Поновно секвенцирање целог генома бактерија и гљивица
Пројекти поновног секвенцирања читавог генома бактерија и гљивица су кључни за унапређење микробне геномике омогућавајући комплетирање и поређење микробних генома. Ово олакшава инжењеринг ферментације, оптимизацију индустријских процеса и истраживање путева секундарног метаболизма. Штавише, поновно секвенцирање гљивица и бактерија је кључно за разумевање прилагођавања животне средине, оптимизацију сојева и откривање динамике генетске еволуције, са широким импликацијама у медицини, пољопривреди и науци о животној средини.
Предности услуге
●Биоинформатичка анализа укључује варијантно позивање:Пружање функционалног увида у поново секвенциране геноме.
● Опсежна стручност: Са хиљадама пројеката поновног редоследа микроба који се спроводе годишње, ми доносимо више од деценије искуства, високо квалификован тим за анализу, свеобухватан садржај и одличну подршку након продаје.
●Подршка након продаје:Наша посвећеност се протеже и даље од завршетка пројекта уз период од 3 месеца након продаје. Током овог периода, нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању проблема и сесије питања и одговора да бисмо одговорили на сва питања у вези са резултатима.
Спецификације услуге
| Платформа за секвенцирање | Стратегија секвенцирања | Подаци се препоручују | Контрола квалитета |
| Иллумина НоваСек | ПЕ150 | Дубина од 100к | К30≥85% |
Захтеви за узорке
| Концентрација (нг/µЛ) | Укупна количина (нг) | Запремина (µЛ) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Бактерије: ≥1к107 ћелије
Једноћелијске гљиве: ≥5к106-1к107 ћелије
Макро гљиве: ≥4г
Ток рада услуге
Испорука узорка
Изградња библиотеке
Секуенцинг
Анализа података
Услуге након продаје
Укључује следећу анализу:
- Контрола квалитета података секвенцирања
- Усклађивање са референтним геномом
- Позивање варијанте: СНП и ИнДел
- Вариант Аннотатион
Позивање варијанте: СНП типови
Позивање варијанте: ИнДел расподела дужине
Истражите напредак који омогућава БМКГене-ове услуге поновног секвенцирања микробног генома кроз одабрану колекцију публикација.
Јиа, И. ет ал. (2023) 'Комбиновање транскриптома и поновног секвенцирања читавог генома за скрининг гена отпорности на болести за пшеничну патуљасту стрнаду',Међународни часопис за молекуларне науке, 24(24). дои: 10.3390/ИЈМС242417356.
Јианг, М. ет ал. (2023) 'Метаболизам глукозе контролисан ампицилином манипулише преласком са толеранције на отпорност бактерија',Сциенце Адванцес, 9(10). дои: 10.1126/СЦИАДВ.АДЕ8582/СУППЛ_ФИЛЕ/СЦИАДВ.АДЕ8582_СМ.ПДФ.
Ианг, М. ет ал. (2022) 'Алиидиомарина халалкалипхила сп. нов., халоалкалифилна бактерија изолована из језера соде у аутономном региону Унутрашња Монголија, Кина', Инт. Ј. Сист. Евол.Мицробиол, 72, стр. 5263. дои: 10.1099/ијсем.0.005263.
Зху, З., Ву, Р. и Ванг, Г.-Х. (2024) 'Секвенца генома Стапхилоцоццус непаленсис ЗЗ-2023а, изолованог из Насониа витрипеннис',Најаве микробиолошких ресурса. дои: 10.1128/МРА.00802-23.
