Su'esu'ega o le Feso'ota'iga i le Genome atoa
Fa'asologa o Galuega
Fa'amanuiaga o Auaunaga
●Fa'amaumauga Fa'apitoa ma Fa'asalalauga LauteleFaatasi ai ma le poto masani ua faaputuputu i le GWAS, ua faamaeaina e le BMKGene le faitau selau o poloketi o ituaiga meaola i suesuega o le faitau aofai o tagata o le GWAS, fesoasoani i tagata suesue e lolomiina tusiga e silia ma le 100, ma ua oo atu le aofaʻi o aafiaga ua oo atu i le 500.
● Su'esu'ega atoatoa o fa'amatalaga fa'akomepiuta: o le faagasologa o galuega e aofia ai le auiliiliga o le sootaga o uiga o le SNP, e tuʻuina atu ai se seti o kenera tauva ma a latou faʻamatalaga faʻatino talafeagai.
●'Au fa'akomepiuta tomai fa'apitoa ma se ta'amilosaga pu'upu'u o su'esu'egaFaatasi ai ma le tele o le poto masani i auiliiliga maualuluga o genomics, e tuʻuina atu e le au a le BMKGene ni auiliiliga atoatoa i se taimi vave e faatino ai.
●Lagolago pe a uma ona fa'atau:O la matou tautinoga e sili atu nai lo le maeʻa o le galuega faatino faatasi ai ma se vaitaimi tautua e 3 masina pe a uma le faatauina atu. I le taimi lea, matou te ofoina atu le tuliloaina o le galuega faatino, fesoasoani i le foia o faafitauli, ma sauniga Fesili ma Tali e tali ai soo se fesili e fesoʻotaʻi ma taunuuga.
Fa'amatalaga ma mana'oga o auaunaga
| Ituaiga o le faasologa | Fuainumera o le faitau aofa'i fautuaina | Fuafuaga fa'asologa | Mana'oga mo le nucleotide |
| Fa'asologa Atoa o le Genome | 200 faʻataʻitaʻiga | 10x | Fa'aputuga: ≥ 1 ng/ µL Aofa'i atoa ≥ 30ng Fa'aitiitia pe leai fo'i se fa'aleagaina po'o se fa'aleagaina |
| Vaega Fa'ateleina o le Nofoaga Fa'apitoa (SLAF) | Loloto o le pine: 10x Numera o pine: < 400 Mb: E fautuaina le WGS < 1Gb: pine 100K 1Gb > 2Gb: pine 300K Fa'ailoga e 500k le maualuga | Fa'aputuga ≥ 5 ng/µL Aofa'i atoa ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Agarose gel: leai pe fa'atapula'aina le fa'aleagaina po'o le fa'aleagaina
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Filifiliga o Meafaitino
Eseese ituaiga, vaega laiti, ituaiga fanua/fa'amaumauga o kenera/aiga fefiloi/punaoa vao
Eseese ituaiga, vaega laiti, ma la'au fanua
Aiga o uso/aiga o uso atoa/punaoa vao
Tafega o Galuega Auaunaga
Fuafuaga o fa'ata'ita'iga
Fa'ata'ita'iga o le tu'uina atu
Aveeseina o le RNA
Fausiaina o le faletusi
Fa'asologa
Su'esu'ega o fa'amaumauga
Auaunaga pe a uma le fa'atau atu
E aofia ai le auiliiliga lenei:
- Su'esu'ega o le sootaga i le genome atoa: LM, LMM, EMMAX, fa'ata'ita'iga FASTLMM
- Fa'amatalaga fa'atino o kenera sui tauva
Su'esu'ega o le fesoota'iga o uiga o le SNP - Manhattan plot
Su'esu'ega o le fesoota'iga o uiga SNP - QQ plot
Su'esu'e ia alualu i luma na fa'afaigofieina e auaunaga a le BMKGene's de GWAS e ala i se fa'aputuga o lomiga ua filifilia:
Lv, L. et al. (2023) 'Malamalamaaga i le fa'avae fa'asolopito o le onosa'i i le ammonia i le razor clam Sinonovacula constricta e ala i le su'esu'ega o le genome-wide association',Fa'ato'aga i'a, 569, i. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'O suʻesuʻega multi-omics o le 398 o le foxtail millet e faʻaalia ai vaega genomic e fesoʻotaʻi ma le faʻaleleia o fale, uiga metabolite, ma aafiaga e teteʻe ai i le mumū',La'au Molekiula, 15(8), itulau 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. ma isi. (2022) 'Fa'afanua o le Feso'ota'iga Lautele o le Genome o Phenotypes o Hulless Barely i le Siosiomaga o le Lāmala',Tuaoi i le Saienisi o La'au, 13, itulau 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'O le GmST1, lea e fa'ailoa ai se sulfotransferase, e tete'e atu i siama soybean mosaic virus G2 ma le G3',La'au, Sela & Siosiomaga, 44(8), itulau 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
