ØСа великим искуством: Преко 200.000 узорака је обрађено у БМК-у који покривају различите типове узорака, укључујући културу ћелија, ткиво, телесну течност, итд. и преко 7.000 мРНА-Сек пројеката затворених који покривају различите области истраживања.
ØСтроги систем контроле квалитета: Основне тачке контроле квалитета кроз све кораке укључујући припрему узорака, припрему библиотеке, секвенцирање и биоинформатику су под помним надзором како би се пружили резултати високог квалитета.
ØДоступне су више база података за означавање функција и студије обогаћивања ради испуњавања различитих истраживачких циљева.
ØУслуге након продаје: Услуге након продаје важе 3 месеца по завршетку пројекта, укључујући праћење пројекта, решавање проблема, питања и одговоре о резултатима итд.
Библиотека | Стратегија секвенцирања | Подаци се препоручују | Контрола квалитета |
Поли А обогаћен | Иллумина ПЕ150 | 6 Гб | К30≥85% |
нуклеотиди:
Чистоћа | Интегритет | Износ |
ОД260/280≥1,7-2,5 ОД260/230≥0,5-2,5Ограничена или никаква контаминација протеина или ДНК приказана на гелу. | За биљке: РИН≥6,5;За животиње: РИН≥7;28С/18С≥1,0;ограничено или без почетне надморске висине | Цонц.≥30 нг/μл;Запремина ≥ 10 μл;Укупно ≥ 1,5 μг |
Ткиво: Тежина (суво):≥1 г
*За ткиво мање од 5 мг, препоручујемо да пошаљете флеш замрзнут (у течном азоту) узорак ткива.
ћелијска суспензија:Број ћелија = 3×106- 1×107
*Препоручујемо да пошаљете замрзнути лизат ћелија.У случају да је та ћелија мањи од 5×105, препоручује се брзо замрзавање у течном азоту, што је пожељно за микро екстракцију.
Узорци крви:Запремина≥1 мл
микроорганизам:Маса ≥ 1 г
Контејнер: епрувета за центрифугу од 2 мл (не препоручује се лимена фолија)
Означавање узорка: Група+репликација нпр. А1, А2, А3;Б1, Б2, Б3... ...
испорука:
Биоинформатика
еукариотски ток рада анализе секвенцирања мРНА
Биоинформатика
ØКонтрола квалитета сирових података
ØРеферентно поравнање генома
ØАнализа структуре транскрипта
ØКвантификација израза
ØАнализа диференцијалног израза
ØАнотација и обогаћивање функција
1.Крива засићења података мРНА
2.Анализа диференцијалне експресије-Вулкански дијаграм
3.КЕГГ напомена на ДЕГ
4.ГО класификација на ДЕГ