Produkty

Sekvenovanie DNA/RNA – Nanopore Sequencer

Sekvenovanie DNA/RNA – obrázok s nanoporovým sekvenátorom

ONT sekvenovanie je technológia sekvenovania elektrických signálov v reálnom čase s jednou molekulou založená na nanopóroch, princíp sekvenovania každej platformy je rovnaký.Dvojvláknová DNA/RNA sa naviaže na nanoporézny proteín uložený v biofilme a odvíja sa pod vedením motorického proteínu, pôsobením rozdielu napätia z oboch strán biofilmu, vlákna DNA/RNA prejdú proteínom nanopórového kanála v určitom čase. sadzba.V dôsledku rozdielov v chemických vlastnostiach rôznych báz na reťazci DNA/RNA, keď jedna báza alebo molekula DNA prechádza cez nanopórový kanál, spôsobí zmenu rôznych elektrických signálov.Detegovaním a korešpondenciou s týmito signálmi je možné vypočítať zodpovedajúce typy báz a dokončiť detekciu sekvencie v reálnom čase.

Kontaktuj nás

Podrobnosti o službe

Demo výsledok

Funkcie podrobností o službe

Plošina	Veľkosť knižnice	Teoretický výťažok údajov (na bunku)	Jednozákladná presnosť	Aplikácie
Nanopore	8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralong, cDNA-PCR	70-90 Gb/bunka	85 – 92 %	Volanie SV, De novo, Sekvenovanie v plnej dĺžke, Iso-Seq, Génová anotácia, Detekcia metylácie DNA

Výhody služby

● Viac ako 5 rokov skúseností na platforme sekvenovania PacBio s tisíckami uzavretých projektov s rôznymi druhmi.
● BMKGENE je oficiálnym partnerom Oxford Nanopore s dvojitou platformou RNA/DNA certifikácie.
● Existujú mainstreamové modely sekvencerov s kompletnou výbavou a dostatočnou priepustnosťou sekvenovania.
● Na základe platformy Nanopore bolo publikovaných viac ako 10 výskumov Denovo na zvieratách a rastlinách v medzinárodne uznávaných časopisoch.

Vzorové požiadavky

Typ vzorky

Suma

Koncentrácia (Qubit ®)

Objem

Čistota

Iní

Genomická DNA

Závisí od požiadavky na údaje

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Jasný pík pri 260 nm, žiadne kontaminácie

Koncentráciu je potrebné merať pomocou Qubit a Qubit/Nanopore ≤ 2

Celková RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；žiadne kontaminácie

Hodnota RIN ≥7,5

Pracovný postup služby

príprava vzorky

Výstavba knižnice

Sekvenovanie

Analýza dát

Dodanie projektu

Predchádzajúce: Sekvenovanie DNA/RNA – Illumina Sequencer

Ďalšie: Sekvenovanie zosilneného fragmentu špecifického lokusu (SLAF-Seq)

Hodnotenie kvality údajov vzorky DNA

Tabuľka 1. Štatistika čistých údajov.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26,37	1,121,736	25,90	28 014	15,764	23 090	143 181	9