-
සම්පූර්ණ දිග mRNA අනුක්‍රමණය-නැනෝපෝර්
RNA අනුක්‍රමණය විස්තීරණ පිටපත් විශ්ලේෂණය සඳහා අගනා මෙවලමක් වී ඇත.සැකයකින් තොරව, සාම්ප්‍රදායික කෙටි කියවීම් අනුපිළිවෙල මෙහි බොහෝ වැදගත් දියුණුවක් ලබා ඇත.එසේ වුවද, එය බොහෝ විට පූර්ණ-දිග සමස්ථානික හඳුනාගැනීම්, ප්‍රමාණකරණය, PCR පක්ෂග්‍රාහී සීමාවන්ට මුහුණ දෙයි.
නැනෝපෝර් අනුක්‍රමණය අනෙකුත් අනුක්‍රමික වේදිකා වලින් වෙන්කර හඳුනා ගනී, නියුක්ලියෝටයිඩ DNA සංස්ලේෂණයකින් තොරව සෘජුවම කියවන අතර කිලෝබේස් දස ගණනකින් දිගු කියවීමක් ජනනය කරයි.මෙය පූර්ණ-දිග පිටපත් හරස් කිරීම සහ සමස්ථානික මට්ටමේ අධ්‍යයනයන්හි අභියෝගවලට මුහුණ දීම සඳහා සෘජුව කියවීමට බලය ලබා දෙයි.
වේදිකාව：Nanopore PromethION
පුස්තකාලය:cDNA-PCR
-
De novo පූර්ණ-දිග පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල -PacBio
ද නවෝපූර්ණ-දිග පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල ලෙසද හැඳින්වේද නවෝIso-Seq PacBio අනුක්‍රමයේ කියවීමේ දිගෙහි වාසි ලබා ගනී, එමඟින් කිසිදු බිඳීමකින් තොරව පූර්ණ-දිග cDNA අණු අනුක්‍රමණය කිරීමට හැකියාව ලැබේ.මෙය පිටපත් එකලස් කිරීමේ පියවරේදී ජනනය වන ඕනෑම දෝෂයක් සම්පූර්ණයෙන්ම මග හරින අතර සමස්ථානික මට්ටමේ විභේදනය සහිත යුනිජීන් කට්ටල ගොඩනඟයි.මෙම යුනිජීන කට්ටලය ප්‍රබල ජානමය තොරතුරු "යොමු ජෙනෝමය" ලෙස පිටපත් මට්ටමින් සපයයි.මීට අමතරව, ඊළඟ පරම්පරාවේ අනුක්‍රමික දත්ත සමඟ ඒකාබද්ධ කිරීම, මෙම සේවාව සමස්ථානික මට්ටමේ ප්‍රකාශනයේ නිවැරදි ප්‍රමාණකරණයක් බල ගන්වයි.
වේදිකාව: PacBio Sequel IIපුස්තකාලය: SMRT සීනු පුස්තකාලය -
යුකැරියෝටික් mRNA අනුක්‍රමණය - ඉලුමිනා
mRNA අනුක්‍රමණය විශේෂිත තත්ත්‍වයන් යටතේ සෛල වලින් පිටපත් කරන ලද සියලුම mRNA වල පැතිකඩ සැකසීම සක්‍රීය කරයි.එය ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහයන් සහ ඇතැම් ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්හි අණුක යාන්ත්‍රණ හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්‍රබල තාක්ෂණයකි.අද වන විට, mRNA අනුක්‍රමණය මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය, ඖෂධ සංවර්ධනය යනාදියෙහි බහුලව භාවිතා කර ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq 6000
-
යොමු නොවන mRNA අනුක්‍රමණය-Illumina
mRNA අනුක්‍රමණය සමහර විශේෂ කාර්යයන් සක්‍රිය කරන නිශ්චිත කාල පරිච්ෙඡ්දයකදී පණිවිඩකරු RNA(mRNA) ආකෘතිය Eukaryote ග්‍රහණය කර ගැනීමට මීළඟ පරම්පරාවේ අනුක්‍රමික තාක්‍ෂණය (NGS) භාවිතා කරයි.දිගම පිටපත් කරන ලද පිටපත 'Unigene' ලෙස හැඳින්වූ අතර පසුව විශ්ලේෂණය සඳහා යොමු අනුපිළිවෙල ලෙස භාවිතා කරන ලදී, එය සඳහනකින් තොරව විශේෂයේ අණුක යාන්ත්‍රණය සහ නියාමන ජාලය අධ්‍යයනය කිරීමට ඵලදායී මාධ්‍යයකි.
පිටපත් දත්ත එකලස් කිරීම සහ යුනිජීන් ක්‍රියාකාරී විවරණයෙන් පසුව
(1)SNP විශ්ලේෂණය, SSR විශ්ලේෂණය, CDS පුරෝකථනය සහ ජාන ව්‍යුහය පෙර සැකසෙනු ඇත.
(2)එක් එක් නියැදිය තුළ ඒකජාතික ප්‍රකාශනය ප්‍රමාණ කිරීම සිදු කරනු ලැබේ.
(3) සාම්පල (හෝ කණ්ඩායම්) අතර වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත යුනිජීන ඒකජාතික ප්‍රකාශනය මත පදනම්ව සොයා ගනු ලැබේ.
(4) වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත යුනිජීනවල පොකුරු කිරීම, ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ සුපෝෂණය විශ්ලේෂණය සිදු කරනු ලැබේ.
-
දිගු කේත-නොවන අනුපිළිවෙල-Illumina
දිගු කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNAs) යනු 200 nt ට වැඩි දිගකින් යුත් RNA අණු වර්ගයකි, ඒවා ඉතා අඩු කේතීකරණ විභවයකින් සංලක්ෂිත වේ.LncRNA, කේතීකරණය නොවන RNA වල ප්‍රධාන සාමාජිකයෙකු ලෙස, ප්‍රධාන වශයෙන් න්‍යෂ්ටිය සහ ප්ලාස්මා වල දක්නට ලැබේ.අනුක්‍රමික තාක්‍ෂණයේ සහ ජෛව තොරතුරු විද්‍යාවේ දියුණුව නව lncRNA ගණනාවක් හඳුනා ගැනීමට සහ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාකාරකම් සමඟ සම්බන්ධ කිරීමට හැකි වේ.සමුච්චිත සාක්ෂි මගින් පෙන්නුම් කරන්නේ lncRNA අපි ජානමය නියාමනය, පිටපත් කිරීමේ නියාමනය සහ පශ්චාත් පිටපත් කිරීමේ නියාමනය සඳහා පුළුල් ලෙස සම්බන්ධ වී ඇති බවයි.
-
කුඩා RNA අනුක්‍රමණය - Illumina
කුඩා RNA යනු මයික්‍රෝ RNA (miRNA), කුඩා මැදිහත්වීම් RNA (siRNA) සහ piwi-interacting RNA (piRNA) ඇතුළුව සාමාන්‍යයෙන් 200nt ට වඩා අඩු දිගකින් යුත් කේතීකරණය නොවන RNA අණු පන්තියකි.
MicroRNA (miRNA) යනු සෛල තුළ විවිධ වැදගත් නියාමන භූමිකාවන් ඉටු කරන 20-24nt පමණ දිගකින් යුත් අන්තරාසර්ග කුඩා RNA කාණ්ඩයකි.miRNA බොහෝ ජීව ක්‍රියාවලීන් සඳහා සම්බන්ධ වන අතර එමඟින් පටක - විශේෂිත සහ වේදිකාව - විශේෂිත ප්‍රකාශනය සහ විවිධ විශේෂයන් තුළ ඉතා සංරක්ෂණය කර ඇත.
-
circRNA අනුක්‍රමණය - Illumina
සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල සැලසුම් කර ඇත්තේ නිශ්චිත සෛල මගින් නිශ්චිත සෛල මගින් පිටපත් කරනු ලබන කේතීකරණය (mRNA) සහ කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNA, circRNA සහ miRNA ඇතුළුව) ඇතුළුව සියලුම වර්ගවල RNA අණු පැතිකඩ කිරීමට ය."සම්පූර්ණ RNA අනුක්‍රමණය" ලෙසද හැඳින්වෙන සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල, පිටපත් මට්ටමින් විස්තීර්ණ නියාමන ජාල හෙළිදරව් කිරීම අරමුණු කරයි.NGS තාක්‍ෂණයෙන් ප්‍රයෝජන ගනිමින්, ක්‍රියාකාරී ගුනාංගීකරනය සඳහා පළමු පියවර සපයන ceRNA විශ්ලේෂණය සහ ඒකාබද්ධ RNA විශ්ලේෂණය සඳහා සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ නිෂ්පාදනවල අනුපිළිවෙල තිබේ.circRNA-miRNA-mRNA පදනම් වූ ceRNA හි නියාමන ජාලය හෙළිදරව් කිරීම.
-
සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල - Illumina
සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල සැලසුම් කර ඇත්තේ නිශ්චිත සෛල මගින් නිශ්චිත සෛල මගින් පිටපත් කරනු ලබන කේතීකරණය (mRNA) සහ කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNA, circRNA සහ miRNA ඇතුළුව) ඇතුළුව සියලුම වර්ගවල RNA අණු පැතිකඩ කිරීමට ය."සම්පූර්ණ RNA අනුක්‍රමණය" ලෙසද හැඳින්වෙන සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල, පිටපත් මට්ටමින් විස්තීර්ණ නියාමන ජාල හෙළිදරව් කිරීම අරමුණු කරයි.NGS තාක්‍ෂණයෙන් ප්‍රයෝජන ගනිමින්, ක්‍රියාකාරී ගුනාංගීකරනය සඳහා පළමු පියවර සපයන ceRNA විශ්ලේෂණය සහ ඒකාබද්ධ RNA විශ්ලේෂණය සඳහා සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ නිෂ්පාදනවල අනුපිළිවෙල තිබේ.circRNA-miRNA-mRNA පදනම් වූ ceRNA හි නියාමන ජාලය හෙළිදරව් කිරීම.
-
Prokaryotic RNA අනුක්‍රමණය
ප්‍රොකරියෝටික් RNA අනුක්‍රමය වෙනස්වන සෛලීය පිටපත විශ්ලේෂණය කිරීම මගින්, දෙන ලද මොහොතක RNA වල පැවැත්ම සහ ප්‍රමාණය හෙළි කිරීමට මීළඟ පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙල (NGS) භාවිතා කරයි.අපගේ සමාගමේ ප්‍රොකරියෝටික් ආර්එන්ඒ අනුක්‍රමණය, විශේෂයෙන් ඉලක්ක කරන්නේ යොමු ජෙනෝම සහිත ප්‍රොකැරියෝටයන්, ඔබට පිටපත් කිරීමේ පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහ විශ්ලේෂණය, යනාදිය සපයයි. එය මූලික විද්‍යා පර්යේෂණ, ඖෂධ පර්යේෂණ සහ සංවර්ධනය, සහ තවත් බොහෝ දේ සඳහා බහුලව යෙදී ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome අනුපිළිවෙල
මෙටාට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටෝම් අනුක්‍රමය මගින් ස්වභාවික පරිසරය තුළ ක්ෂුද්‍ර ජීවීන්ගේ (යුකැරියෝට සහ ප්‍රොකරියෝට් යන දෙකම) ජාන ප්‍රකාශනය හඳුනා ගනී (එනම් පස, ජලය, මුහුද, අසූචි, සහ බඩවැල්.).විශේෂයෙන්, මෙම සේවාව මඟින් ඔබට සංකීර්ණ ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවන්ගේ සම්පූර්ණ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ ලබා ගැනීමට ඉඩ සලසයි, වර්ගීකරණ විශ්ලේෂණය. විශේෂ, විවිධ ලෙස ප්‍රකාශිත ජානවල ක්‍රියාකාරී සුපෝෂණය විශ්ලේෂණය සහ තවත් බොහෝ දේ.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq 6000
