Fa'amaumauga atoa o le Pacbio

O le PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, e mafai ai ona fa'ailoa sa'o ia transcript isoforms, fa'amalamalamaina ai isi polyadenylation ma splicing, ma ta'ita'ia ai i se su'esu'ega sa'o o le fa'aalia o kene. O le BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome pipeline ua mamanuina e iloilo ai faletusi cDNA ua fa'asologaina i le Circular Consensus Sequencing (CCS) mode ma fa'ailoa ai fa'asologa Full-Length Non-Chimeric (FLNC), lea e fa'aputuina i totonu o transcripts e le toe fa'aopoopoina. O se su'esu'ega BUSCO mulimuli ane e iloilo ai le atoatoa o le fa'apotopotoga o le transcriptome. Mai le transcriptome ua tu'ufa'atasia, e faia ai le tele o su'esu'ega: splicing fa'aopoopo, toe fai o le fa'asologa faigofie (SSR), vavaloina o le lncRNA ma genes fa'atatau talafeagai, vavaloina o genes fou, su'esu'ega o le aiga o kene, su'esu'ega o le transcription factor, ma le fa'amatalaga fa'atino o transcripts.