Soo gal BMKCloud

Badeecadaha

Kala-soocidda Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)

Sawirka Soo-bandhigidda Chromatin Immunoprecipitation (ChIP-seq)

Chromatin Immunoprecipitation (CHIP) waa farsamo ka faa'iidaysata unugyada difaaca jirka si ay si xushmad leh u kobciyaan borotiinnada ku xidhan DNA-da iyo bartilmaameedyada hidde-sideyaasha ee u dhigma. Is-dhexgalka NGS wuxuu suurtogal ka dhigayaa qaab-dhismeedka hidde-sideyaasha ee bartilmaameedyada DNA-da ee la xidhiidha wax-ka-beddelka histone, arrimaha qoraalka, iyo borotiinnada kale ee ku xidhan DNA-da. Habkan firfircoon wuxuu suurtogal ka dhigayaa isbarbardhigga goobaha isku xidhka ee noocyada kala duwan ee unugyada, unugyada, ama xaaladaha. Codsiyada ChIP-Seq waxay ka bilaabmaan barashada nidaamka qoraalka iyo waddooyinka horumarka ilaa qeexidda hababka cudurka, taasoo ka dhigaysa qalab lama huraan ah oo lagu fahmo muuqaalka nidaamka hidde-sideyaasha iyo horumarinta aragtida daaweynta.

Madal: Illumina NovaSeq

Nala soo xiriir

Faahfaahinta Adeegga

Bayoinformatics

Natiijooyinka Tijaabada

Faa'iidooyinka Adeegga

●Falanqaynta Cilmi-baarista Bayoolajiga ee Sare iyo Faallo Dhammaystiran:Waxaan isticmaalnaa xog ururin badan si aan si firfircoon u sharaxno hiddo-sidayaasha la xiriira gobollada isku xidhka borotiinka-DNA, annagoo bixinayna aragtiyo ku saabsan hababka unugyada iyo molecular-ka ee salka ku haya isdhexgalka.

●Taageerada Iibka Kadib:Ballanqaadkeennu wuxuu ka baxsan yahay dhammaystirka mashruuca iyadoo la adeegsanayo muddo 3 bilood ah oo adeeg ah ka dib iibka. Inta lagu jiro waqtigan, waxaan bixinnaa dabagalka mashruuca, caawinta xallinta dhibaatooyinka, iyo fadhiyada su'aalaha iyo jawaabaha si wax looga qabto su'aalaha la xiriira natiijooyinka.

●Waayo-aragnimo ballaaran:Iyada oo leh taariikh guul leh oo ah dhammaystirka mashaariic badan oo ChIP-Seq ah, shirkaddayadu waxay miiska soo saartaa in ka badan toban sano oo khibrad ah. Kooxdayada falanqaynta ee xirfadda sare leh, oo ay weheliso macluumaad dhammaystiran iyo taageero iibka kadib, waxay hubinaysaa guusha mashaariicdaada.

● Xakamaynta Tayada Adag: Waxaan hirgelinnaa qodobbada xakamaynta asaasiga ah dhammaan marxaladaha, laga bilaabo diyaarinta muunadda iyo maktabadda ilaa taxanaha iyo macluumaadka bayoolojiga. Kormeerkan taxaddarka leh wuxuu hubinayaa bixinta natiijooyin tayo sare leh oo joogto ah.

Tilmaamaha Adeegga

Maktabad	Istaraatiijiyadda Taxanaha	Soo saarista xogta lagu taliyay	Xakamaynta tayada
DNA-da la nadiifiyey ka dib markii la sameeyay tallaalka difaaca jirka	Illumina PE150	10Gb	Q30≥85%