Illumina dhe BGI
Veçoritë
●Platformat:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten dhe BGI-DNB-T7
●Mënyrat e renditjes:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrolli i cilësisë së bibliotekave përpara sekuencës
●Renditja e shpërndarjes së të dhënave dhe QC:dërgimi i raportit të QC dhe të dhënave të papërpunuara në formatin fastq pas demultipleksimit dhe filtrimit të leximeve Q30.
Avantazhet e Shërbimit
●Shkathtësia e shërbimeve të renditjes:klienti mund të zgjedhë të renditë sipas korsisë, qelizave rrjedhëse ose sasisë së të dhënave.
●Shkathtësia e platformave:Bibliotekat DNB mund të transferohen në platformat Illumina
●Përvojë e gjerë në platformën e sekuencës Illumina:me mijëra projekte të mbyllura me lloje të ndryshme.
●Dorëzimi i raportit të QC të renditjes:me matjet e cilësisë, saktësinë e të dhënave dhe performancën e përgjithshme të projektit të renditjes.
●Procesi i sekuencës së pjekur:me kohë të shkurtër rrotullimi.
●Kontroll rigoroz i cilësisë: ne zbatojmë kërkesa strikte të QC për të garantuar dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë.
Kërkesat e mostrës*
Renditja e pjesshme e korsive
| Shuma e të dhënave (X) | Përqendrimi (qPCR/nM) | Vëllimi |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Single Lane (Illumina)
| Platforma | Përqendrimi (qPCR/nM) | Vëllimi |
| HiSeq X Dhjetë | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Përveç përqendrimit dhe sasisë totale, kërkohet gjithashtu një model i përshtatshëm i pikut.
Ju lutemi na kontaktoni nëse mostrat tuaja nuk plotësojnë kërkesat e materialit fillestar.
Rrjedha e punës së shërbimit
Kontrolli i cilësisë së bibliotekës
Sekuenca
Kontrolli i cilësisë së të dhënave
Ofrimi i projektit
Raporti i KC të bibliotekës
Një raport mbi cilësinë e bibliotekës ofrohet përpara sekuencës, vlerësimit të sasisë së bibliotekës dhe fragmentimit.
Sekuenca e raportit të QC
Tabela 1. Statistikat mbi renditjen e të dhënave.
| Shembull ID | BMKID | Lexime të papërpunuara | Të dhëna të papërpunuara (bp) | Lexime të pastra (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Shpërndarja e cilësisë përgjatë leximeve në çdo mostër
Figura 2. Shpërndarja e përmbajtjes bazë
Figura 3. Shpërndarja e përmbajtjes së lexuar në të dhënat e renditjes
