Тјелена дужина мРНА секвенцирање-нанопоре
Карактеристике
● Ухватите поли-а МРНА праћена синтезом цДНА и припрема библиотеке
● Секвенција транскрипата у целости
● Биоинформатична анализа на основу поравнања референтног генома
● Биоинформатична анализа укључује не само израз на нивоу гена и изоформе, већ и анализу ЛНЦРНА, Ген Фусионс, поли-аденилацију и структуру гена
Предности услуга
●Квантификација експресије на нивоу изоформе: Омогућавање детаљне и тачне анализе израза, откривање промена која се може маскирати приликом анализе целог генског израза
●Смањени захтеви података:У поређењу са редоследом следеће генерације (НГС), нанопоре секвенцирање показује ниже захтеве података, омогућавајући еквивалентне нивое засићења квантификације гена експресије са мањим подацима.
●Виша тачност квантификације експресије: И на нивоу гена и изоформе
●Идентификација додатних транскриптских информација: Алтернативна полиаденилација, фузијски гени и ЛЦНРНА и њихови циљни гени
●Опсежна стручност: Наш тим доноси богатство искуства у сваки пројекат, што је завршио преко 850 нанопоре пројеката са целокупним транскриптом и обрађује се преко 8.000 узорака.
●Подршка за после продаје: Наша посвећеност се проширује изван завршетка пројекта са тромесечном роком након продаје. За то време нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању помоћи и питања и питања и питања за решавање било којег упита везаних за резултате.
Узорак захтева и испорука
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препоручује се подаци | Контрола квалитета |
| Поли обогаћен | Иллумина пе150 | 6/12 ГБ | Просечни резултат квалитета: К10 |
Узорак захтева:
Нуклеотиди:
| Конц. (НГ / μЛ) | Износ (μг) | Чистоћа | Интегритет |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | ОД260 / 280 = 1,7-2.5 ОД260 / 230 = 0.5-2.5 Ограничена или без загађења протеина или ДНК приказана на гелу. | За биљке: РИН≥7.0; За животиње: РИН≥7.5; 5.012С / 18С≥1.0; Ограничена или без основне висине |
● Биљке:
Корен, стабљика или латица: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Воће: 1,2 г
● Животиња:
Срце или црева: 300 мг
Висцера или мозак: 240 мг
Мишус: 450 мг
Кости, коса или кожа: 1Г
● Артроподс:
Инсекти: 6г
Црустацеа: 300 мг
● цела крв: 1 цев
● ћелије: 106 ћелије
Препоручена испорука узорка
Контејнер: 2 мл Центрифуга цев (Тин фолија се не препоручује)
Означавање узорка: Група + поновна реликација, нпр. А1, А2, А3; Б1, Б2, Б3.
Пошиљка:
1. суви лед: узорци морају бити упаковани у кесе и закопане у сувом леду.
2 РНАПДАБЛЕ ЦЕПОВЕ: РНА узорци се могу осушити у цијеви РНА стабилизације (нпр. Рнастабле®) и испоручује се на собној температури.
Сервисни радни проток
Нуклеотиди:
Достава узорака
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Сервисни радни проток
Ткиво:
Дизајн експеримента
Достава узорака
РНА екстракција
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
● Обрада рава података
● Идентификација транскрипта
● Алтернативно спајање
● Квантификација експресије на нивоу гена и ниво изоформе
● Анализа диференцијалног израза
● Функционална напомена и обогаћивање (дег и дечије)
Алтернативно анализа спајања
Алтернативна анализа полиаденилације (АПА)
Предвиђање ЛнЦРНА
Напомена романа гена
Групирање дечијих
Нетворке протеина протеина у дег
Истражите напредне напредности који су омогућили БМКгене'с Нанопоре у услугама МРНА РАННА РАННА ТРЕНУТНОМ РАНУ путем куриране збирке публикација.
Гонг, Б. ет ал. (2023) 'Епигенетска и транскрипциона активација секретоторне киназе ФАМ20Ц као онкогена у Глиома', Часопис генетике и геномика, 50 (6), стр. 422-433. Дои: 10.1016 / Ј.ЈГГ.2023.01.008.
Он, З. ет ал. (2023) 'Редослед транскрипта пуне дужине лимфоцита Одговара на ИФН-γ открива имунолошки одговор ТХ1-искривеног у Флоундер-у (Паралицхтхис Оливацеус)', риба и имунологију шкољкања, 134, стр. 108636 Дои: 10.1016 / Ј.ФСИ.2023.108636.
МА, И. ет ал. (2023) 'компаративна анализа поступака ПАЦБИО-а и ОНТ РНА за секвенцирање за немопилем Номураи отров, геномика, 115 (6), стр. 110709 Дои: 10.1016 / Ј.ИГЕНО.2023.110709.
Иу, Д. и др. (2023.) 'Нано-СЕК анализа открива различиту функционалну тенденцију између егзозома и микровисина добијених од ХУМСЦ', истраживања и терапије матичних ћелија, 14 (1), стр. 1-13. Дои: 10.1186 / С13287-023-03491-5 / Табеле / 6.
