BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Asociacijska analiza celotnega genoma

Cilj genomske asociacijske študije (GWAS) je identificirati genetske različice (genotip), ki so povezane s posebnimi lastnostmi (fenotip).Študija GWAS raziskuje genetske označevalce, ki prečkajo celoten genom velikega števila posameznikov in s statistično analizo na ravni populacije napoveduje povezave genotipa in fenotipa.Široko se uporablja v raziskavah človeških bolezni in funkcionalnem genskem rudarjenju kompleksnih lastnosti živali ali rastlin.


Podrobnosti storitve

Demo rezultat

Predstavljena publikacija

slika3

1.Service Prednosti

● Številni primeri projektov: od svoje ustanovitve leta 2009 je BMKGENE zaključil na stotine projektov vrst v populacijskih raziskavah GWAS, pomagal raziskovalcem pri objavi več kot 100 člankov, kumulativni faktor vpliva pa je dosegel 500.
● Profesionalni analitiki.
● Kratek cikel analize.
● Natančno rudarjenje podatkov.

2. Specifikacije storitve

Vrsta

Lestvica prebivalstva

Strategija zaporedja in globina

SLAF-GWAS Število vzorcev ≥200 Velikost genoma < 400M, z ref-genomom, priporočamo WGS

Velikost genoma ≤ 1G, 100K oznak in 10X

1G ≤ velikost genoma ≤ 2G, 200K oznak in 10X

Velikost genoma > 2G, 300K oznak in 10X

WGS-GWAS

Število vzorcev ≥200

10X za vsak vzorec

3. Izbira materiala

动物1
动物2
slika7

Različne sorte, podvrste, domače sorte/genske banke/mešane družine/divji viri

Različne sorte, podvrste, domače sorte

Družina s polsorojenci/družina s polnimi sorodniki/divji viri

4. Bioinformacijska analiza

● Analiza povezav celotnega genoma
● Analiza in presejanje pomembnih SNP
● Funkcionalna oznaka kandidata za gen

5. Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Ekstrakcija RNA

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • a.Fenotip QC

    Histogram frekvenčne porazdelitve

    slika9

    Statistika fenotipa

    slika10

    b.Analiza povezav (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    QQ Plot

    slika11

    Manhattanska parcela

    Amoniak_emmax_manhattan_00

    leto

    Dnevnik

    IF

    Naslov

    2022

    NC

    17.69

    Genomska osnova gigakromosomov in gigagenoma drevesne potonike Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Odtisi udomačitve zasidrajo genomske regije agronomskega pomena v soji

    2018

    MP

    9.32

    Ponovno zaporedje celotnega genoma svetovne zbirke pristopov oljne ogrščice razkriva genetsko osnovo njihove ekotipske divergence

    2022

    HR

    7.29

    Analiza asociacij na celotnem genomu zagotavlja molekularni vpogled v naravno variacijo velikosti semena lubenice

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: