ØSkúsení: Viac ako 200 000 vzoriek bolo spracovaných v BMK pokrývajúcich rôzne typy vzoriek, vrátane bunkovej kultúry, tkaniva, telesnej tekutiny atď.
ØPrísny systém kontroly kvality: Základné body kontroly kvality vo všetkých krokoch vrátane prípravy vzorky, prípravy knižnice, sekvenovania a bioinformatiky sú dôkladne monitorované, aby sa dosiahli vysokokvalitné výsledky.
ØViacero databáz dostupných pre anotáciu funkcií a štúdie obohatenia na splnenie rôznych výskumných cieľov.
ØPopredajné služby: Popredajné služby platné 3 mesiace po dokončení projektu, vrátane sledovania projektov, odstraňovania problémov, otázok a odpovedí na výsledky atď.
Knižnica | Stratégia sekvenovania | Odporúčané údaje | Kontrola kvality |
Obohatené o Poly A | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30 ≥ 85 % |
Nukleotidy:
Čistota | bezúhonnosť | Suma |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Obmedzená alebo žiadna kontaminácia proteínom alebo DNA na géli. | Pre rastliny: RIN≥6,5;Pre zvieratá: RIN≥7;28S/18S≥1,0;obmedzené alebo žiadne základné zvýšenie | Konc.≥30 ng/μl;Objem ≥ 10 μl;Celkovo ≥ 1,5 μg |
Tkanivo: Hmotnosť (suché):≥1 g
*Pre tkanivo menšie ako 5 mg odporúčame zaslať bleskovo zmrazenú (v tekutom dusíku) vzorku tkaniva.
Bunková suspenzia:Počet buniek = 3 x 106- 1×107
*Odporúčame zaslať zmrazený bunkový lyzát.V prípade, že počet buniek je menší ako 5×105, odporúča sa bleskovo zmraziť v tekutom dusíku, čo je vhodnejšie na mikroextrakciu.
Vzorky krvi:Objem ≥ 1 ml
Mikroorganizmus:Hmotnosť ≥ 1 g
Nádoba: 2 ml centrifugačná skúmavka (neodporúča sa cínová fólia)
Označenie vzoriek: Skupina+replikácia napr. A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Náklad:
Bioinformatika
Eukaryotické Pracovný postup analýzy sekvenovania mRNA
Bioinformatika
ØKontrola kvality nespracovaných údajov
ØReferenčné zarovnanie genómu
ØAnalýza štruktúry prepisu
ØKvantifikácia expresie
ØDiferenčná expresná analýza
ØAnotácia a obohatenie funkcie
1.Krivka nasýtenia údajov mRNA
2.Analýza diferenciálnej expresie - graf sopky
3.Anotácia KEGG na stupňoch
4.GO klasifikácia v stupňoch