BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

BMKMANU S1000 prostorski transkriptom

Prostorska organizacija celic ima ključno vlogo pri različnih bioloških procesih, kot je imunska infiltracija, razvoj zarodkov itd. Prostorsko sekvenciranje transkriptoma, ki kaže na profiliranje genske ekspresije ob ohranjanju informacij o prostorskem položaju, je zagotovilo odličen vpogled v arhitekturo tkiva na ravni transkriptoma.Z razvojem tehnologije je treba ultra-jasno morfologijo tkiva in resnično strukturno razliko prostorske molekularne ekspresije preučiti z višjo ločljivostjo.BMKGENE zagotavlja celovito storitev sekvenciranja prostorskega transkriptoma na enem mestu od vzorcev do bioloških vpogledov.

Tehnologije prostorske transkriptomike so okrepile nove perspektive v različnih raziskovalnih arenah z razrešitvijo profila genskega izražanja s prostorsko vsebino v heterogenih vzorcih.

Čip prostorskega transkriptoma: BMKMANU S1000

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Tehnična shema prostorskega transkriptoma BMKMANU S1000

S1000.

Prednosti BMKMANU S1000

1) Podcelična ločljivost: Vsako območje zajema je vsebovalo > 2 milijona prostorskih črtno kodiranih točk s premerom 2,5 µm in razmikom 5 µm med središči točk, kar je omogočilo analizo prostorskega transkriptoma s podcelično ločljivostjo (5 µm).

s1000 (1)

2) Večnivojska analiza ločljivosti: Prilagodljiva večnivojska analiza v razponu od 100 μm do 5 μm za razrešitev različnih značilnosti tkiva pri optimalni ločljivosti.

s1000 (2)

3) Celovito profiliranje transkriptoma: Analizirati je mogoče transkripte, zajete iz celotnega tkivnega preparata, brez omejitev glede števila ciljnih genov in ciljnega območja.

s1000 (3)

Specifikacije storitve

Knjižnica

Strategija zaporedja

Priporočen izhod podatkov

Knjižnica cDNA S1000

BMKMANU S1000-Illumina PE150

60 Gb/vzorec

Vzorčne zahteve

Vzorec

številka

Velikost

Kakovost RNA

OCT vgrajen tkivni blok

2-3 bloki/vzorec

Pribl.6,8x6,8x6,8 mm3

RIN≥7

Za več podrobnosti o navodilih za pripravo vzorcev in poteku storitev se obrnite na a

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Predposkus

Prostorsko črtno kodiranje

Prostorsko črtno kodiranje

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • 10x (9)

    Podatki, ki jih ustvari BMKMANU S1000, se analizirajo s programsko opremo "BSTMatrix", ki jo je neodvisno oblikoval BMKGENE, vključno z:

    1) Generiranje matrike za izražanje genov
    2) HE obdelava slike
    3) Združljivo z nadaljnjo programsko opremo tretjih oseb za analizo
    4) Spletni »BSTViewer« pomaga pridobiti rezultate vizualizacije pri različnih ločljivostih.

    1.Točkovno združevanje

    s1000 (4)

    2.Prostorska razporeditev

    s1000 (5)s1000 (6)

    Note: Resolucijaraven=13 (100 µm, levo); 7 (50 µm, prav)

    3.Toplotni zemljevid gručenja številčnosti izraza označevalca

    s1000 (7)

    4. Analiza podatkov med vzorci

    s1000 (8)

     

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: