BMKCloud Log in
条形banner-03

Izdelki

Sekvenciranje celotnega transkriptoma – Illumina

Sekvenciranje celotnega transkriptoma ponuja celovit pristop k profiliranju različnih molekul RNA, ki zajema tako kodirne (mRNA) kot nekodirajoče RNA (lncRNA, circRNA in miRNA).Ta tehnika zajame celoten transkriptom specifičnih celic v danem trenutku, kar omogoča celostno razumevanje celičnih procesov.Znano tudi kot »totalno sekvenciranje RNA«, želi razkriti zapletena regulativna omrežja na ravni transkriptoma, kar omogoča poglobljeno analizo, kot je konkurenčna endogena RNA (ceRNA) in skupna analiza RNA.To označuje začetni korak k funkcionalni karakterizaciji, zlasti pri razkrivanju regulativnih mrež, ki vključujejo interakcije ceRNA na osnovi circRNA-miRNA-mRNA.


Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Predstavljene publikacije

Lastnosti

● Dvojna knjižnica za zaporedje celotnega transkriptoma: izčrpanost rRNA, ki ji sledi priprava knjižnice PE150 in izbira velikosti, ki ji sledi priprava knjižnice SE50

● Popolna bioinformatska analiza mRNA, lncRNA, circRNA in miRNA v ločenih bioinformatičnih poročilih

● Skupna analiza vse ekspresije RNA v kombiniranem poročilu, vključno z analizo omrežij ceRNA.

Prednosti storitve

Poglobljena analiza regulativnih omrežij: analiza mreže ceRNA je omogočena s skupnim sekvenciranjem mRNA, lncRNA, circRNA in miRNA ter z izčrpnim bioinformacijskim potekom dela.

Izčrpna pripomba: uporabljamo več baz podatkov za funkcionalno označevanje diferencialno izraženih genov (DEG) in izvedbo ustrezne obogatitvene analize, ki zagotavlja vpogled v celične in molekularne procese, na katerih temelji odziv transkriptoma.

Obsežno strokovno znanje: z zgodovino uspešnih zaključkov več kot 2000 projektov celotnega transkriptoma na različnih raziskovalnih področjih naša ekipa v vsak projekt vnaša bogate izkušnje.

Stroga kontrola kakovosti: izvajamo ključne kontrolne točke v vseh fazah, od priprave vzorca in knjižnice do sekvenciranja in bioinformatike.To natančno spremljanje zagotavlja zagotavljanje dosledno visokokakovostnih rezultatov.

● Izčrpna opomba: uporabljamo več baz podatkov za funkcionalno označevanje diferencialno izraženih genov (DEG) in izvedbo ustrezne obogatitvene analize, ki zagotavlja vpogled v celične in molekularne procese, na katerih temelji odziv transkriptoma.

Poprodajna podpora: Naša zaveza sega preko zaključka projekta s 3-mesečnim obdobjem poprodajnih storitev.V tem času nudimo spremljanje projekta, pomoč pri odpravljanju težav in srečanja z vprašanji in odgovori za obravnavo kakršnih koli vprašanj v zvezi z rezultati

Zahteve za vzorce in dostava

Knjižnica

Strategija zaporedja

Priporočeni podatki

Kontrola kakovosti

rRNA osiromašena

Ilumina PE150

16 Gb

Q30≥85 %

Izbrana velikost

Ilumina SE50

10-20M branja

 

Vzorčne zahteve:

Nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistost

Integriteta

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na gelu je prikazana omejena ali nikakršna kontaminacija beljakovin ali DNK.

Rastline: RIN≥6,5

Žival: RIN≥7,0

5,0≥28S/18S≥1,0;

omejena ali brez osnovne višine

Priporočena dostava vzorcev

Vsebnik:
2 ml centrifugalna epruveta (kositrna folija ni priporočljiva)
Označevanje vzorca: skupina + ponovitev, npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

Pošiljka:
1. Suhi led: Vzorce je treba zapakirati v vrečke in zakopati v suhi led.
2. Epruvete stabilne RNA: vzorce RNA lahko posušite v epruveti za stabilizacijo RNA (npr. RNAstable®) in jih pošljete pri sobni temperaturi.

Potek storitvenega dela

Vzorec QC

Oblikovanje eksperimenta

dostava vzorca

Dostava vzorcev

Pilotni poskus

Ekstrakcija RNA

Priprava knjižnice

Gradnja knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Analiza podatkov

Poprodajne storitve

Poprodajne storitve


  • Prejšnja:
  • Naslednji:

  • Bioinformatika

    wps_doc_16

    Pregled ekspresije RNA

     图片41

    Diferencialno izraženi geni

    图片42

     

     

    analiza ceRNA

     图片43Diferencialno izražene miRNA in sorodne RNA

    图片44 

     Raziščite raziskovalni napredek, ki ga omogočajo storitve sekvenciranja celotnega transkriptoma BMKGene prek izbrane zbirke publikacij.

     

    Dai, Y. et al.(2022) 'Obsežni ekspresijski profili mRNA, lncRNA in miRNA pri Kashin-Beckovi bolezni, identificirani s sekvenciranjem RNA', Molecular Omics, 18(2), str. 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan et al.(2022) „Analiza transkriptomov celotne dolžine mraza Apis cerana v gori Changbai v obdobju prezimovanja.“, Gene, 830, str. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ et al.(2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization of Competing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, str.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. et al.(2022) 'Integrirana analiza ekspresijskih profilov lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA razkriva nove vpoglede v možne mehanizme kot odziv na ogorčice koreninskih vozlov v arašidih', BMC Genomics, 23(1), str. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/SLIKE/7.

    Yan, Z. et al.(2022) 'Sekvenciranje RNK celotnega transkriptoma poudarja molekularne mehanizme, povezane z vzdrževanjem kakovosti po žetvi v brokoliju z rdečim LED obsevanjem', Postharvest Biology and Technology, 188, str.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    pridobite ponudbo

    Tukaj napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: