BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Sekvenciranje majhne RNA-Illumina

Majhne molekule RNA (sRNA), običajno dolge pod 200 nukleotidov, vključujejo mikroRNA (miRNA), majhne moteče RNA (siRNA) in RNA, ki delujejo s piwi (piRNA).Med temi so miRNA, dolge približno 20-24 nukleotidov, še posebej omembe vredne zaradi svojih ključnih regulativnih vlog v različnih celičnih procesih.S tkivno specifičnimi in fazno specifičnimi vzorci izražanja miRNA kažejo visoko ohranjenost pri različnih vrstah.

Platforma: Illumina NovaSeq


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Predstavljene publikacije

Lastnosti

● Izbira velikosti RNA pred pripravo knjižnice

● Bioinformatska analiza, osredotočena na napoved miRNA in njihovih ciljev

Prednosti storitve

Celovita bioinformatska analiza:omogoča identifikacijo znanih in novih miRNA, identifikacijo tarč miRNA in ustrezno funkcionalno opombo ter obogatitev z več bazami podatkov (KEGG, GO)

Stroga kontrola kakovosti: izvajamo ključne kontrolne točke v vseh fazah, od priprave vzorca in knjižnice do sekvenciranja in bioinformatike.To natančno spremljanje zagotavlja zagotavljanje dosledno visokokakovostnih rezultatov.

Poprodajna podpora: Naša zaveza sega preko zaključka projekta s 3-mesečnim obdobjem poprodajnih storitev.V tem času nudimo spremljanje projekta, pomoč pri odpravljanju težav in srečanja z vprašanji in odgovori za obravnavo kakršnih koli vprašanj v zvezi z rezultati.

Obsežno strokovno znanje: z zgodovino uspešnih zaključkov več projektov sRNA, ki pokrivajo več kot 100 vrst na različnih raziskovalnih področjih, naša ekipa v vsak projekt vnaša bogate izkušnje.

Zahteve za vzorce in dostava

Knjižnica

Platforma

Priporočeni podatki

QC podatkov

Izbrana velikost

Ilumina SE50

10M-20M branja

Q30≥85%

Vzorčne zahteve:

Nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistost

Integriteta

≥ 80

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na gelu je prikazana omejena ali nikakršna kontaminacija beljakovin ali DNK.

RIN≥6,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

omejena ali brez osnovne višine

● Rastline:

Korenina, steblo ali cvetni list: 450 mg

List ali seme: 300 mg

Sadje: 1,2 g

● Žival:

Srce ali črevesje: 450 mg

Notranje telo ali možgani: 240 mg

Mišice: 600 mg

Kosti, lasje ali koža: 1,5 g

● Členonožci:

Insekti: 9g

Raki: 450 mg

● Polna kri: 2 cevi

● Celice: 106 celice

● Serum in plazma:6 ml

Priporočena dostava vzorcev

Vsebnik:
2 ml centrifugalna epruveta (kositrna folija ni priporočljiva)
Označevanje vzorca: skupina + ponovitev, npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

Pošiljka:
1. Suhi led: Vzorce je treba zapakirati v vrečke in zakopati v suhi led.
2. Epruvete stabilne RNA: vzorce RNA lahko posušite v epruveti za stabilizacijo RNA (npr. RNAstable®) in jih pošljete pri sobni temperaturi.

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Ekstrakcija RNA

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • Bioinformatika

    wps_doc_14

    Identifikacija miRNA: struktura in globina

     

     

     miRNA-prekurzor-struktura-in-globina-sekvenciranja

     

    Diferencialna ekspresija miRNA – hierarhično združevanje

    图片34

     

    Funkcionalna oznaka tarče različno izraženih miRNA

    图片35

    Raziščite raziskovalni napredek, ki ga omogočajo storitve sekvenciranja sRNA BMKGene prek izbrane zbirke publikacij.

      

    Chen, H. et al.(2023) „Virusne okužbe zavirajo biosintezo saponinov in fotosintezo v Panax notoginseng“, Plant Physiology and Biochemistry, 203, str.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.

    Li, H. et al.(2023) 'Protein FREE1, ki vsebuje rastlinsko domeno FYVE, se povezuje s komponentami mikroprocesorjev za zatiranje biogeneze miRNA', poroča EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.

    Yu, J. et al.(2023) 'MikroRNA Ame-Bantam-3p nadzoruje razvoj mladičev ličink z usmerjanjem na več genov, podobnih epidermalnemu rastnemu faktorju 8 (megf8) pri medonosni čebeli, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), str. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.

    Zhang, M. et al.(2018) 'Integrirana analiza MiRNA in genov, povezanih s kakovostjo mesa, razkriva, da Gga-MiR-140-5p vpliva na intramuskularno odlaganje maščobe pri piščancih', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), str. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: