Platformë | Madhësia e bibliotekës | Rendimenti i të dhënave teorike (për qelizë) | Saktësi | Aplikime |
Nanopore | 8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cDNA-PCR | 70-90GB/qelizë | 85-92% | Thirrja SV, de novo, sekuencimi me gjatësi të plotë, izo-seq, shënimi i gjeneve, zbulimi i metilimit të ADN-së |
● Përvojë mbi 5 vjet në platformën e sekuencave PacBio me mijëra projekte të mbyllura me specie të ndryshme.
● BMKGENE është një partner zyrtar i Oxford Nanopore, me çertifikim të ARN/ADN të platformës së dyfishtë.
● Ekzistojnë modele kryesore të sekuencuesve me pajisje të plota dhe xhiros të mjaftueshme të sekuencave.
● Bazuar në platformën nanopore, më shumë se 10 hulumtime të kafshëve dhe bimëve denovo janë botuar në revista të njohura ndërkombëtarisht.
Lloji i mostrës | Sasi | Përqendrimi (Qubit ®) | Vëllim | Pastërti | Të tjerët |
ADN gjenomike | Varet nga kërkesa e të dhënave | ≥ 20ng/μl | ≥15 μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5 Kulmi i qartë në 260 nm , pa ndotje | Përqendrimi duhet të matet me qubit dhe qubit/nanopore ≤ 2 |
ARN totale | ≥1.2 μg | ≥100 μg/μl | ≥15 μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ; Pa ndotje | Vlera e Rinit ≥7.5 |
Vlerësimi i cilësisë së të dhënave të mostrës së ADN -së
Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.
Bmkid | i papërpunuar | i papërpunuar | pastroj | Pastrimi në Blejën | pastrim50len | pastrim90len | mantel i pastër | cleanmaxlen | mantel |
ADN_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Vlerësimi i cilësisë së të dhënave të mostrës së ARN -së
Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.
Emrin e filenit | KlientId | Lexues | Bazament | N50 | Gjatësi mesatare | Gjatësi maksimale | Meanqscore |
ARN_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Figura 1. Lexoni shpërndarjen e gjatësisë
Figura 2. Shpërndarja e rezultatit të cilësisë së të dhënave të pastra
Figura 3. Gjatësia dhe rezultati i cilësisë Shpërndarja e të dhënave të pastra