Celoten genom bakterije
Prednosti storitve
● Za različne raziskovalne cilje je na voljo več strategij zaporedja
● Popoln genom bakterij z zajamčeno vrzeljo 0.
● Veliko izkušenj pri sestavljanju bakterijskega genoma z več kot 10.000 sestavljenimi popolnimi genomi.
● Strokovna ekipa za tehnično podporo po prodaji, ki izpolnjuje bolj specifične raziskovalne potrebe.
Specifikacije storitve
| ZaporedjeStrategija | Knjižnica | Zagotovljena kakovost | Predviden čas obračanja |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 vrzel | 30 dni |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformatske analize
● Nadzor kakovosti neobdelanih podatkov
● Sestavljanje genoma
● Analiza komponent genoma
● Opomba o funkciji gena
● Primerjalna genomska analiza
Zahteve za vzorce in dostava
Vzorčne zahteve:
Zaizvlečki DNK:
| Vrsta vzorca | Znesek | koncentracija | Čistost |
| izvlečki DNK | > 2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Za vzorce tkiva:
| Vrsta vzorca | Priporočena obravnava vzorca | Shranjevanje in pošiljanje vzorcev |
| Bakterije | Opazujte bakterije pod mikroskopom in zberite bakterije v njihovi eksponentni fazi Prenesite bakterijsko kulturo (ki vsebuje približno 3-4,5e9 celic) v 1,5 ali 2 ml eppendorf.(Ohrani na ledu) Centrifugirajte epruveto 1 minuto pri 14000 g, da zberete bakterije in previdno odstranite supernatant Zaprite epruveto in zamrznite bakterije v tekočem dušiku za vsaj 30 minut.Epruveto shranjujte v hladilniku -80 ℃. | Zamrznite vzorce v tekočem dušiku za 3-4 ure in jih shranite v tekočem dušiku ali -80 stopinj za dolgoročno rezervacijo.Zahtevano je pošiljanje vzorcev s suhim ledom. |
Potek storitvenega dela
Dostava vzorcev
Gradnja knjižnice
Zaporedje
Analiza podatkov
Poprodajne storitve
1. Circos bakterijskega genoma
2. Napoved kodiranja gena
3.Primerjalna genomska analiza: filogenetsko drevo
