Производи

Секвенцирање ДНК/РНА – Нанопоре секвенцер

Секвенцирање ДНК/РНА – истакнута слика секвенцера нанопора

ОНТ секвенцирање је технологија секвенцирања електричног сигнала у реалном времену са једним молекулом заснована на нанопорама, принцип секвенцирања сваке платформе је исти.Дволанчана ДНК/РНА ће се везати за нанопорозни протеин уграђен у биофилм и одмотати се под вођством моторног протеина, под дејством разлике напона са обе стране биофилма, ДНК/РНА ланци пролазе кроз протеин нанопорног канала на одређеном стопа.Због разлика у хемијским својствима различитих база на ДНК/РНК ланцу, када једна база или молекул ДНК прође кроз канал нанопора, то ће изазвати промену различитих електричних сигнала.Откривањем ових сигнала и одговарајућим њима, могу се израчунати одговарајући базни типови и може се завршити детекција секвенце у реалном времену.

Контактирајте нас

Детаљи услуге

Демо резултат

Детаљи услуге Карактеристике

Платформа	Величина библиотеке	Теоријски принос података (по ћелији)	Прецизност са једном базом	Апликације
Нанопоре	8Кб, 10кб, 20кб, Ултралонг, цДНА-ПЦР	70-90Гб/Целл	85-92%	СВ позивање, Де ново, секвенцирање пуне дужине, Исо-Сек, анотација гена, детекција метилације ДНК

Предности услуге

● Преко 5 година искуства на ПацБио платформи за секвенцирање са хиљадама затворених пројеката са различитим врстама.
● БМКГЕНЕ је званични партнер Окфорд Нанопореа, са двоструком платформом РНА/ДНК сертификацијом.
● Постоје главни модели секвенцера са комплетном опремом и довољном пропусношћу секвенцирања.
● На основу Нанопоре платформе, више од 10 истраживања Деново на животињама и биљкама објављено је у међународно признатим часописима.

Захтеви за узорке

Тип узорка

Износ

Концентрација (Кубит®)

Волуме

Чистоћа

Други

Геномска ДНК

Зависи од захтева за подацима

≥20нг/μл

≥15μл

ОД260/280=1,7-2,2;

ОД260/230≥1,5；

Јасан врх на 260 нм, без контаминације

Концентрацију треба мерити помоћу Кубит-а и Кубит/Нанопоре ≤ 2

Укупна РНК

≥1.2μг

≥100μг/μл

≥15μл

ОД260/280=1,7-2,5;

ОД260/230=0,5-2,5；без контаминације

РИН вредност ≥7,5

Ток рада услуге

Припрема узорка

Изградња библиотеке

Секуенцинг

Анализа података

Испорука пројекта

Претходна: ДНК/РНА секвенцирање – Иллумина секвенцер

Следећи: Специфично локусно појачано секвенцирање фрагмената (СЛАФ-Сек)

Процена квалитета података узорка ДНК

Табела 1. Статистика чистих података.

БМКИД	равСекНум	равСумБасе	цлеанСекНум	цлеанСумБасе	цлеанН50Лен	цлеанН90Лен	цлеанМеанЛен	цлеанМакЛен	цлеанМеанКуал
ДНА_БМК01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

Процена квалитета података узорка РНК

Табела 1. Статистика чистих података.

Назив документа	ИД клијента	РеадНум	БасеНум	Н50	МеанЛенгтх	Максимална дужина	МеанКсцоре
РНА_БМК001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	К12