BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produkty

Illumina a BGI

Sekvenčná technológia Illumina, založená na Sequencing by Synthesis (SBS), je celosvetovo prijatou inováciou NGS, ktorá je zodpovedná za generovanie viac ako 90 % celosvetových sekvenčných údajov.Princíp SBS zahŕňa zobrazovanie fluorescenčne značených reverzibilných terminátorov, keď sa každý dNTP pridáva a následne štiepi, aby sa umožnila inkorporácia ďalšej bázy.So všetkými štyrmi reverzibilnými terminátormi viazanými dNTP prítomnými v každom sekvenčnom cykle prirodzená konkurencia minimalizuje skreslenie inkorporácie.Táto všestranná technológia podporuje knižnice s jedným čítaním aj s párovanými koncami, čím sa stará o celý rad genomických aplikácií.Vysoko výkonné schopnosti a presnosť sekvenovania Illumina ho stavajú ako základný kameň vo výskume genomiky, čo vedcom umožňuje odhaliť zložitosť genómov s bezkonkurenčnými detailmi a účinnosťou.

DNBSEQ, vyvinutý spoločnosťou BGI, je ďalšou inovatívnou technológiou NGS, ktorej sa podarilo ďalej znížiť náklady na sekvenovanie a zvýšiť priepustnosť.Príprava knižníc DNBSEQ zahŕňa fragmentáciu DNA, prípravu ssDNA a amplifikáciu pomocou rotujúceho kruhu na získanie nanoguľôčok DNA (DNB).Tie sa potom nanesú na pevný povrch a následne sa sekvenujú kombinatorickou syntézou sondy a kotvy (cPAS).

Naša vopred pripravená služba sekvenovania knižníc uľahčuje zákazníkom prípravu ich sekvenčných knižníc z rôznych zdrojov (okrem iného mRNA, celý genóm, amplikón).Následne môžu byť tieto knižnice odoslané do našich sekvenčných centier na kontrolu kvality a sekvenovanie na platformách Illumina alebo BGI.


Podrobnosti o službe

Demo výsledok

Vlastnosti

Platformy:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten a BGI-DNB-T7

Režimy sekvenovania:PE50, PE100, PE150, PE250

Kontrola kvality knižníc pred sekvenovaním

Doručovanie sekvenčných údajov a kontrola kvality:doručenie správy o kontrole kvality a nespracovaných údajov vo formáte fastq po demultiplexovaní a filtrovaní čítaní Q30.

 

Výhody služby

Všestrannosť služieb sekvenovania:zákazník si môže zvoliť postupnosť podľa pruhu, prietokovej bunky alebo množstva údajov.

Všestrannosť platforiem:Knižnice DNB je možné preniesť na platformy Illumina

Rozsiahle skúsenosti so sekvenčnou platformou Illumina:s tisíckami uzavretých projektov s rôznymi druhmi. 

Doručenie správy o sekvenčnej kontrole kvality:s metrikami kvality, presnosťou údajov a celkovým výkonom projektu sekvenovania.

Vyspelý proces sekvenovania:s krátkou dobou obratu.

Prísna kontrola kvality: Implementujeme prísne požiadavky na kontrolu kvality, aby sme zaručili poskytovanie trvalo vysokokvalitných výsledkov.

Vzorové požiadavky*

Čiastočné radenie jazdných pruhov

Množstvo údajov (X)

Koncentrácia (qPCR/nM)

Objem

X ≤ 50 Gb

> 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

> 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

> 4 nM

≥ 20 μl

Jeden pruh (Illumina)

Plošina

Koncentrácia (qPCR/nM)

Objem

HiSeq X Ten

> 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

> 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

> 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

> 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

> 1,5 nM

≥ 25 μl

 Okrem koncentrácie a celkového množstva je potrebný aj vhodný vzor vrcholu.

 

Ak vaše vzorky nespĺňajú požiadavky na východiskový materiál, kontaktujte nás.

Pracovný postup služby

príprava vzorky

Kontrola kvality knižnice

Sekvenovanie

Sekvenovanie

Analýza dát

Kontrola kvality údajov

Vzorová kontrola kvality

Dodanie projektu


  • Predchádzajúce:
  • Ďalšie:

  • Správa QC knižnice

    Správa o kvalite knižnice sa poskytuje pred sekvenovaním, posúdením množstva knižnice a fragmentácie.

     

    Správa o sekvenovaní kontroly kvality

     

    Tabuľka 1. Štatistika údajov o sekvenovaní.

    ID vzorky

    BMKID

    Surové čítanie

    Nespracované údaje (bp)

    Čisté čítania (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Obrázok 1. Distribúcia kvality pozdĺž meraní v každej vzorke

    A9

    Obrázok 2. Základná distribúcia obsahu

    A10

    Obrázok 3. Distribúcia čítaného obsahu v sekvenčných dátach

    A11

     

    dostat ponuku

    Tu napíšte svoju správu a pošlite nám ju

    Pošlite nám svoju správu: