Alaabta

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

Isku xigxiga mRNA waxa ay awood u siinaysaa sifada dhammaan mRNA-yada laga soo guuriyay unugyada xaalado gaar ah.Waa tignoolajiyad awood leh oo muujinaysa astaanta muujinta hidda-wadaha, qaab-dhismeedka hiddaha iyo hababka molecular ee hababka noolaha qaarkood.Ilaa hadda, isku xigxiga mRNA ayaa si weyn looga shaqaaleysiiyay cilmi baarista aasaasiga ah, ogaanshaha caafimaad, horumarinta daroogada, iwm.

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Nala soo xiriir

Faahfaahinta Adeegga

Bioinformatics

Natiijooyinka Demo

Faa'iidooyinka

● Khibrad sare leh: In ka badan 200,000 oo muunado ayaa lagu farsameeyay BMK oo daboolaya noocyo kala duwan oo muunado ah, oo ay ku jiraan dhaqanka unugyada, unugyada, dareeraha jidhka, iwm. iyo in ka badan 7,000 mRNA-Seq mashruucyo ayaa la xidhay oo daboolaya aag cilmi-baaris oo kala duwan.

● Nidaamka xakamaynta tayada adag: Qodobbada xakamaynta tayada xudunta u ah iyada oo la marayo dhammaan tillaabooyinka ay ka mid yihiin diyaarinta muunada, diyaarinta maktabadda, isku xigxiga iyo bioinformatics ayaa si dhow loola socdaa si loo bixiyo natiijooyin tayo sare leh.

● Xog ururin badan oo diyaar u ah sharraxaadda shaqada iyo daraasadaha kobcinta si loo fuliyo ujeedooyinka cilmi-baarista ee kala duwan.

● Adeegyada iibka kadib: Adeegyada iibka kadib waxay shaqaynayaan 3 bilood marka mashruuca la dhammeeyo, oo ay ku jiraan dabagalka mashaariicda, dhib-toogashada, natiijooyinka Q&A, iwm.

Tusaalaha Shuruudaha iyo Bixinta

Maktabadda	Istaraatiijiyada isku xigxiga	Xogta lagu taliyay	Xakamaynta tayada
Poly A waa la hodmay	Illumina PE150	6 Gb	Q30≥85%

Tusaalaha Shuruudaha:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Qadarka (μg)

daahirnimo

Daacadnimo

≥ 20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Xaddidan ama aan lahayn borotiin ama wasakh DNA oo lagu muujiyey jel.

Dhirta: RIN≥6.5;

Xoolaha: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

xaddidan ama aan lahayn sare u qaadis aasaasi ah

Nudaha: Miisaanka (qallalan):≥1 g
* Unugyada ka yar 5 mg, waxaan kugula talineynaa inaad soo dirto muunada nudaha barafaysan (ku jira nitrogen dareere ah).

Ka joojinta unugga:Tirada unugyada = 3×10⁶- 1×10⁷
* Waxaan kugula talineynaa in la raro unugyada la qaboojiyey.Haddii unuggaasi uu ka yar yahay 5×105.

Muunadaha dhiigga:Mugga ≥1 ml

Microorganism:Cuf ≥ 1 g

Tusaalaha keenista lagu taliyay

Weel: 2 ml oo tuubo sentrifuge ah (Faylada qasacadaysan laguma talinayo)

Tusaalaha calaamadaynta: Kooxda+ku celcelinta tusaale A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Raritaanka:

Barafka qallalan: Muunada waxay u baahan yihiin in lagu soo raro bac oo lagu aaso baraf qallalan.
Tuubooyinka RNAstable: Muunada RNA waxaa lagu qallajin karaa tuubada xasilinta RNA (tusaale RNAstable®) waxaana lagu rari karaa heerkulka qolka.