Illumina Bibliotekat e bëra paraprakisht
Tiparet
>Platformat:Illumina Novaseq 6000 dhe Novaseq X Plus
>Mënyrat e sekuencave:PE150 dhe PE250
>Kontrolli i cilësisë së bibliotekave para sekuencave
>Sekuencimi i të dhënave QC dhe shpërndarja:Dorëzimi i raportit QC dhe të dhënave të papërpunuara në formatin FASTQ pas demultiplexing dhe filtrimit lexon Q30
Avantazhet e shërbimit
>Shkathtësia e shërbimeve të sekuencave:Konsumatori mund të zgjedhë të sekuencat nga korsia, qeliza e rrjedhës ose nga sasia e të dhënave të kërkuara (sekuencimi i pjesshëm i korsisë).
>Përvojë e gjerë në platformën e sekuencave të Illumina:me mijëra projekte të mbyllura me specie të ndryshme.
>Dorëzimi i sekuencave Raporti i QC:me metrikë të cilësisë, saktësinë e të dhënave dhe performancën e përgjithshme të projektit të sekuencave.
>Procesi i sekuencave të pjekur:me kohë të shkurtër kthimi.
>Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë kërkesa të rrepta të QC për të garantuar shpërndarjen e rezultateve me cilësi të lartë vazhdimisht.
Platforma të mostrave
| Platformë | Rrjedhë | Modaliteti i sekuencave | Njësi | Prodhimi i vlerësuar |
| Novaseq x | 10b (8 korsi) | PE150 | Korsi Korsi e pjesshme | 375 GB / korsi |
| 25b (8 korsi) | PE150 | Korsi Korsi e pjesshme | 1000 GB/korsi | |
| Novaseq 6000 | Qeliza e rrjedhës së PS (2 korsi) | PE250 | Rrjedhë Korsi Korsi e pjesshme | 325-400 m lexon / korsi |
| Qeliza e rrjedhës S4 (4 korsi) | PE150 | Rrjedhë Korsi Korsi e pjesshme | ~ 800 GB / korsi |
Kërkesat e mostrës
| Shuma e të dhënave (x) | Përqendrimi (qpcr/nm) | Vëllim | |
| Sekuencat e korsisë së pjesshme
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Sekuencat e korsisë | Për korsi | ≥ 1.5 nm / pishinë bibliotekare | Μ 25 μl / pishinë bibliotekare |
Përveç përqendrimit dhe sasisë totale, kërkohet edhe një model i përshtatshëm i pikut.
Shënim: Sekuencimi i korsisë së bibliotekave me diversitet të ulët kërkon Phix Spike-In për të siguruar thirrje të fuqishme bazë.
Ne ju rekomandojmë të paraqisni biblioteka të paracaktuara si mostra. Nëse keni nevojë për bmkgene për të kryer bashkimin e bibliotekës, ju lutemi referojuni
Kërkesat e bibliotekës për sekuencat e pjesshme të korsisë.
Madhësia e bibliotekës (Harta e Kulmit)
Kulmi kryesor duhet të jetë brenda 300-450 bp.
Bibliotekat duhet të kenë një kulm të vetëm kryesor, pa ndotje të përshtatësit dhe pa dimers abetare.
Ju lutemi na drejtoni nëse mostrat tuaja nuk plotësojnë kërkesat e materialit fillestar.
Rrjedhë pune e shërbimit
Kontrolli i cilësisë së bibliotekës
Sekuencim
Kontrolli i cilësisë së të dhënave
Dorëzimi i projektit
Raporti i QC i Bibliotekës
Një raport mbi cilësinë e bibliotekës është dhënë para sekuencave, vlerësimit të shumës së bibliotekës dhe copëzimit.
Sekuencimi i Raportit QC
Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e sekuencave.
| ID e mostrës | Bmkid | Raw lexon | Të dhëna të papërpunuara (BP) | Lexime të pastra (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Shpërndarja e cilësisë së bashku në secilin mostër
Figura 2. Shpërndarja e përmbajtjes bazë
Figura 3. Shpërndarja e përmbajtjes së leximit në të dhënat e sekuencave
