Платформа | Величина библиотеке | Теоретски принос података (по ћелији) | Појединачна база | Апликације |
Нанопоре | 8КБ, 10КБ, 20КБ, УлтраЛонг, цДНА-ПЦР | 70-90ГБ / ћелија | 85-92% | СВ ЦАЛЛИНГ, ДЕ НОВО, редовно секвенцирање, ИСО-СЕК, Генска напомена, детекција метилације ДНК |
● Преко 5 година искуства на платформи ПАЦБИО секвенцирања са хиљадама затворених пројеката са различитим врстама.
● БМКГЕНЕ је званични партнер Окфорд Нанопореа, са двоструком платформом РНА / ДНК сертификат.
● Постоје маинстреам модели секвенцера са комплетном опремом и довољном протоком секвенцирања.
● Наноси на нанопоре платформу, више од 10 истраживања животиња и биљке денова објављено је у међународно реномираним часописима.
Врста узорка | Износ | Концентрација (Кубит ®) | Запремина | Чистоћа | Други |
ГЕНОМИЧКА ДНК | Зависе од захтева података | ≥20нг / μЛ | ≥15 ул | ОД260 / 280 = 1.7-2.2; ОД260 / 230≥1.5; Јасан врх на 260 нм, нема контаминација | Концентрацију треба мерити Кубитом и Кубит / Нанопоре ≤ 2 |
Тотал РНА | ≥1.2μГ | ≥100μг / μл | ≥15 ул | ОД260 / 280 = 1,7-2.5; ОД260 / 230 = 0,5-2.5; Нема нечијег контаминације | Вредност Рин ≥7.5 |
Процена квалитета података узорак ДНК
Табела 1. Статистика о чистим подацима.
Бмкид | равсекнум | равсумбасе | цлеансекнум | ЦлеанСумбасе | Цлеанн50лен | цлеанн90лен | ЦлеанМеанлен | ЦлеанМаклен | чистоћи |
Дна_бмк01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Процена квалитета података узорака РНА
Табела 1. Статистика о чистим подацима.
Назив датотеке | Клијентодни | Реаднум | Базена | Н50 | Мала дужина | Макленгтх | МеандкСцоре |
Рна_бмк001 | C2 | 8.947.708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | К12 |
Слика 1.. Дистрибуција дужине читања
Слика 2. Дистрибуција о квалитету Сцоре Дистрибуција чистих података
Слика 3.. Дужина и дистрибуција резултата квалитета чистих података