Sekuencimi i ARN-së së vogël - Illumina
Karakteristikat
● Përgatitja e bibliotekës për përzgjedhjen e madhësisë.
● Analiza bioinformatike e përqendruar rreth parashikimit dhe objektivave të miRNA-së.
Avantazhet e Shërbimit
●Ekspertizë e gjerëNe kemi përpunuar mbi 300 mostra, që përfshijnë lloje të ndryshme mostrash. Ne sjellim pasurinë e ekspertizës në çdo projekt.
●Kontroll i rreptë i cilësisëNe zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës deri te përgatitja e bibliotekës, sekuencimi dhe bioinformatika. Monitorimi ynë i kujdesshëm siguron ofrimin e rezultateve me cilësi të lartë vazhdimisht.
●Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike:Ai mundëson identifikimin e miRNA-ve të njohura dhe të reja, identifikimin e objektivave të miRNA-ve dhe shënimin dhe pasurimin përkatës funksional me baza të dhënash të shumta (KEGG, GO).
●Mbështetje pas shitjesNe e kuptojmë sa e rëndësishme është të jesh i pranishëm, prandaj angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes prej 3 muajsh. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekje të projektit, ndihmë në zgjidhjen e problemeve dhe seanca pyetje-përgjigje për t'iu përgjigjur çdo pyetjeje që lidhet me rezultatet.
Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi
| Biblioteka | Platforma | Të dhëna të rekomanduara | Kontroll i të dhënave të cilësisë |
| Madhësia e zgjedhur | Illumina SE50 | 10M-20M lexime | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës:
Nukleotidet:
| Përqendrim (ng/μl) | Sasia (μg) | Pastërtia | Integriteti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Ndotje e kufizuar ose aspak e proteinave ose ADN-së e treguar në xhel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ngritje e kufizuar ose aspak në bazë |
● Bimët:
Rrënjë, kërcell ose petale: 450 mg
Gjethe ose Fara: 300 mg
Fruta: 1.2 g
● Kafshë:
Zemra ose Zorra: 450 mg
Organet e brendshme ose truri: 240 mg
Muskuj: 600 mg
Kockat, flokët ose lëkura: 1.5g
● Artropodët:
Insektet: 9g
Krustacea: 450 mg
● Gjak i plotë: 2 tuba
● Qelizat: 106 qelizat
● Serum dhe Plazmë:6 ml
Dorëzimi i rekomanduar i mostrës
Enë: Tub centrifuge 2 ml (Nuk rekomandohet folia prej kallaji)
Etiketimi i shembullit: Grup+replikim p.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Dërgesa:
1. Akulli i thatë: Mostrat duhet të paketohen në qese dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tuba të qëndrueshme me ARN: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të transportohen në temperaturë ambienti.
Fluksi i Punës së Shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Nxjerrja e ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuencimi
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Bioinformatikë
● Kontroll i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
● Klasifikimi i ARN-së së vogël
● Shprehja e miRNA-së dhe analiza e shprehjes diferenciale
● Shënim i gjenit shënues të miRNA-së dhe gjenit shënues të miRNA-së të shprehur në mënyrë të ndryshme
● Annotacioni i gjenit të synuar dhe pasurimi i funksionit të gjenit miRNA të shprehur në mënyrë të ndryshme
Identifikimi i miRNA-së: struktura dhe thellësia
Shprehja diferenciale e miRNA-së - grupimi hierarkik
Shënimi funksional i objektivit të miRNA-ve të shprehura në mënyrë të ndryshme
Eksploroni përparimet në kërkim të lehtësuara nga shërbimet e sekuencimit të sRNA-së të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Chen, H. et al. (2023) 'Infeksionet virale pengojnë biosintezën e saponinave dhe fotosintezën në Panax notoginseng',Fiziologjia dhe Biokimia e Bimëve, 203, f. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Proteina FREE1 që përmban domenin FYVE të bimës shoqërohet me komponentët e mikroprocesorit për të shtypur biogjenezën e miRNA-së',Raportet e EMBO-së, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MikroARN Ame-Bantam-3p Kontrollon Zhvillimin e Pupalës së Larvave duke Synuar Gjenin 8 të Domeneve të Shumëfishta të Ngjashme me Faktorin e Rritjes Epidermale (megf8) në Bletën e Mjaltit, Apis mellifera',Revista Ndërkombëtare e Shkencave Molekulare, 24(6), f. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analiza e Integruar e MiRNA-së dhe Gjeneve të Lidhura me Cilësinë e Mishit Zbulon se Gga-MiR-140-5p Ndikon në Depozitimin Intramuskular të Yndyrës te Pulat',Fiziologjia dhe Biokimia Qelizore, 46 (6), f. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
