mRNA-seq (NGS) – De novo

Sekuencimi i ARNm lejon profilizimin e të gjitha transkripteve të ARNm në qeliza në kushte specifike dhe është një teknologji e përdorur gjerësisht në fusha të ndryshme kërkimore. Linja e sekuencimit të ARNm De novo BMKCloud është projektuar për të analizuar bibliotekat e sekuencimit të pasuruara me poli-A kur nuk ka gjenom reference në dispozicion. Linja e sekuencimit fillon me kontrollin e cilësisë, i ndjekur ngade novomontimi i transkripteve dhe përzgjedhja e grupit unigjen. Analiza e strukturës së unigjeneve parashikon sekuencën koduese (CDS) dhe përsëritjet e sekuencave të thjeshta (SSR). Më pas, analiza e shprehjes diferenciale gjen gjene të shprehura në mënyrë diferenciale (DEG) midis kushteve të testuara, e ndjekur nga shënimi funksional dhe pasurimi i DEG-ve për të nxjerrë njohuri biologjike.