sekuenca e circARN-së-Illumina
Veçoritë
● Zbrazja e rARN-së e ndjekur nga përgatitja e bibliotekës së drejtuar, duke mundësuar renditjen e të dhënave që janë specifike për vargun.
● Rrjedha e punës bioinformatike mundëson parashikimin e circRNA dhe kuantifikimin e shprehjes
Avantazhet e Shërbimit
●Biblioteka më gjithëpërfshirëse të ARN-së:ne përdorim zbrazjen e rRNA në vend të zbrazjes lineare të ARN-së në përgatitjen tonë para bibliotekës, duke siguruar që të dhënat e renditjes të përfshijnë jo vetëm circRNA, por edhe mRNA dhe lncARN, duke mundësuar analiza të përbashkëta në këto grupe të dhënash
●Analiza opsionale e rrjeteve konkurruese endogjene ARN (ceRNA).: ofrimi i njohurive më të thella në mekanizmat rregullues qelizor
●Ekspertizë e gjerë: me një histori të përpunimit të mbi 20,000 mostrave në BMK, duke përfshirë lloje të ndryshme mostrash dhe projekte lncRNA, ekipi ynë sjell një përvojë të pasur në çdo projekt.
●Kontroll rigoroz i cilësisë: ne zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri te sekuenca dhe bioinformatika.Ky monitorim i përpiktë siguron dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë.
● Mbështetje pas shitjes: Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore.Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.
Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi
| Librari | Platforma | Të dhënat e rekomanduara | QC e të dhënave |
| Poli A i pasuruar | Ndriçues PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës:
Nukleotidet:
| Konk.(ng/μl) | Sasia (μg) | Pastërti | Integriteti |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | Për bimët: RIN≥6.5; Për kafshët: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; lartësi bazë e kufizuar ose aspak |
● Bimët:
Rrënja, kërcelli ose petali: 450 mg
Gjethja ose fara: 300 mg
Fruta: 1.2 g
● Kafsha:
Zemra ose zorrë: 450 mg
Të brendshmet ose truri: 240 mg
Muskujt: 600 mg
Kockat, flokët ose lëkura: 1.5 g
● Artropodët:
Insektet: 9 g
Krustace: 450 mg
● Gjak i plotë:2 tuba
● Qelizat: 106 qelizat
● Serum dhe plazma: 6 ml
Dorëzimi i mostrës së rekomanduar
Enë: tub centrifuge 2 ml (Folja e kallajit nuk rekomandohet)
Etiketimi i mostrës: Grup+përsëritje p.sh. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Dërgesa:
1. Akull i thatë: Mostrat duhet të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tubat e qëndrueshme ndaj ARN-së: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.
Rrjedha e punës së shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Ekstraktimi i ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Bioinformatika
Parashikimi i circARN: shpërndarja kromozomale
CARN-të e shprehura në mënyrë diferenciale – Grafiku i vullkanit
CARN-të e shprehura në mënyrë diferenciale – grupimi hierarkik
Pasurimi funksional i gjeneve pritëse të circRNA
Eksploroni përparimet e kërkimit të lehtësuar nga shërbimet e renditjes së rreth RNA të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 rregullon formimin e circRNA dhe heshtjen e gjenit të ndërmjetësuar nga mikroRNA në karcinomën hepatoqelizore', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), fq. 4338-4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) 'Transkriptoma e përgjegjshme ndaj X oo zbulon rolin e ARN133 rrethore në rezistencën ndaj sëmundjeve duke rregulluar shprehjen e OsARAB në oriz', Phytopathology Research, 5 (1), fq. 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al.(2023) 'CPSF3 modulon ekuilibrin e transkripteve rrethore dhe lineare në karcinomën hepatoqelizore'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Vlerësimi gjithëpërfshirës i circARN-ve në kardiomiopatinë cirrotike para dhe pas transplantimit të mëlçisë', International Immunopharmacology, 114, f.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
