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Oloa

16s / 18s / lona ammlicon sequent-sclebio

16s / 18s / lona ammlicon sequeling-Pacbio o lo o aofia ai ata

O le 16s ma le 18s RRNA Genes, faʻatasi ai ma le i totonu o Spaced Spacer (o loʻo avea ma itulagi, tautua e avea ma tuʻufaʻatasiga mo le faʻailoaina o ni mea faigaluega. Amplification ma seniva o nei itulagi ofoina atu se fua-saoloto masani mo le suesueina o le microbial vaega ma eseese i mea eseese. E ui o le imoturi sequecing masani ona taulaʻi atu i soʻo se papertervar, v4 o 16s ma lana 1, ua leva ona faʻaalia le maualuga o le faʻailoga o le oona, 18s, ma lona. O lenei auala lautele e oʻo i le maualuga pasene o pasene o saʻo i taimi uma, ua ausia se tulaga o le iugafono e sosolo atu i ituaiga meaola. Pacbio's tasi-Molecle moni-taimi (strt) sequening stamform tu i luga e ala i le faia sili ona saʻo o faitauga (hivi) e unaʻia ai le tele-umi-umi. O lenei avanoa faʻatagaina tagata suʻesuʻe ia ausia se mea le mafai ona faʻaaogaina - o se manatu o le graoramic o le gafa masani. O le faʻalauteleina o le inisiua e sili ona faʻateleina ai le iugafono i ituaiga o faʻamatalaga, aemaise i totonu o le siama poʻo nuu tumu ai, o le loloto o le malamalama o le gaʻo o le microbilies.

Faafesootai matou

Auiliiliga faamatalaga

Bioinifofia

Demo taunuuga

Faaosofia lomiga

Tautua o foliga

● Sequening platform: Pacbio Regio

● Sequening mode: CCS (HIFI Faitau)

● Amplification o le sini o le itulagi sosoʻo ai ma le tuʻuga o le amomi o le ampolins i luma o le HIFI SMRT BELS KOMITI

Tulaga lelei

●Maualuga Lafoga Totogi: Than puʻupuʻu-amplion sequence,E mafai e le mafai ona sili atu le maualuga o le maualuga o le tulaga

●Maualuga moni faavae valaauina: Pacbio CCS mode sequening (hifi faitau).

●Leai se fua: Rapid faʻailoga o le milimiso o Microbial i le siosiomaga faʻataʻitaʻiga.

●Lautele talafeagai: Eseese le tele o le va fealoai nuu.

●Malamalamaaga o le bionigatanatic auiliiliga iloiloga: O le lata mai QiIme2 afifi (aofaʻiga malamalama i le microbial ecology) ma le tele o aʻoaʻoga i tulaga o faʻamaumauga, otu.

●Lautele tomai faapitoa: Faatasi ai ma afe o faafiafiaga a Am4licking rication na faʻaagaa ai le atoaga, e aumaia i le sefulu tausaga o BMKGEN

Auaunaga Mataupu Faavae

Faletusi	SUʻESUʻEGA FAʻATASI	Faamatalaga Fautuaina
Am4con	Pacbio Revio	10/30/50 K Fil (CCS)

Faʻataʻitaʻiga Manaʻoga

Manatu (ng / μl)	Aofai aofaiga (μg)	Voluma (μl)
≥5	≥0.3	≥20

Fautuaina le Aiatusi Tuufaatasi

Faʻasaʻoina faʻataʻitaʻiga i le suavai nitrogen mo le 3-4 itula ma teu i le suavai nitrogen poʻo le -80 tikeri i le taimi umi. O le faʻataʻitaʻiga o le lafoina ma le matutu-aisa e manaʻomia.

Auaunaga galue

Faataʻitaʻiga Faafou

Fausiaina o le Faletusi

Liu

Faamatalaga o faamatalaga

A maeʻa-faʻatau auaunaga

Talu ai: 16s / 18s / lona ammlick sequeck-ngs

Le isi: Asuy mo le transfaufauga-avanoa chromatin ma maualuga le ala e ala i luga (ASC-SEQ)

E aofia ai le auiliiliga lenei:

● Vave faʻamatalaga lelei

● OTU Clisterting / De-Beale (Asv)

● OTU Faʻaliga

● O le antifa eseese suʻesuʻega: tele o faʻasino, e aofia ai ma Shannon, Simpson ma le ACE.

● Ose mea e te fiafia ai

● Suʻesuʻega o suʻesuʻega

● Faʻatinoina o Suʻesuʻega: i le va o siosiomaga mea ma fafo atu o le tuʻufaʻatasiga ma eseese

● 16s le aoga a Gene

Histogram o le sonetoomic tufatufaina

Community tufatufa phylogenetic laau

Alpha Eseese auiliiliga: ACE

Faasino

O le BetA Eseese auiliiliga: PCOA

Suʻesuʻega Faʻapitoa: ANAVA

Saili i alualu i luma faʻafaigofie a le Bmkgene's Amplion sequences Service Services ma le Pacbio e ala i le faʻalumaina aoina o lomiga.

Gao, X. Ma Walg, H. (2023) 'Faapitoa auiliiliga o Rumen Bacters ma galuega i le Abne Genoz ", 9 ( 1), i. 16. DOI: 10.3390 / FERMESTATID99010016 / S1.

Li, S. Et al. (2023) 'A TA NA PUEINA O LE BIGIBIBALL BROCRY CRINCICK O LE FAʻAPITOA FAʻAPITOA MA SUʻESUʻEGA NICLICEMS MA LE BOOCICIODASS 20: 1, 9 DOI: 10.1038 / S41522-023-00439.

Mu, l. et al. (2022) 'Aafiaga o Fasty Acid Salts i uiga faʻapitoa, bacterolal eseese ma le arabic stared o le saienisi o meaʻai ma faʻatoʻaga, 102 (4), PP. 142 (4), pr. 1475- 1487. DoI: 10.1002 / JSFF.11482.

Yang, J. et al. (2023) 'O le fesoʻotaʻiga i le va o le oxidititi o le mamafa o le okitikers ma gau microbiota i le Antioxidant aafiaga o le Dychus Brachyotus DC. I le oxazolone-faaosofia ai le malosi o le mamafa o manogi i tagata matutua zebrafish ', anotio (23, Vol. 12, Itulau 152,, i. 192. DOI: 10.3390 / Anetiox12010192.