Transkriptomi është lidhja midis informacionit gjenetik gjenomik dhe proteomës së funksionit biologjik.Rregullimi i nivelit të transkriptimit është mënyra më e rëndësishme dhe më e studiuar e rregullimit të organizmave.Sekuenca e transkriptomit mund të renditë transkriptomin në çdo moment në kohë ose në çdo kusht, me një rezolucion të saktë në një nukleotid të vetëm. Ai mund të pasqyrojë në mënyrë dinamike nivelin e transkriptimit të gjeneve, njëkohësisht të identifikojë dhe kuantifikojë transkriptet e rralla dhe normale dhe të sigurojë informacionin strukturor të mostra të transkripteve specifike.
Aktualisht, teknologjia e sekuencës së transkriptomit është përdorur gjerësisht në agronomi, mjekësi dhe fusha të tjera kërkimore, duke përfshirë rregullimin e zhvillimit të kafshëve dhe bimëve, përshtatjen mjedisore, ndërveprimin imunitar, lokalizimin e gjeneve, evolucionin gjenetik të specieve dhe zbulimin e sëmundjeve tumorale dhe gjenetike.
