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La'au/Manu De novo Genome Sequencing
De novofa'asologa o lo'o fa'atatau ile fausiaina ole genome atoa ole ituaiga e fa'aaoga ai tekinolosi fa'asologa, fa'ata'ita'iga PacBio, Nanopore, NGS, ma isi, pe a leai se genome fa'asino.O le faʻaleleia mataʻina o le umi o le faitau o tupulaga lona tolu o tekinolosi faʻasologa na maua ai avanoa fou i le faʻapipiʻiina o genomes lavelave, e pei oi latou e maualuga le heterozygosity, maualuga maualuga o itulagi toe fai, polyploids, ma isi. Faatasi ai ma le umi faitau i le sefulu o kilobases tulaga, o nei faasologa faitau e mafai ai. fofoina o elemene faifaipea, itulagi o loʻo iai mea faʻalavelave GC ma isi vaega sili ona lavelave.
Fa'avae: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
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Hi-C fa'avae Genome Assembly
O le Hi-C o se metotia ua fuafuaina e pu'e ai le fa'atulagaina o chromosome e ala i le tu'ufa'atasia o le su'esu'eina o feso'ota'iga vavalalata ma le fa'asologa maualuga.O le malosi o nei fegalegaleaiga e talitonuina e le lelei le fesoʻotaʻiga ma le mamao faaletino i chromosomes.O le mea lea, e mafai e fa'amaumauga a le Hi-C ona ta'ita'ia le fa'aputuina, fa'atonu ma le fa'atonuina o fa'asologa o lo'o tu'ufa'atasia i se fa'ata'ita'iga genome ma fa'amauina na i luga ole numera o chromosomes.O lenei tekinolosi e fa'amalosia ai se fa'apotopotoga o le genome-level chromosome i le leai o se fa'afanua fa'avae fa'avae tagata.O genome ta'itasi uma e mana'omia se Hi-C.
Tulaga: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
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Evolutionary Genetics
Evolutionary genetics o se auaunaga fa'asologa fa'apipi'iina ua fuafuaina mo le tu'uina atu o se fa'amatalaga manino i luga o fa'amatalaga fa'afouina o mea na tu'uina atu e fa'atatau i fesuiaiga o kenera, e aofia ai SNPs, InDels, SVs ma CNVs.O lo'o tu'uina atu ai su'esu'ega fa'avae uma e mana'omia mo le fa'amatalaina o suiga fa'asolosolo ma uiga fa'atupu o le faitau aofa'i, e pei o le fausaga o le faitau aofa'i, fa'avasegaga o le kenera, so'oga fa'aletagata, ma isi.
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Faatusatusa Genomics
Fa'atusatusa genomics o lona uiga o le fa'atusatusaina atoa o fa'asologa o genom ma fausaga o ituaiga eseese.O lenei a'oa'iga e fa'atatau i le fa'ailoaina o le fa'atupuina o ituaiga, galuega fa'atupu, faiga fa'atonutonu fa'atupu i le tulaga o le genome e ala i le fa'ailoaina o le fa'asologa o fa'asologa ma elemene na fa'asaoina pe fa'avasegaina i ituaiga eseese.O su'esu'ega fa'atusa fa'atusa fa'atusa e aofia ai su'esu'ega i le gafa aiga, atina'e fa'afuafua, fa'aluaina atoa o le genome, fa'atonuga filifilia, ma isi.
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Bulked Segregant auiliiliga
Bulked segregant analysis (BSA) ose metotia e fa'aogaina e vave fa'ailoa ai fa'ailoga fa'ailoga e feso'otai i le phenotype.O galuega autu a le BSA o lo'o i ai le filifilia o vaega e lua o tagata e matua'i fa'afeagai uiga fa'afeagai, fa'atasia le DNA o tagata ta'ito'atasi uma e fausia ai le tele o DNA, fa'ailoa ai fa'asologa eseese i le va o vaita'ele e lua.O lenei metotia ua fa'aaogaina tele i le fa'ailoaina o fa'ailoga fa'ailoga e feso'ota'i malosi e kenera fa'atatau ile genome o la'au/manu.
