BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Sekvenciranje evkariontske mRNA-Illumina

Sekvenciranje mRNA omogoča profiliranje vseh mRNA, prepisanih iz celic pod določenimi pogoji.Je zmogljiva tehnologija za razkrivanje profila izražanja genov, strukture genov in molekularnih mehanizmov določenih bioloških procesov.Do danes se je sekvenciranje mRNA široko uporabljalo v temeljnih raziskavah, klinični diagnostiki, razvoju zdravil itd.

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Prednosti

● Visoko izkušen: več kot 200.000 vzorcev je bilo obdelanih v BMK, ki pokrivajo različne vrste vzorcev, vključno s celično kulturo, tkivom, telesnimi tekočinami itd., in več kot 7.000 projektov mRNA-Seq je bilo zaključenih in so pokrivali različna raziskovalna področja.

● Strog sistem nadzora kakovosti: ključne točke nadzora kakovosti skozi vse korake, vključno s pripravo vzorcev, pripravo knjižnice, zaporedjem in bioinformatiko, so pod strogim nadzorom, da se zagotovijo visokokakovostni rezultati.

● Na voljo je več zbirk podatkov za opombe funkcij in študije obogatitve za izpolnjevanje različnih raziskovalnih ciljev.

● Poprodajne storitve: Poprodajne storitve, ki veljajo 3 mesece po zaključku projekta, vključno s spremljanjem projekta, odpravljanjem težav, rezultati vprašanj in odgovorov itd.

Zahteve za vzorce in dostava

Knjižnica Strategija zaporedja Priporočeni podatki Kontrola kakovosti
Poly A obogaten Ilumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Vzorčne zahteve:

Nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistost

Integriteta

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na gelu je prikazana omejena ali nikakršna kontaminacija beljakovin ali DNK.

Za rastline: RIN≥6,5;

Za živali: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

omejena ali brez osnovne višine

Tkivo: Teža (suho):≥1 g
*Za tkivo, manjše od 5 mg, priporočamo pošiljanje hitro zamrznjenega (v tekočem dušiku) vzorca tkiva.

Suspenzija celic:Število celic = 3×106- 1×107
*Priporočamo pošiljanje zamrznjenega celičnega lizata.V primeru, da je ta celica manjša od 5×105.

Vzorci krvi:Volumen≥1 ml

Mikroorganizem:Masa ≥ 1 g

Priporočena dostava vzorcev

Vsebnik: 2 ml centrifugalna epruveta (kositrna folija ni priporočljiva)

Označevanje vzorca: skupina + ponovitev, npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

Pošiljka:

  1. Suhi led: Vzorce je treba zapakirati v vrečke in zakopati v suhi led.
  2. Epruvete RNAstable: vzorce RNA lahko posušite v epruveti za stabilizacijo RNA (npr. RNAstable®) in jih pošljete pri sobni temperaturi.

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Ekstrakcija RNA

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    evkariontski Potek dela analize sekvenciranja mRNA

    Bioinformatika

    ØNadzor kakovosti neobdelanih podatkov

    ØPoravnava referenčnega genoma

    ØAnaliza strukture transkripta

    ØKvantifikacija izražanja

    ØAnaliza diferencialnih izrazov

    ØAnotacija in obogatitev funkcij

    1.Krivulja nasičenosti podatkov mRNA

    3(1)

    2.Analiza diferencialnih izrazov - graf vulkana

    4(1)

    3.Opomba KEGG na DEG

    5(1)

    4.Razvrstitev GO na DEG

    6(1)

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: