Секвенцирање метатранскриптома
Сервице Феатурес
● исцрпљивање рРНК праћено усмереном припремом библиотеке мРНК.
● Секвенцирање на Иллумина НоваСек.
Предности услуге
●Проучите промене сложених микробних заједница:Ово се дешава на нивоу транскрипције и истражује потенцијалне нове гене.
●Објашњавање интеракције микробне заједнице са домаћином или окружењем.
●Свеобухватна биоинформатичка анализа: Ово пружа увид у таксономске и функционалне саставе заједнице, као и анализу диференцијалне експресије гена.
●Опсежна генетска анотација:Коришћење ажурираних база података о функцијама гена за информативне информације о експресији гена микробних заједница.
●Подршка након продаје:Наша посвећеност се протеже и даље од завршетка пројекта уз период од 3 месеца након продаје. Током овог периода, нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању проблема и сесије питања и одговора да бисмо одговорили на сва питања у вези са резултатима.
Спецификације услуге
| Платформа за секвенцирање | Стратегија секвенцирања | Подаци се препоручују | Контрола квалитета података |
| Иллумина НоваСек | ПЕ150 | 12Гб | К30≥85% |
Захтеви за узорке
| Концентрација (нг/µЛ) | Укупна количина (µг) | Запремина (µЛ) | ОД260/280 | ОД260/230 | РИН |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Ток рада услуге
Испорука узорка
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Укључује следећу анализу:
● Контрола квалитета података секвенцирања
● Склапање транскрипта
● Таксономска анотација и бројност
● Функционална напомена и обиље
● Квантификација израза и диференцијална анализа
Таксономска дистрибуција сваког узорка:
Анализа бета разноврсности: УПГМА
Функционална напомена – ГО обиље
Обиље диференцијалне таксономије – ЛЕФСЕ
Истражите напредак који омогућава БМКГене-ове услуге секвенцирања мета транскриптомике кроз одабрану колекцију публикација.
Лу, З. ет ал. (2023) 'Толеранција киселине бактерија које користе лактат из реда Бацтероидалес доприноси превенцији ацидозе у румену код коза прилагођених на исхрану са високим садржајем концентрата',Исхрана животиња, 14, стр. 130–140. дои: 10.1016/Ј.АНИНУ.2023.05.006.
Сонг, З. и др. (2017) 'Разкривање основне функционалне микробиоте у традиционалној ферментацији у чврстом стању помоћу ампликона високе пропусности и метатранскриптомског секвенцирања',Границе у микробиологији, 8 (ЈУЛ). дои: 10.3389/ФМИЦБ.2017.01294/ФУЛЛ.
Ванг, В. ет ал. (2022) 'Нови миковируси откривени из метатранскриптомског истраживања фитопатогене алтернарије гљиве',Вируси, 14(11), стр. 2552. дои: 10.3390/В14112552/С1.
Веи, Ј. ет ал. (2022) 'Паралелна анализа метатранскриптома открива деградацију секундарних метаболита биљака од стране буба и њихових симбионта у цревима',Молекуларно Екологија, 31(15), стр. 3999–4016. дои: 10.1111/МЕЦ.16557.
