Redukované zastúpenie bisulfitového sekvenovania (RRBS)
Špecifikácie služby
Platforma: platforma NovaSeq, PE150
Typ knižnice: 200-400bp inzert bisulfitovo upravená DNA knižnica
Stratégia sekvenovania: Paired-End 150 bp
Odporúčaný dátový výstup: 10 Gb nespracovaných dát/vzorka
Vzorové požiadavky
Množstvo DNA: ≥ 2 ug
Koncentrácia DNA: ≥ 20 ng/μl.
Čistota: OD260/280 = 1,8 až 2,0 bez degradácie alebo kontaminácie RNA
Bioinformatická analýza
Tok servisných prác
Doručenie vzorky
Výstavba knižnice
Sekvenovanie
Analýza dát
Popredajné služby
a.Referenčná štatistika zarovnania genómu
Štatistika čítaní máp
Sštatistika hĺbky sekvenovania a pokrytia miesta C
Akumulované krytie
Dúčinnosť trávenia každej vzorky
b.Detekcia miesta metylácie
Zoznam hladín metylácie v mieste C
BS konverzia
Metylovaný cytozín
Distribúcia úrovne metylácie
c.Metylačná mapa
Gcelosvetový
Genome element
d.Porovnanie hladín metylácie medzi vzorkami
Pairwise Korelácia CG metylácie
PCA-CG metylácia
Clesk metylácie CG
d.Diferenciálne metylačná analýza
Sštatistika DMR
Distribúcia dĺžky DMR
Hjesť mapu
DDistribúcia MR v cieľovej oblasti
