-
Sekuenca e mARN-së me gjatësi të plotë-Nanopore
Sekuenca e ARN-së ka qenë një mjet i paçmuar për analizën gjithëpërfshirëse të transkriptomës.Pa dyshim, sekuenca tradicionale e leximit të shkurtër arriti zhvillime të shumta të rëndësishme këtu.Sidoqoftë, shpesh has kufizime në identifikimin e izoformave me gjatësi të plotë, kuantifikimin, paragjykimin e PCR.
Sekuenca e nanoporeve dallohet nga platformat e tjera të renditjes, në atë që nukleotidet lexohen drejtpërdrejt pa sintezën e ADN-së dhe gjenerojnë lexim të gjatë në dhjetëra kilobazë.Kjo fuqizon leximin e drejtpërdrejtë të transkripteve me gjatësi të plotë dhe trajtimin e sfidave në studimet e nivelit të izoformës.
Platforma：Nanopore PromethION
Librari:cDNA-PCR
-
De novo Sekuenca e transkriptomeve me gjatësi të plotë -PacBio
De novosekuenca e transkriptomës me gjatësi të plotë, e njohur edhe siDe novoIso-Seq merr avantazhet e sekuencuesit PacBio në gjatësinë e leximit, i cili mundëson renditjen e molekulave të cDNA me gjatësi të plotë pa asnjë ndërprerje.Kjo shmang plotësisht çdo gabim të krijuar në hapat e montimit të transkriptit dhe ndërton grupe unigene me rezolucion të nivelit të izoformës.Ky grup unigjen siguron informacion të fuqishëm gjenetik si "gjenom referues" në nivel transkriptomi.Përveç kësaj, duke u kombinuar me të dhënat e sekuencës së gjeneratës së ardhshme, ky shërbim fuqizon një kuantifikimi të saktë të shprehjes së nivelit të izoformës.
Platforma: PacBio Sequel IIBiblioteka: biblioteka e ziles SMRT -
Sekuenca e ARN-së eukariote-Illumina
Sekuenca e mARN-së mundëson profilizimin e të gjitha mARN-ve të transkriptuara nga qelizat në kushte specifike.Është një teknologji e fuqishme për zbulimin e profilit të shprehjes së gjeneve, strukturave gjenike dhe mekanizmave molekularë të disa proceseve biologjike.Deri më sot, sekuenca e mARN-së është përdorur gjerësisht në kërkimet themelore, diagnostikimin klinik, zhvillimin e ilaçeve, etj.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekuenca e mARN-së pa bazë referimi-Illumina
Sekuenca e mARN-së miraton teknikën e sekuencës së gjeneratës së ardhshme (NGS) për të kapur ARN-në (mRNA) të dërguar nga Eukarioti në një periudhë specifike që aktivizojnë disa funksione të veçanta.Transkripti më i gjatë i bashkuar quhej 'Unigene' dhe u përdor si sekuencë referimi për analizat e mëvonshme, që është një mjet efektiv për të studiuar mekanizmin molekular dhe rrjetin rregullator të specieve pa referencë.
Pas grumbullimit të të dhënave të transkriptimit dhe shënimit funksional unigene
(1) Analiza SNP, analiza SSR, parashikimi i CDS dhe struktura e gjenit do të paraformohen.
(2) Do të kryhet sasia e shprehjes unigjene në çdo mostër.
(3) Unigjenet e shprehura në mënyrë diferenciale midis mostrave (ose grupeve) do të zbulohen në bazë të shprehjes unigjene
(4) Grumbullimi, shënimi funksional dhe analiza e pasurimit të unigjeneve të shprehura në mënyrë diferenciale do të kryhet
-
Sekuenca e gjatë jo-koduese-Illumina
ARN-të e gjata jo-koduese (lncARN) janë një lloj molekulash ARN me gjatësi më të madhe se 200 nt, të cilat karakterizohen nga një potencial kodues jashtëzakonisht i ulët.LncARN, si një anëtar kyç në ARN-të jo-koduese, gjendet kryesisht në bërthamë dhe plazmë.Zhvillimi në teknologjinë e sekuencës dhe bioinformtikës mundëson identifikimin e shumë lncARN-ve të reja dhe lidhjen e tyre me funksione biologjike.Dëshmitë akumuluese sugjerojnë se lncARN është e përfshirë gjerësisht në rregullimin epigjenetik, rregullimin e transkriptimit dhe rregullimin pas transkriptimit.
-
Sekuenca e vogël e ARN-së-Illumina
ARN e vogël i referohet një klase të molekulave të ARN-së jo-koduese që janë zakonisht më pak se 200 nt në gjatësi, duke përfshirë mikro ARN (miRNA), ARN me ndërhyrje të vogla (siRNA) dhe ARN ndërvepruese me piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) është një klasë e ARN-së së vogël endogjene me një gjatësi prej rreth 20-24 nt, e cila luan një sërë rolesh të rëndësishme rregullatore në qeliza.miRNA është përfshirë në shumë procese jetësore, të cilat zbulojnë indet - specifike dhe stade - shprehje specifike dhe janë shumë të ruajtura në specie të ndryshme.
-
sekuenca e circARN-Illumina
Sekuenca e plotë e transkriptomit është projektuar për të profilizuar të gjitha llojet e molekulave të ARN-së, duke përfshirë ARN-të koduese (mRNA) dhe jo-koduese (përfshirë lncARN, circARN dhe miARN) të cilat transkriptohen nga qeliza specifike në një kohë të caktuar.Sekuenca e plotë e transkriptomit, e njohur gjithashtu si "sekuenca e ARN-së totale" synon të zbulojë rrjete rregullative gjithëpërfshirëse në nivelin e transkriptomit.Duke përfituar nga teknologjia NGS, sekuenca të të gjithë produkteve të transkriptomës janë të disponueshme për analizën e ceRNA dhe analizën e përbashkët të ARN-së, e cila siguron hapin e parë drejt karakterizimit funksional.Zbulimi i rrjetit rregullator të ceRNA me bazë circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekuenca e tërë transkriptomit – Illumina
Sekuenca e plotë e transkriptomit është projektuar për të profilizuar të gjitha llojet e molekulave të ARN-së, duke përfshirë ARN-të koduese (mRNA) dhe jo-koduese (përfshirë lncARN, circARN dhe miARN) të cilat transkriptohen nga qeliza specifike në një kohë të caktuar.Sekuenca e plotë e transkriptomit, e njohur gjithashtu si "sekuenca e ARN-së totale" synon të zbulojë rrjete rregullative gjithëpërfshirëse në nivelin e transkriptomit.Duke përfituar nga teknologjia NGS, sekuenca të të gjithë produkteve të transkriptomës janë të disponueshme për analizën e ceRNA dhe analizën e përbashkët të ARN-së, e cila siguron hapin e parë drejt karakterizimit funksional.Zbulimi i rrjetit rregullator të ceRNA me bazë circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekuenca e ARN-së prokariotike
Sekuenca e ARN-së prokariotike përdor sekuencën e gjeneratës së ardhshme (NGS) për të zbuluar praninë dhe sasinë e ARN-së në një moment të caktuar, duke analizuar transkriptomin qelizor në ndryshim.Sekuenca e ARN-së prokariote e kompanisë sonë synon në mënyrë specifike prokariotët me gjenoma referencë, duke ju ofruar profilizimin e transkriptomit, analizën e strukturës së gjeneve, etj. Është aplikuar gjerësisht në kërkimin shkencor bazë, kërkimin dhe zhvillimin e barnave dhe më shumë.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekuenca metatranskriptomike
Sekuenca e metatranskriptomës identifikon shprehjen e gjeneve të mikrobeve (si eukariotët ashtu edhe prokariotët) brenda mjediseve natyrore (p.sh. toka, uji, deti, feçet dhe zorrët). Në mënyrë të veçantë, ky shërbim ju lejon të merrni profilizimin e të gjithë shprehjes së gjeneve të komuniteteve komplekse mikrobike, analizën taksonomike të specieve, analiza e pasurimit funksional të gjeneve të shprehura ndryshe dhe më shumë.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
