page_head_bg

Производи

секвенцирање цирцРНА-Иллумина

Секвенцирање целог транскриптома је дизајнирано да профилише све типове РНК молекула, укључујући кодирајуће (мРНК) и некодирајуће РНК (укључујући лнцРНА, цирцРНА и миРНА) које специфичне ћелије транскрибују у одређено време.Секвенцирање целог транскриптома, такође познато као „укупно секвенцирање РНК“ има за циљ откривање свеобухватних регулаторних мрежа на нивоу транскриптома.Користећи предности НГС технологије, секвенце целих производа транскриптома су доступне за цеРНА анализу и заједничку РНК анализу, што представља први корак ка функционалној карактеризацији.Откривање регулаторне мреже цеРНА засноване на цирцРНА-миРНА-мРНК.


Детаљи услуге

Биоинформатика

Демо Ресултс

Истраживање случаја

Предности услуге

ØЦирцРНА је у великој корелацији са регулацијом експресије мРНА

ØУчествовао у регулаторном систему цирцРНА - миРНА - мРНА

ØИдентификација и статистика о познатој цирцРНА и новом предвиђању цирцРНА

ØИспорука резултата заснована на БМКЦлоуд-у: Прилагођено рударење података доступно на платформи.

ØУслуге након продаје важе 3 месеца по завршетку пројекта

Захтеви за узорке и достава

Захтеви за пример:

нуклеотиди:

Чистоћа Интегритет Контаминација Износ
ОД260/280≥1,7-2,5;ОД260/230≥0,5-2,5; За биљке: РИН≥6.5;За животиње: РИН≥7;28С/18С≥1.0;ограничена или никаква почетна висина Ограничена или никаква контаминација протеина или ДНК приказана на гелу. Цонц.≥100нг/μл;Запремина ≥ 10 μл;Укупно ≥2μг

Ткиво: Тежина (суво): ≥1 г
*За ткиво мање од 5 мг, препоручујемо да пошаљете флеш замрзнут (у течном азоту) узорак ткива.

Суспензија ћелија: Број ћелија = 3×107
*Препоручујемо да пошаљете замрзнути лизат ћелија.У случају да та ћелија броји мањи од 5×105, препоручује се брзо замрзавање у течном азоту.

Узорци крви:
PA×генеБлоодРНАТубе;
6 мЛТРИзола и 2 мЛ крви (ТРИзол:Крв=3:1)

Препоручена достава узорка
Контејнер: епрувета за центрифугу од 2 мл (не препоручује се лимена фолија)
Означавање узорка: Група+репликација нпр. А1, А2, А3;Б1, Б2, Б3... ...

испорука:
Суви лед: Узорци се морају спаковати у вреће и закопати у суви лед.
РНК стабилне епрувете: Узорци РНК се могу осушити у епрувети за стабилизацију РНК (нпр. РНАстабле®) и послати на собној температури.

Ток рада услуге

logo_01

Дизајн експеримента

logo_02

Испорука узорка

logo_03

Екстракција РНК

logo_04

Изградња библиотеке

logo_05

Секвенцирање

logo_06

Анализа података

logo_07

Услуге након продаје


  • Претходна:
  • Следећи:

  • Биоинформатика

    CircRNA-sequencing-analysis-workflow

    1.ЦирцРНА домаћини

    Пријављено је да већина цирцРНА потиче из ексона, а не из интрона или интергенских региона.Штавише, дистрибуција цирцРНА значајно варира међу хромозомима.Због тога је од велике вредности проценити различите дистрибуције домаћина цирцРНА између различитих узорака, укључујући њихову дистрибуцију на различитим генским регионима и на различитим хромозомима.

     

    Distribution-of-circRNA-host

     

    Дистрибуција цирцРНА домаћина

    2. Анализа кластера на ДЕ-цирцРНА
    Hierarchical-clustering-of-differentially-expressed-circRNAs

    Хијерархијско груписање различито експримираних цирцРНА

    3.ГО напомена о генима домаћинима ДЕ-цирцРНА

    C01_vs_C02

    ГО класификација гена домаћина ДЕ-цирцРНА

    БМК Цасе

    ЦПСФ4 регулише формирање цирцРНА и утишавање гена посредовано микроРНА у хепатоцелуларном карциному

    Објављено: Онкоген,2021

    Кључни резултати

    1. Експресија ЦПСФ4 је појачана у ХЦЦ и та висока експресија ЦПСФ4 је повезана са лошом прогнозом код пацијената са ХЦЦ
    2. ЦПСФ4 смањује нивое цирцРНА, које поседују сигналну секвенцу полиаденилације, а ово смањење цирцРНА смањује акумулацију миРНА и ремети утишавање гена посредовано миРНА у ХЦЦ
    3. Експерименти са ћелијском културом и моделима ксенотрансплантата миша показали су да ЦПСФ4 промовише пролиферацију ХЦЦ ћелија и повећава туморигеност.Штавише, ЦПСФ4 антагонизује тумор супресорски ефекат његове низводне цирцРНА у ХЦЦ

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    нивои миРНА и нивои протеина

    Референца

    Ванг Кс, Донг Ј, Ли Кс, ет ал.ЦПСФ4 регулише формирање цирцРНА и утишавање гена посредовано микроРНК у хепатоцелуларном карциному[Ј].Онцогене.ДОИ: 10.1038/с41388-021-01867-6

    добили Цитат

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: