BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produktet

Sekuenca e gjenomit të tërë bimëve/kafshëve

Risekuenca e të gjithë gjenomit, i njohur gjithashtu si WGS, mundëson zbulimin e mutacioneve të zakonshme dhe të rralla në të gjithë gjenomin, duke përfshirë Polimorfizmin Një Nukleotid (SNP), Fshirjen e Futjes (InDel), Variacionin e strukturës (SV) dhe Variacionin e Numrit të Kopjes (CNV). ).SV-të përbëjnë një pjesë më të madhe të bazës së variacionit sesa SNP-të dhe kanë një ndikim më të madh në gjenomin, i cili ka një efekt të rëndësishëm në organizmat e gjallë.Resekuenca e leximit të gjatë lejon identifikimin më të saktë të fragmenteve të mëdha dhe variacioneve të komplikuara, sepse leximet e gjata e bëjnë shumë më të lehtë kalimin e kromozomeve mbi rajone të ndërlikuara, si p.sh.

Platforma: Illumina, PacBio, Nanopore


Detajet e Shërbimit

Rezultati i demonstrimit

Publikimi i veçuar

1.Përparësitë e Shërbimit

Përvojë e gjerë në renditjen e gjenomit për mbi 1000 lloje.

Mbi 800 raste të publikuara me një faktor ndikimi akumulues prej mbi 4000.

Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike mbi thirrjen e variacionit dhe analizën e funksionit.

2. Specifikimet e Shërbimit

Platforma

Librari

Thellësia e rekomanduar e seq

Illumina

PE 150

Për SNP, thirrjet InDel ≥ 10x

Për SV, telefonata CNY ≥ 30x

 

 

Nanopore

 

8 kb

Për SV, telefonata CNY ≥ 20x

Pacbio

CCS

15 kb

Për telefonatat SNP, InDel, SV, CNY ≥ 10x

3. Kërkesat e mostrës

Platforma

Konk.(ng/μL)

 

Shuma (ng)

 

Pastërti

 

Xhel agaroze

 

OD260/280

OD260/230

1. Pastroni brezin kryesor pa ose të kufizuardegradimi i vërejtur në xhel.

2. Nuk ka ose është i kufizuar ndotje me ARN ose proteina

 

Illumina

≥1

≥30

 

-

-

Nanopore

 

≥30

Varet nga rendimenti i të dhënave

10 μg/qelizë

1.7-2.2

≥1.5

Pacbio

CCS

≥50

1.7-2.2

1,8-2,5

4. Analiza e bioinformacionit

wps_doc_3

5. Rrjedha e punës së shërbimit

dorëzimi i mostrës

Dorëzimi i mostrës

Eksperiment pilot

Ekstraktimi i ADN-së

Përgatitja e Bibliotekës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Analiza e të dhënave

数据上传-03

Dorëzimi i të dhënave


  • E mëparshme:
  • Tjetër:

  • 1) Statistikat e hartës së gjenomit

    Tabela 1 Statistikat e rezultatit të hartës

    wps_doc_5

    Figura 1 Shpërndarja e madhësisë së insertit dhe mbulimit të leximeve.

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) Zbulimi i variacionit

    Figura 2 Statistikat dhe shënimet e SNP/INDEL/SV midis mostrave

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    Figura 3 Shpërndarja në të gjithë gjenomin e vatacioneve

    wps_doc_9

    3) Shënimi funksional i variacioneve

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    Komunikimet e natyrës

    Risekuenca e të gjithë gjenomit zbulon origjinën e Brassica napus dhe vendndodhjet gjenetike të përfshira në përmirësimin e tij

    2020

    PNAS

    Origjina evolucionare dhe historia e zbutjes së peshkut të kuq (Carassius auratus)

    2021

    Revista e Bioteknologjisë së Bimëve

    Gjenomet referente të dy specieve të kultivuara të jutës

    2021

    Revista e Bioteknologjisë së Bimëve

    Nënshkrimet gjenomike të alopolyploidit të perimeve dhe farave vajore Brassicajuncea dhe lokacioneve gjenetike që kontrollojnë akumulimin e glukozinolateve

    2019

    Bimë molekulare

    Resekuenca e plotë e gjenomit të një koleksioni mbarëbotëror të ngjitjeve të rapave zbulon bazën gjenetike të divergjencës së tyre ekotip

    2022

    Hulumtimi i Hortikulturës

    Analiza e lidhjes në të gjithë gjenomin ofron njohuri molekulare në ndryshimin natyror të madhësisë së farës së shalqirit

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Studimi i shoqatës në të gjithë gjenomin identifikon variante të GhSAD1 që jep tolerancë ndaj të ftohtit në pambuk

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Studimi i asociacionit në të gjithë gjenomin dhe krahasimi i transkriptomës zbulojnë QTL të reja dhe gjenet kandidate që kontrollojnë madhësinë e petaleve në farat e rapit

    të marrë një kuotë

    Shkruani mesazhin tuaj këtu dhe na dërgoni

    Na dërgoni mesazhin tuaj: