BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Ilumina in BGI

Tehnologija sekvenciranja Illumina, ki temelji na Sekvenciranju s sintezo (SBS), je globalno sprejeta inovacija NGS, odgovorna za generiranje več kot 90 % podatkov o sekvenciranju na svetu.Načelo SBS vključuje slikanje fluorescentno označenih reverzibilnih terminatorjev, ko je vsak dNTP dodan in nato cepljen, da se omogoči vključitev naslednje baze.Z vsemi štirimi reverzibilnimi dNTP-ji, vezanimi na terminator, ki so prisotni v vsakem ciklu zaporedja, naravna konkurenca zmanjša pristranskost vključevanja.Ta vsestranska tehnologija podpira knjižnice z enim branjem in seznanjene knjižnice, ki skrbijo za vrsto genomskih aplikacij.Visoko zmogljive zmogljivosti in natančnost sekvenciranja Illumina ga postavljajo kot temelj v raziskavah genomike, ki znanstvenikom omogoča, da razkrijejo zapletenost genomov z neprekosljivimi podrobnostmi in učinkovitostjo.

DNBSEQ, ki ga je razvil BGI, je še ena inovativna tehnologija NGS, ki ji je uspelo dodatno znižati stroške zaporedja in povečati prepustnost.Priprava knjižnic DNBSEQ vključuje fragmentacijo DNA, pripravo ssDNA in pomnoževanje kotalnega kroga, da dobimo nanokroglice DNA (DNB).Ti se nato naložijo na trdno površino in nato sekvencirajo s kombinatorično sintezo sonde-sidra (cPAS).

Naša vnaprej pripravljena storitev sekvenciranja knjižnic olajša strankam pripravo njihovih knjižnic sekvenciranja iz različnih virov (mRNA, celoten genom, amplikon, med drugim).Kasneje lahko te knjižnice pošljemo v naše centre za sekvenciranje za nadzor kakovosti in sekvenciranje na platformah Illumina ali BGI.


Podrobnosti storitve

Demo rezultat

Lastnosti

Platforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten in BGI-DNB-T7

Načini zaporedja:PE50, PE100, PE150, PE250

Kontrola kakovosti knjižnic pred sekvenciranjem

Zaporedje dostave podatkov in QC:dostava poročila QC in neobdelanih podatkov v formatu fastq po demultipleksiranju in filtriranju odčitkov Q30.

 

Prednosti storitve

Vsestranskost storitev sekvenciranja:stranka se lahko odloči za zaporedje po pasu, pretočni celici ali količini podatkov.

Vsestranskost platform:Knjižnice DNB je mogoče prenesti na platforme Illumina

Bogate izkušnje na platformi za sekvenciranje Illumina:s tisoči zaprtih projektov z različnimi vrstami. 

Dostava poročila o sekvenciranju QC:z merili kakovosti, točnostjo podatkov in splošno uspešnostjo projekta zaporedja.

Proces zrelega zaporedja:s kratkim časom obračanja.

Stroga kontrola kakovosti: izvajamo stroge zahteve QC, da zagotovimo zagotavljanje dosledno visokokakovostnih rezultatov.

Vzorčne zahteve*

Delno zaporedje voznih pasov

Količina podatkov (X)

Koncentracija (qPCR/nM)

Glasnost

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Single Lane (Illumina)

Platforma

Koncentracija (qPCR/nM)

Glasnost

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Poleg koncentracije in skupne količine je potreben tudi ustrezen vzorec vrhov.

 

Obrnite se na nas, če vaši vzorci ne izpolnjujejo zahtev glede vhodnega materiala.

Potek dela storitve

priprava vzorca

Kontrola kakovosti knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Nadzor kakovosti podatkov

Vzorec QC

Izvedba projekta


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • Poročilo knjižnice QC

    Poročilo o kakovosti knjižnice je zagotovljeno pred zaporedjem, oceno količine knjižnice in razdrobljenosti.

     

    Poročilo o zaporedju QC

     

    Tabela 1. Statistika podatkov o zaporedju.

    ID vzorca

    BMKID

    Surovo bere

    Neobdelani podatki (bp)

    Čisto branje (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Slika 1. Porazdelitev kakovosti vzdolž odčitkov v vsakem vzorcu

    A9

    Slika 2. Porazdelitev osnovne vsebine

    A10

    Slika 3. Porazdelitev prebranih vsebin v podatkih zaporedja

    A11

     

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: