-
Isku-dabaynta hal-xuduneed ee RNA
Horumarka lagu sameeyay hal unug iyo farsamada dhismaha maktabadda gaarka ah oo lagu daray isku xigxiga-sare ee soo saarista waxay saamaxdaa daraasado muujinta hidde-sidaha oo ku salaysan unug-unug.Waxay awood u siisaa falanqayn qoto dheer oo dhamaystiran oo ku saabsan nidaamka unugyada isku dhafan, taas oo ay si weyn uga fogaato qarinta kala duwanaanshahooda iyada oo qaadashada celceliska dhammaan unugyada.
Si kastaba ha ahaatee, unugyada qaarkood kuma haboona in laga dhigo hal unug hal unug ah, markaa habab kale oo muunad diyaarin ah - soo saarista nukleus ee unugyada ayaa loo baahan yahay, taas oo ah, nukleus si toos ah ayaa looga soo saaraa unugyo ama unug waxaana loo diyaariyey hal-budada ka joojinta hal-hal- isku xigxiga unugga.
BMK waxa ay bixisaa 10x Genomics ChromiumTM ku salaysan adeegga isku xigxiga hal unug ee RNA.Adeeggan ayaa si weyn loogu isticmaalay daraasado ku saabsan cilmi-baadhisyo la xidhiidha cudurrada, sida kala-soocidda unugyada difaaca, kala duwanaanshaha burooyinka, horumarinta unugyada, iwm.
Chip transcriptome Spatial: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Isku-xiridda Hiddo-sidaha Dhan ee Dhirta/Xayawaanka
Dib-u-soo-celinta genome-ga oo dhan, oo sidoo kale loo yaqaan WGS, waxay awood u siinaysaa muujinta isku-beddellada caadiga ah iyo kuwa naadirka ah ee dhammaan genome-ga oo ay ku jiraan Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Tirtirka Gelinta (InDel), Kala duwanaanshaha qaab-dhismeedka (SV), iyo Kala duwanaanshaha Tirada Nuqulka (CNV) ).SV-yadu waxay ka kooban yihiin qayb weyn oo ka mid ah saldhigga kala duwanaanshiyaha marka loo eego SNPs waxayna saameyn weyn ku leeyihiin genome-ka, taas oo saameyn weyn ku leh noolaha.Dib u akhrinta dheer waxay u ogolaanaysaa in si sax ah loo aqoonsado jajabyo waaweyn iyo kala duwanaansho adag sababtoo ah akhrinta dheer waxay aad u fududaynaysaa ka gudubka koromosoomyada ee gobolada adag sida soo noqnoqoshada tandem, GC/AT-gobolada qani ku ah, iyo gobolada isbedbeddelka badan.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
transcriptomics Spatial transcriptomics waxay u taagan tahay safka hore ee hal-abuurnimada sayniska, taasoo awood u siinaysa cilmi-baarayaasha inay dhexgalaan qaababka muujinta hidde-sidaha ee qallafsan ee unugyada dhexdooda iyagoo ilaalinaya xaaladdooda bannaan.Meelo kala duwan oo ay ku jiraan, BMKGene waxay soo saartay BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, iyada oo ku faanaysaxallinta la xoojiyayee 5µM, gaarey tirada unug hoosaadka, iyo kartidejinta xallinta heerar badan.Chip-ka S1000, oo leh ku dhawaad 2 milyan oo baro, ayaa ka shaqeeya microwells oo ay ku dahaaran yihiin kuul ay ku raran yihiin shaybaarro qabsi oo meel bannaan ah.Maktabad cDNA ah, oo ay ku hodmeen barcode-yada bannaan, ayaa laga soo diyaariyey chip-ka S1000 oo markii dambe lagu sii raacay madal Illumina NovaSeq.Isku darka shaybaarrada barcodeed ee meel bannaan iyo UMI-yada waxay hubinayaan saxnaanta iyo gaarnimada xogta la soo saaray.BMKManu S1000 chip sifadiisa gaarka ah waxay ku jirtaa kala duwanaanshaheeda, oo bixisa dejinta xallinta heerar badan oo si fiican loogu hagaajin karo unugyo iyo heerar faahfaahsan oo kala duwan.Laqabsigani wuxuu u dhigayaa chip-ka doorasho aad u wanaagsan oo loogu talagalay daraasadaha transcriptomics ee kala duwan, hubinta isku dhafka boosaska saxda ah oo leh buuq yar.
Isticmaalka BMKManu S1000 chip iyo teknoolojiyadda transcriptomics kale ee goobta, cilmi-baarayaashu waxay heli karaan faham wanaagsan oo ku saabsan abaabulka ballaaran ee unugyada iyo isdhexgalka molecular ee adag ee ka dhex dhaca unugyada, iyagoo siinaya fikrado qiimo leh oo ku saabsan hababka asaasiga ah ee hababka bayoolojiga ee qaybo badan oo kala duwan, oo ay ku jiraan oncology, neuroscience, bayoolaji korriinka, immunology iyo cilmiga dhirta.
Platform: BMKManu S1000 chip iyo Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
transcriptomics Spatial transcriptomics waa tignoolajiyada gees-goynta ah oo u oggolaanaysa cilmi-baarayaasha inay baaraan qaababka muujinta hidda-wadaha ee unugyada dhexdooda iyagoo ilaalinaya xaaladdooda bannaan.Mid ka mid ah madal awood leh oo ku taal boggan waa 10x Genomics Visium oo ay weheliso taxanaha Illumina.Mabda'a 10X Visium wuxuu dul saaran yahay jajab khaas ah oo leh meel laqabsado oo loo qoondeeyay halkaasoo qaybaha unugyada la dhigo.Goobtan la qabsashada waxa ay ka kooban tahay baro kood leh, oo mid walba u dhigma meel bannaan oo gaar ah oo ku dhex jirta unugyada.Unugyada RNA ee la qabtay ee ka yimid nudaha ayaa markaa lagu calaamadeeyay tilmaameyaal unugyo gaar ah (UMIs) inta lagu guda jiro habka qorista.Barcodeedkan iyo UMI-yada waxay awood u siinayaan khariidad meeleed sax ah iyo qiyaasida muujinta hidda-wadaha ee xallinta hal unug.Isku darka shaybaarrada barcodeed ee meel bannaan iyo UMI-yada waxay hubinayaan saxnaanta iyo gaarnimada xogta la sameeyay.Isticmaalka tignoolajiyadan Spatial Transcriptomics, cilmi-baarayaashu waxay heli karaan faham qoto dheer oo ku saabsan abaabulka ballaaran ee unugyada iyo isdhexgalka unugyada kakan ee ka dhex dhaca unugyada, iyagoo siinaya aragtiyo qiimo leh oo ku saabsan hababka asaasiga ah ee hababka bayoolojiga ee dhinacyo badan, oo ay ku jiraan oncology, neuroscience, bayoolaji korriinka, immunology. , iyo cilmiga dhirta.
Platform: 10X Genomics Visium iyo Illumina NovaSeq
-
Dherer buuxa mRNA Taxane-Nanopore
Halka isku xigxiga mRNA-ku-saleysan ee NGS uu u adeego sidii qalab wax-ku-ool ah oo lagu qiyaaso muujinta hidda-wadaha, ku-tiirsanaanta ay u leedahay akhrinta gaagaaban waxay xaddidaysaa waxtarkeeda falanqaynta qoraalka qoraalka ee adag.Isku xigxiga Nanopore, dhanka kale,, waxay shaqaaleysiisaa tignoolajiyada akhriska dheer, taasoo awood u siinaya isku xigxiga qoraallada mRNA-ga ee dhererka buuxa.Habkani wuxuu fududeeyaa sahaminta dhamaystiran ee kala-baxa beddelka ah, isku-dhafka hidda-wadaha, poly-adenylation, iyo qiyaasidda soofoofyada mRNA.
Isku xigxiga Nanopore wuxuu ku tiirsan yahay nanopore hal-molecule-ka-dhabta ah calaamadaha korantada.Waxaa haga borotiinada mootada, DNA-da laba-jibbaaran waxay ku xidhan tahay borotiinnada nanopore ee ku dhex jira biofilm, oo furfuraya marka ay dhex marto kanaalka nanopore ee hoos yimaada farqiga danabka.Calaamadaha korantada ee gaarka ah ee ay abuuraan saldhigyo kala duwan oo ku yaal xargaha DNA-da ayaa la ogaadaa waxaana lagu kala saaraa waqtiga dhabta ah, fududeynta saxda ah iyo taxanaha nucleotide ee joogtada ah.Habkan hal-abuurka leh ayaa ka gudbaya xaddidaadyada akhris-gaaban wuxuuna bixiyaa madal firfircoon oo loogu talagalay falanqaynta genomic-ga adag, oo ay ku jirto daraasado qoraal ah oo adag.
Platform: Nanopore Promethion P48
-
Taxanaha mRNA dhererka buuxa -PacBio
In kasta oo isku xigxiga mRNA-ku-salaysan ee NGS uu yahay aalad wax-ku-ool ah oo lagu qiyaaso muujinta hidda-wadaha, ku-tiirsanaanta ay u leedahay akhrinta gaagaaban waxay xaddidaysaa isticmaalkeeda falanqaynta qoraalka qoraalka ee adag.Taxanaha PacBio (Iso-Seq), dhanka kale, waxa ay shaqaaleysiisaa tignoolajiyada wax-akhris dheer, taas oo awood u siinaya isku xigxiga qoraallada mRNA-ga oo buuxa.Habkani waxa uu fududeeyaa sahaminta dhamaystiran ee kala qaybsanaanta beddelka ah, isku-dhafka hidde-sideyaasha iyo poly-adenylation in kasta oo aanay ahayn doorashada koowaad ee qiyaasidda muujinta hidda-wadaha, sababtuna tahay tirada badan ee xogta loo baahan yahay.
Tiknoolajiyada isku xigxiga ee PacBio waxay ku tiirsan tahay isku xigxiga hal-molecule, waqtiga-dhabta ah (SMRT), taasoo bixisa faa'iido gaar ah qabashada qoraallada mRNA ee dhererka buuxa.Habkan cusubi wuxuu ku lug leeyahay isticmaalka mawjadaha mawjadaha eber ah (ZMWs), ceelasha microfabricated oo awood u siinaya fiirsashada waqtiga dhabta ah ee waxqabadka DNA polymerase inta lagu jiro taxanaha.Gudaha ZMW-yadan, PacBio's DNA-ga polymerase waxa uu ku abuuraa xadhig dhammaystiran oo DNA ah, isaga oo soo saaraya akhrin dheer oo ka kooban dhammaan qoraallada mRNA.Hawlgalka PacBio ee qaabka isku xigxiga Consensus Wareega (CCS) waxa ay wanaajisaa saxnaanta iyada oo si isdaba joog ah u taxaysa isla unugyadii.Akhrinta HiFi ee la soo saaray waxay leedahay saxsanaan la barbardhigi karo NGS, taasoo sii kordhinaysa wax ku biirinta falanqaynta dhamaystiran oo la isku halayn karo ee sifooyinka qoraalka qoraalka adag.Platform: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Taxanaha mRNA waxa uu awood siinayaa sifada dhamaystiran ee dhamaan qoraalada mRNA-ga ee unugyada ku jira xaalado gaar ah.Tiknoolajiyadan casriga ah waxay u adeegtaa sidii qalab awood leh, oo daaha ka qaadaysa muuqaalada muujinta hidda-wadaha, qaab-dhismeedka hidda-wadaha, iyo hababka molecular ee la xidhiidha hababka noole ee kala duwan.Si ballaaran loo qaatay cilmi baarista aasaasiga ah, baarista caafimaadka, iyo horumarinta daroogada, isku xigxiga mRNA waxa uu bixiyaa aragtiyo ku saabsan qalafsanaanta dhaqdhaqaaqa gacanta iyo habaynta hidda-socodka.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Tixraaca aan ku salaysnayn mRNA Sequencing-Illumina
Taxanaha mRNA waxa uu awood siinayaa sifada dhamaystiran ee dhamaan qoraalada mRNA-ga ee unugyada ku jira xaalado gaar ah.Tiknoolajiyadan casriga ah waxay u adeegtaa sidii qalab awood leh, oo daaha ka qaadaysa muuqaalada muujinta hidda-wadaha, qaab-dhismeedka hidda-wadaha, iyo hababka molecular ee la xidhiidha hababka noole ee kala duwan.Si ballaaran loo qaatay cilmi baarista aasaasiga ah, baarista caafimaadka, iyo horumarinta daroogada, isku xigxiga mRNA waxa uu bixiyaa aragtiyo ku saabsan qalafsanaanta dhaqdhaqaaqa gacanta iyo habaynta hidda-socodka.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Xigasho dheer oo aan codayn-Ilumina
RNA-yada dheer ee aan codeeyn (lncRNAs) waa RNAs ka dheer 200 nucleotide kuwaas oo leh awood codeing ugu yar oo ah xubno muhiim ah oo ku dhex jira RNA aan codeeyn.Laga helay xudunta iyo cytoplasm, RNA-yadani waxay door muhiim ah ka ciyaaraan epigenetic, transcriptional, iyo qawaaniinta ka dambeeya, iyagoo hoosta ka xariiqaya muhiimada ay u leeyihiin qaabaynta hababka gacanta iyo unugyada.Taxanaha LncRNA waa aalad awood badan oo kala soocida Unugyada, Ontogenesis, iyo Cudurada Aadanaha.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Isku xigxiga RNA-yar-Illumina
Unugyada RNA (sRNA) yaryar, sida caadiga ah waxay ka hooseeyaan 200 nucleotide oo dherer ah, waxaa ka mid ah microRNAs (miRNAs), RNA-yada yaryar ee farageliya (siRNAs), iyo RNA-yada piwi-ga ah (piRNAs).Kuwaas waxaa ka mid ah, miRNAs, oo ku dhow 20-24 nucleotides dheer, ayaa si gaar ah loogu xusi karaa doorkooda sharciyeynta ee hababka kala duwan ee gacanta.Qaababka muujinta unugyada gaarka ah iyo heerka-gaarka ah, miRNA-yadu waxay soo bandhigaan ilaalin sare oo noocyada kala duwan ah.
Platform: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Isku xigxiga RNA wareegtada ah (circRNA-seq) waa in la soo bandhigo oo la falanqeeyo RNA-yada wareegsan, koox ka mid ah molecules RNA kuwaas oo sameeya wareegyo xiran oo ay ugu wacan tahay dhacdooyinka kala-baxa ee aan kanoniga ahayn, taasoo siinaysa RNA-gan xasilooni korodhay.Iyadoo qaar ka mid ah circRNA-yada la muujiyey inay u dhaqmaan sidii isbuunyo microRNA ah, kala soocida microRNA-yada oo laga hortagayo inay nidaamiyaan mRNA-yada bartilmaameedka ah, circRNA-yada kale ayaa laga yaabaa inay la falgalaan borotiinnada, beddelaan muujinta hidda-wadaha, ama waxay door ku leeyihiin hababka gacanta.Falanqaynta muujinta circRNA waxay bixisaa aragtiyo ku saabsan doorarka nidaaminta unugyadan iyo muhiimada ay ku leeyihiin hababka kala duwan ee unugyada, heerarka korriinka, iyo xaaladaha cudurka, taasoo gacan ka geysaneysa faham qoto dheer oo ku saabsan kakanaanta nidaamka RNA ee macnaha guud ee muujinta hidda-wadaha.
-
Isku xigxiga qoraalka oo dhan - Illumina
Isku xigxiga qoraalka oo dhan wuxuu bixiyaa hab dhammaystiran oo lagu soo bandhigo unugyo RNA oo kala duwan, oo ka kooban labadaba kood (mRNA) iyo RNA-yada aan codeeyn (lncRNA, circRNA, iyo miRNA).Farsamadan waxay qabsata qoraalka buuxa ee unugyo gaar ah waqti la siiyay, taasoo u oggolaanaysa faham buuxa ee hababka gacanta.Sidoo kale loo yaqaan "wadarta isku xigxiga RNA," waxay ujeedadeedu tahay inay daaha ka qaaddo shabakadaha sharciyeynta adag ee heerka transcriptome, taasoo awood u siinaysa falanqayn qotodheer sida RNA endogenous RNA (ceRNA) iyo falanqaynta wadajirka ah ee RNA.Tani waxay calaamad u tahay tillaabada bilawga ah ee ku wajahan sifada shaqaynaysa, gaar ahaan furitaanka shabakadaha sharciyaynta ee ku lug leh isdhexgalka ceRNA-miRNA-mRNA ku salaysan.
