page_head_bg

Izdelki

Zaporedje evkariontske mRNA - Illumina

Zaporedje mRNA omogoča profiliranje vseh mRNA, prepisanih iz celic pod specifičnimi pogoji.Je zmogljiva tehnologija za razkrivanje profila genske ekspresije, genskih struktur in molekularnih mehanizmov nekaterih bioloških procesov.Do danes se je sekvenciranje mRNA široko uporabljalo v temeljnih raziskavah, klinični diagnostiki, razvoju zdravil itd.

Platforma: Illumina NovaSeq 6000


Podrobnosti o storitvi

Bioinformatika

Demo rezultati

Prednosti

ØVisoko izkušeni: V BMK je bilo obdelanih več kot 200.000 vzorcev, ki pokrivajo različne vrste vzorcev, vključno s celično kulturo, tkivom, telesnimi tekočinami itd. in več kot 7.000 projektov mRNA-Seq, zaprtih, ki pokrivajo različna raziskovalna področja.

ØStrogi sistem nadzora kakovosti: osrednje kontrolne točke kakovosti skozi vse korake, vključno s pripravo vzorcev, pripravo knjižnice, sekvenciranjem in bioinformatiko, so pod strogim nadzorom, da se zagotovijo visokokakovostni rezultati.

ØZa izpolnjevanje različnih raziskovalnih ciljev je na voljo več baz podatkov za označevanje funkcij in študije obogatitve.

ØPoprodajne storitve: Poprodajne storitve veljajo 3 mesece po zaključku projekta, vključno s spremljanjem projektov, odpravljanjem težav, vprašanji in odgovori o rezultatih itd.

Zahteve za vzorce in dostava

Knjižnica Strategija zaporedja Priporočeni podatki Nadzor kakovosti
Poly A obogaten Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Vzorčne zahteve:

nukleotidi:

Čistost Integriteta Znesek
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Omejena ali brez kontaminacije z beljakovinami ali DNK na gelu. Za rastline: RIN≥6,5;Za živali: RIN≥7;28S/18S≥1,0; omejena ali brez izhodiščne višine Konc.≥30 ng/μl;Prostornina ≥ 10 μl;Skupaj ≥ 1,5 μg

Tkivo: Teža (suho):≥1 g
*Za tkiva, manjša od 5 mg, priporočamo, da pošljete bliskovito zamrznjen (v tekočem dušiku) vzorec tkiva.

celična suspenzija:Število celic = 3×106- 1×107
*Priporočamo pošiljanje zamrznjenega celičnega lizata.V primeru, da je število celic manjše od 5×105, je priporočljivo hitro zamrzniti v tekočem dušiku, kar je prednostno za mikro ekstrakcijo.

Vzorci krvi:Volumen≥1 ml

mikroorganizem:Masa ≥ 1 g

Priporočena dostava vzorca

Posoda: 2 ml epruvete za centrifugiranje (kositrena folija ni priporočljiva)

Označevanje vzorca: Skupina + ponovitev, npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

pošiljka:

  1. Suhi led: Vzorce je treba zapakirati v vrečke in zakopati v suh led.
  2. RNA stabilne cevi: vzorce RNA lahko posušite v RNA stabilizacijski cevi (npr. RNAstable®) in jih pošljete pri sobni temperaturi.

Potek dela storitve

logo_01

Oblikovanje eksperimentov

logo_02

Dostava vzorca

logo_03

Ekstrakcija RNA

logo_04

Gradnja knjižnice

logo_05

Zaporedje

logo_06

Analiza podatkov

logo_07

Poprodajne storitve


  • Prejšnji:
  • Naslednji:

  • Bioinformatika

    2(1)

    evkariontski potek dela analize sekvenciranja mRNA

    Bioinformatika

    ØNadzor kakovosti neobdelanih podatkov

    ØReferenčna poravnava genoma

    ØAnaliza strukture transkripta

    ØKvantifikacija izraza

    ØAnaliza diferencialnih izrazov

    ØZapis in obogatitev funkcij

    1.Krivulja nasičenosti podatkov mRNA

    3(1)

    2.Analiza diferencialnih izrazov-Vulkanski graf

    4(1)

    3.Zapis KEGG na DEG

    5(1)

    4.GO klasifikacija na DEG

    6(1)

    dobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: