BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Sekvenciranje enojedrne RNA

Napredek pri zajemanju posamezne celice in tehniki gradnje posamezne knjižnice v kombinaciji z visoko zmogljivim sekvenciranjem omogoča študije izražanja genov na podlagi celice za celico.Omogoča globljo in popolno sistemsko analizo na kompleksnih celičnih populacijah, pri čemer se v veliki meri izogne ​​maskiranju njihove heterogenosti z jemanjem povprečja vseh celic.

Nekatere celice pa niso primerne za pripravo enocelične suspenzije, zato so potrebne druge metode priprave vzorcev – ekstrakcija jedra iz tkiv, to pomeni, da se jedro ekstrahira neposredno iz tkiva ali celice in se pripravi v enojedrno suspenzijo za enojedrno suspenzijo. sekvenciranje celic.

BMK zagotavlja 10× storitev zaporedja enocelične RNA na podlagi Genomics ChromiumTM.Ta storitev se pogosto uporablja v študijah o študijah, povezanih z boleznijo, kot je diferenciacija imunskih celic, heterogenost tumorja, razvoj tkiva itd.

Čip prostorskega transkriptoma: 10 × Genomics

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Tehnični princip

Izolacijo jeder doseže 10× Genomics ChromiumTM, ki je sestavljen iz osemkanalnega mikrofluidnega sistema z dvojnimi križišči.V tem sistemu so kroglice gela s črtnimi kodami in temeljnim premazom, encimi in eno samo jedro vkapsulirane v kapljico olja v velikosti nanolitra, kar ustvarja gelsko kroglico v emulziji (GEM).Ko se GEM oblikuje, se v vsakem GEM izvede celična liza in sprostitev črtnih kod.mRNA se reverzno prepiše v molekule cDNA s črtnimi kodami 10 × in UMI, ki so nadalje predmet standardne konstrukcije knjižnice sekvenciranja.

wps_doc_0
wps_doc_1

Tkivo ni primerno za pripravo suspenzije posameznih celic

Celica / tkivo

Razlog

Nesveže zamrznjeno tkivo

Ni mogoče pridobiti svežih ali dolgo shranjenih organizacij

Mišična celica, megakariocit, maščoba…

Premer celice je prevelik za vstop v instrument

Jetra…

Preveč krhka, da bi se zlomila, ne more razlikovati posameznih celic

Nevronska celica, možgani…

Bolj občutljiv, enostaven za stres, bo spremenil rezultate zaporedja

Trebušna slinavka, ščitnica…

Bogat z endogenimi encimi, ki vplivajo na proizvodnjo suspenzije posameznih celic

Enojedren vs enocelični

Enojedren

Enocelični

Neomejen premer celice

Premer celice: 10-40 μm

Material je lahko zamrznjeno tkivo

Material mora biti sveže tkivo

Nizek stres zamrznjenih celic

Zdravljenje z encimi lahko povzroči celično stresno reakcijo

Rdečih krvničk ni treba odstraniti

Rdeče krvničke je treba odstraniti

Jedro izraža bioinformacijo

Celotna celica izraža bioinformacijo

Specifikacije storitve

Knjižnica

Strategija zaporedja

Obseg podatkov

Vzorčne zahteve

Tkivo

10× Genomics enojedrna knjižnica

10x Genomics -Illumina PE150

100.000 branj/celico pribl.100-200 Gb

Število celic: >2 × 105

Celična konc.pri 700-1.200 celic/μL

≥ 200 mg

Za več podrobnosti o navodilih za pripravo vzorcev in poteku storitev se obrnite na a

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

jedrsko.suspenzija

Izolacija jeder

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • wps_doc_9

    1.Točkovno združevanje

    wps_doc_10

    2.Toplotni zemljevid gručenja številčnosti izraza označevalca

    wps_doc_113.Maker distribucijo genov v različnih grozdih

    wps_doc_12

    4. Analiza trajektorije celice/psevdočas

    wps_doc_13

     

     

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: