එපිජෙනෝම-පුළුල් සම්බන්ධතා අධ්යයනයක්',අන්තරාසර්ග විද්යාත්මක විමර්ශන සඟරාව, 45(12), පිටු 2365-2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
