BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produkty

Sekvenovanie celého transkriptómu – Illumina

Sekvenovanie celého transkriptómu ponúka komplexný prístup k profilovaniu rôznych molekúl RNA, ktorý zahŕňa kódujúce (mRNA) aj nekódujúce RNA (lncRNA, circRNA a miRNA).Táto technika zachytáva úplný transkriptóm špecifických buniek v danom momente, čo umožňuje holistické pochopenie bunkových procesov.Tiež známy ako „celkové sekvenovanie RNA“ je zameraný na odhalenie zložitých regulačných sietí na úrovni transkriptómu, čo umožňuje hĺbkovú analýzu, ako je napríklad konkurenčná endogénna RNA (ceRNA) a spoločná analýza RNA.Toto predstavuje počiatočný krok smerom k funkčnej charakterizácii, najmä pri odhaľovaní regulačných sietí zahŕňajúcich interakcie ceRNA na báze circRNA-miRNA-mRNA.


Podrobnosti o službe

Bioinformatika

Demo výsledky

Odporúčané publikácie

Vlastnosti

● Duálna knižnica na sekvenovanie kompletného transkriptómu: deplécia rRNA nasledovaná prípravou knižnice PE150 a výberom veľkosti, po ktorej nasleduje príprava knižnice SE50

● Kompletná bioinformatická analýza mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA v samostatných bioinformatických správach

● Spoločná analýza všetkých expresií RNA v kombinovanej správe, vrátane analýzy sietí ceRNA.

Výhody služby

Hĺbková analýza regulačných sietí: Analýza siete ceRNA je umožnená spoločným sekvenovaním mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA a vyčerpávajúcim bioinformatickým pracovným postupom.

Komplexná anotácia: používame viaceré databázy na funkčnú anotáciu diferenciálne vyjadrených génov (DEG) a na vykonanie zodpovedajúcej analýzy obohatenia, ktorá poskytuje pohľad na bunkové a molekulárne procesy, ktoré sú základom transkriptómovej odpovede.

Rozsiahla odbornosť: so záznamom úspešného ukončenia viac ako 2000 celých transkriptómových projektov v rôznych oblastiach výskumu, náš tím prináša do každého projektu bohaté skúsenosti.

Prísna kontrola kvality: implementujeme kľúčové kontrolné body vo všetkých fázach, od prípravy vzorky a knižnice až po sekvenovanie a bioinformatiku.Toto starostlivé monitorovanie zaisťuje neustále vysokokvalitné výsledky.

● Komplexná anotácia: používame viaceré databázy na funkčnú anotáciu diferenciálne vyjadrených génov (DEG) a na vykonanie zodpovedajúcej analýzy obohatenia, ktorá poskytuje pohľad na bunkové a molekulárne procesy, ktoré sú základom transkriptómovej odpovede.

Podpora po predaji: Náš záväzok presahuje dokončenie projektu s 3-mesačným obdobím popredajného servisu.Počas tohto obdobia ponúkame sledovanie projektu, pomoc pri riešení problémov a stretnutia otázok a odpovedí na riešenie akýchkoľvek otázok súvisiacich s výsledkami

Vzorové požiadavky a doručenie

Knižnica

Stratégia sekvenovania

Odporúčané údaje

Kontrola kvality

rRNA vyčerpaná

Illumina PE150

16 Gb

Q30 ≥ 85 %

Zvolená veľkosť

Illumina SE50

10-20 miliónov čítaní

 

Vzorové požiadavky:

Nukleotidy:

Konc. (ng/μl)

množstvo (μg)

Čistota

bezúhonnosť

≥ 100

≥ 1

OD260/280 = 1,7-2,5

OD260/230 = 0,5-2,5

Obmedzená alebo žiadna kontaminácia proteínmi alebo DNA na géli.

Rastliny: RIN≥6,5

Zviera: RIN ≥ 7,0

5,0≥28S/18S≥1,0;

obmedzená alebo žiadna základná elevácia

Odporúčané doručenie vzorky

Nádoba:
2 ml centrifugačná skúmavka (neodporúča sa cínová fólia)
Označenie vzoriek: Skupina+replikácia napr. A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Náklad:
1. Suchý ľad: Vzorky je potrebné zabaliť do vriec a pochovať v suchom ľade.
2. Skúmavky RNAstable: Vzorky RNA možno vysušiť v skúmavke na stabilizáciu RNA (napr. RNAstable®) a odoslať pri izbovej teplote.

Tok servisných prác

Vzorová kontrola kvality

Dizajn experimentu

dodanie vzorky

Doručenie vzorky

Pilotný experiment

Extrakcia RNA

Príprava knižnice

Výstavba knižnice

Sekvenovanie

Sekvenovanie

Analýza dát

Analýza dát

Popredajné služby

Popredajné služby


  • Predchádzajúce:
  • Ďalšie:

  • Bioinformatika

    wps_doc_16

    Prehľad expresie RNA

     图片41

    Rozdielne exprimované gény

    图片42

     

     

    analýza ceRNA

     Číslo 43Diferenciálne exprimované miRNA a príbuzné RNA

    图片44 

     Preskúmajte pokroky vo výskume, ktoré umožňujú služby sekvenovania celého transkriptómu BMKGene prostredníctvom kurátorskej zbierky publikácií.

     

    Dai, Y. a kol.(2022) 'Komplexné profily expresie mRNA, lncRNA a miRNA pri Kashin-Beckovej chorobe identifikovanej pomocou sekvenovania RNA', Molecular Omics, 18 (2), str. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan a kol.(2022) „Analýza úplných transkriptomov odolnosti proti chladu Apis cerana v pohorí Changbai počas obdobia prezimovania.“, Gene, 830, str. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ a kol.(2022) „Uprednostňovanie konkurenčných endogénnych regulačných sietí endogénnej RNA pri malobunkovom karcinóme pľúc na základe integrácie multiomiksov: Molekulárne charakteristiky a kandidáti na lieky“, Frontiers in Oncology, 12, s.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. a kol.(2022) „Integrovaná analýza profilov expresie lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA odhaľuje nové poznatky o potenciálnych mechanizmoch v reakcii na koreňové háďatká v arašidoch“, BMC Genomics, 23 (1), s. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

    Yan, Z. a kol.(2022) „Sekvenovanie celotranskriptómovej RNA zvýrazňuje molekulárne mechanizmy spojené s udržiavaním kvality po zbere brokolice pomocou ožiarenia červenou LED“, Postharvest Biology and Technology, 188, s.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    dostat ponuku

    Tu napíšte svoju správu a pošlite nám ju

    Pošlite nám svoju správu: