BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

sekvenciranje circRNA-Illumina

Sekvenciranje krožne RNA (circRNA-seq) je namenjeno profiliranju in analizi krožnih RNA, razreda molekul RNA, ki tvorijo zaprte zanke zaradi nekanoničnih dogodkov spajanja, kar tej RNA zagotavlja povečano stabilnost.Medtem ko je bilo dokazano, da nekatere circRNA delujejo kot spužve mikroRNA, sekvestrirajo mikroRNA in jim preprečujejo uravnavanje njihovih ciljnih mRNA, lahko druge circRNA interagirajo z beljakovinami, modulirajo izražanje genov ali imajo vlogo v celičnih procesih.analiza ekspresije circRNA zagotavlja vpogled v regulativne vloge teh molekul in njihov pomen v različnih celičnih procesih, razvojnih stopnjah in boleznih, kar prispeva k globljemu razumevanju kompleksnosti regulacije RNA v kontekstu izražanja genov.


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Predstavljene publikacije

Lastnosti

● Izčrpanost rRNA, ki ji sledi priprava usmerjene knjižnice, kar omogoča podatke o zaporedju, ki so specifični za verigo.

● Bioinformacijski potek dela omogoča napovedovanje circRNA in kvantifikacijo izražanja

 

Prednosti storitve

Bolj obsežne knjižnice RNA:v naši pripravi pred knjižnico uporabljamo deplecijo rRNA namesto linearne deplecije RNA, kar zagotavlja, da podatki o zaporedju ne vključujejo samo circRNA, ampak tudi mRNA in lncRNA, kar omogoča skupno analizo teh nizov podatkov

Izbirna analiza konkurenčnih endogenih mrež RNA (ceRNA).: zagotavljanje globljega vpogleda v celične regulacijske mehanizme

Obsežno strokovno znanje: z zgodovino obdelave več kot 20.000 vzorcev pri BMK, ki obsegajo različne vrste vzorcev in projekte lncRNA, naša ekipa v vsak projekt vnese bogate izkušnje.

Stroga kontrola kakovosti: izvajamo ključne kontrolne točke v vseh fazah, od priprave vzorca in knjižnice do sekvenciranja in bioinformatike.To natančno spremljanje zagotavlja zagotavljanje dosledno visokokakovostnih rezultatov.

● Poprodajna podpora: Naša zaveza sega preko zaključka projekta s 3-mesečnim obdobjem poprodajnih storitev.V tem času nudimo spremljanje projekta, pomoč pri odpravljanju težav in srečanja z vprašanji in odgovori za obravnavo kakršnih koli vprašanj v zvezi z rezultati.

Zahteve za vzorce in dostava

Knjižnica

Platforma

Priporočeni podatki

QC podatkov

Poly A obogaten

Ilumina PE150

16-20 Gb

Q30≥85 %

Vzorčne zahteve:

Nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistost

Integriteta

≥ 100

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na gelu je prikazana omejena ali nikakršna kontaminacija beljakovin ali DNK.

Za rastline: RIN≥6,5;

Za živali: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

omejena ali brez osnovne višine

● Rastline:

Korenina, steblo ali cvetni list: 450 mg

List ali seme: 300 mg

Sadje: 1,2 g

● Žival:

Srce ali črevesje: 450 mg

Notranje telo ali možgani: 240 mg

Mišice: 600 mg

Kosti, lasje ali koža: 1,5 g

● Členonožci:

Insekti: 9g

Raki: 450 mg

● Polna kri:2 cevi

● Celice: 106 celice

● Serum in plazma: 6 ml

Priporočena dostava vzorcev

Vsebnik: 2 ml centrifugalna epruveta (kositrna folija ni priporočljiva)

Označevanje vzorca: skupina + ponovitev, npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

Pošiljka:

1. Suhi led: Vzorce je treba zapakirati v vrečke in zakopati v suhi led.

2. RNAstable epruvete: vzorce RNA lahko posušite v RNA stabilizacijski epruveti (npr. RNAstable®) in pošljete pri sobni temperaturi.

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Ekstrakcija RNA

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Priprava knjižnice

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • Bioinformatika

    wps_doc_15

    napoved circRNA: kromosomska porazdelitev

     图片36

     

    Diferencialno izražene circRNA – graf vulkana

     图片37

     

    Diferencialno izražene circRNA – hierarhično združevanje

     图片38

     

    Funkcionalna obogatitev gostiteljskih genov circRNA

     图片39

     

     

    Raziščite raziskovalni napredek, ki ga omogočajo storitve sekvenciranja circRNA BMKGene prek izbrane zbirke publikacij.

     

    Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 uravnava tvorbo circRNA in utišanje genov, posredovano z mikroRNA, pri hepatocelularnem karcinomu', Oncogene 2021 40:25, 40(25), str. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.

    Xia, K. et al.(2023) 'X oo-odzivni transkriptom razkriva vlogo krožne RNA133 pri odpornosti proti boleznim z uravnavanjem izražanja OsARAB v rižu', Phytopathology Research, 5(1), str. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/SLIKE/6.

    Y, H. et al.(2023) 'CPSF3 modulira ravnotežje krožnih in linearnih transkriptov v hepatocelularnem karcinomu'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.

    Zhang, Y. et al.(2023) "Celovita ocena circRNA pri cirozni kardiomiopatiji pred in po presaditvi jeter", Mednarodna imunofarmakologija, 114, str.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: