Priestorový prepis BMKMANU S1000
Technická schéma priestorového transkriptomu BMKMANU S1000
Výhody BMKMANU S1000
1) Subcelulárne rozlíšenie: Každá oblasť zachytenia obsahovala >2 milióny priestorových čiarových škvŕn s priemerom 2,5 μm a vzdialenosťou 5 μm medzi stredmi škvŕn, čo umožňuje analýzu priestorového transkriptómu so subcelulárnym rozlíšením (5 μm).
2) Viacúrovňová analýza rozlíšenia: Flexibilná viacúrovňová analýza v rozsahu od 100 μm do 5 μm na rozlíšenie rôznych vlastností tkaniva pri optimálnom rozlíšení.
3) Komplexné profilovanie transkriptómu: Je možné analyzovať transkripty zachytené z celého tkanivového sklíčka bez obmedzenia počtu cieľových génov a cieľovej oblasti.
Špecifikácie služby
| Knižnica | Stratégia sekvenovania | Odporúčaný dátový výstup |
| Knižnica cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/vzorka |
Vzorové požiadavky
| Ukážka | číslo | Veľkosť | Kvalita RNA |
| OCT vložený tkanivový blok | 2-3 bloky/vzorka | Približne.6,8 x 6,8 x 6,8 mm3 | RIN≥7 |
Ak chcete získať viac podrobností o návode na prípravu vzoriek a pracovnom postupe služieb, neváhajte a porozprávajte sa s aExpert BMKGENE
Tok servisných prác
Dizajn experimentu
Doručenie vzorky
Predexperiment
Priestorové čiarové kódovanie
Výstavba knižnice
Sekvenovanie
Analýza dát
Popredajné služby
Údaje generované BMKMANU S1000 sa analyzujú pomocou softvéru „BSTMatrix“, ktorý nezávisle navrhol BMKGENE, vrátane:
1) Generovanie matrice génovej expresie
2) HE spracovanie obrazu
3) Kompatibilné s následným softvérom tretích strán na analýzu
4) Online „BSTViewer“ pomáha získať výsledky vizualizácie v rôznych rozlíšeniach.
1.Zhlukovanie škvŕn
2.Priestorová distribúcia
Npoznámka: Rozhodnutieúroveň = 13 (100 um, vľavo); 7 (50 um, správny)
3. Tepelná mapa klastrovania hojnosti vyjadrenia markerov
4. Medzivzorková analýza údajov
