Гљивични геном
Предности услуге
● Доступне су вишеструке стратегије секвенцирања за различите циљеве истраживања
● Високо искуство у састављању генома гљива са преко 10.000 састављених генома са пеном.
● Професионални тим за техничку подршку након продаје који испуњава специфичније потребе истраживања.
Спецификације услуге
| Услуга | Стратегија секвенцирања | Квалитет загарантован | Процењено време обраде |
| Гљивична фина карта | Иллумина 50Кс+Нанопоре 100Кс | Цонтиг Н50≥2 Мб | 35 радних дана |
| ПацБио ХиФи 30Кс | |||
| Гљивична пене-комплетна мапа | Иллумина 50Кс+Нанопоре 100Кс(Пацбио ХиФи 30Кс)+Хи-Ц 100Кс | Однос сидрења хромозома >90% | 45 радних дана |
Биоинформатичке анализе
● Контрола квалитета сирових података
● Склапање генома
● Анализа компоненти генома
● Ознака функције гена
● Компаративна геномска анализа
Захтеви за узорке и достава
Захтеви за пример:
ЗаДНК екстракти:
| Тип узорка | Износ | Концентрација | Чистоћа |
| ДНК екстракти | > 1,2 μг | > 20 нг/μл | ОД260/280= 1,6-2,5 |
За узорке ткива:
| Тип узорка | Препоручени третман узорка | Чување и отпрема узорка |
| Једноћелијска гљива | Посматрајте квасац под микроскопом и сакупите га у експоненцијалној фази Пренесите културу (која садржи приближно 3-4,5е9 ћелија) у епенддорф од 1,5 или 2 мл.(Настави на леду) Центрифугирајте епрувету 1 мин на 14000 г да бисте прикупили бактерије и пажљиво уклонили супернатант Затворите епрувету и замрзните бактерије у течном азоту најмање 1-3 х.Чувајте епрувету у фрижидеру на -80 ℃. | Замрзните узорке у течном азоту 3-4 сата и чувајте у течном азоту или -80 степени до дуготрајне резервације.Потребна је испорука узорка са сувим ледом. |
| Макро гљива | Препоручује се ткиво у фази активног раста. Исперите ткиво водом без ендотоксина, а затим 70% етоналом. Сачувајте узорак у крио-епруветама. |
Ток рада услуге
Испорука узорка
Изградња библиотеке
Секуенцинг
Анализа података
Услуге након продаје
1.Цирцос дијаграм на гљивичне геномске компоненте
2.Упоредна геномичка анализа: Филогенетско стабло
