Hyrje në BMKCloud

Produkte

Sekuencimi i ADN-së/ARN-së – Sekuencuesi i Nanoporeve

Sekuencimi ONT është një teknologji sekuencimi sinjalesh elektrike në kohë reale të një molekule të vetme bazuar në nanopore, parimi i sekuencimit të secilës platformë është i njëjtë. ADN/ARN me dy fije lidhet me proteinën nanopore të ngulitur në biofilm dhe shpaloset nën udhëheqjen e proteinës motorike, nën veprimin e ndryshimit të tensionit nga të dyja anët e biofilmit, fijet e ADN/ARN kalojnë nëpër proteinën e kanalit të nanoporeve me një shpejtësi të caktuar. Për shkak të ndryshimeve në vetitë kimike të bazave të ndryshme në fijen e ADN/ARN, kur një bazë e vetme ose molekulë ADN kalon nëpër kanalin e nanoporeve, ajo do të shkaktojë ndryshimin e sinjaleve të ndryshme elektrike. Duke zbuluar dhe korresponduar me këto sinjale, mund të llogariten llojet përkatëse të bazave dhe mund të përfundojë zbulimi në kohë reale i sekuencës.

Na Kontaktoni

Detajet e Shërbimit

Rezultati i Demos

Karakteristikat e detajeve të shërbimit

Platforma	Madhësia e Bibliotekës	Rendimenti i të Dhënave Teorike (Për Qelizë)	Saktësia me një bazë të vetme	Aplikacionet
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultra e gjatë, cDNA-PCR	70-90Gb/Qelizë	85-92%	Thirrja SV, De novo, Sekuencimi i gjatësisë së plotë, Iso-Seq, Annotacioni i gjenit, Zbulimi i metilimit të ADN-së

Avantazhet e Shërbimit

● Mbi 5 vjet përvojë në platformën e sekuencimit PacBio me mijëra projekte të mbyllura me specie të ndryshme.
● BMKGENE është partner zyrtar i Oxford Nanopore, me certifikim ARN/ADN me platformë të dyfishtë.
● Ekzistojnë modele kryesore të sekuencuesve me pajisje të plota dhe rendiment të mjaftueshëm të sekuencimit.
● Bazuar në platformën Nanopore, më shumë se 10 kërkime Denovo mbi kafshët dhe bimët janë botuar në revista me famë ndërkombëtare.

Kërkesat e mostrës

Lloji i mostrës

Shuma

Përqendrim (Qubit ®)

Vëllimi

Pastërtia

Të tjerë

ADN gjenomike

Varet nga Kërkesat e të Dhënave

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Maja e qartë në 260 nm, pa ndotje

Përqendrimi duhet të matet me Qubit dhe Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN totale

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; pa ndotje

Vlera RIN ≥7.5

Fluksi i Punës së Shërbimit

Përgatitja e mostrës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuencimi

Analiza e të dhënave

Zbatimi i projektit

Më parë: Bibliotekat e parapërgatitura të Illumina-s

Tjetra: Sekuencimi i Fragmenteve të Amplifikuara të Lokusit Specifik (SLAF-Seq)

Vlerësimi i Cilësisë së të Dhënave të Mostrës së ADN-së

Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

Vlerësimi i Cilësisë së të Dhënave të Mostrës së ARN-së

Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.

Emri i Skedarit	ID-ja e Klientit	LexoNumin	Numri bazë	N50	Gjatësia Mesatare	Gjatësia Maksimale	MesatarjaQscore
ARN_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12