Мала РНК секвенцирање-Иллумина
Карактеристике
● Избор величине РНК пре припреме библиотеке
● Биоинформатичка анализа усредсређена на предвиђање миРНА и њихових циљева
Предности услуге
●Свеобухватна биоинформатичка анализа:омогућава идентификацију познатих и нових миРНА, идентификацију циљева миРНА и одговарајућу функционалну анотацију и обогаћивање са више база података (КЕГГ, ГО)
●Ригорозна контрола квалитета: имплементирамо кључне контролне тачке у свим фазама, од припреме узорака и библиотеке до секвенцирања и биоинформатике.Овај педантан надзор осигурава испоруку конзистентно висококвалитетних резултата.
●Подршка након продаје: Наша посвећеност се протеже даље од завршетка пројекта са 3-месечним периодом након продаје.Током овог периода, нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању проблема и сесије питања и одговора да бисмо одговорили на сва питања у вези са резултатима.
●Ектенсиве Екпертисе: са евиденцијом успешног затварања више пројеката сРНА који покривају преко 100 врста у различитим истраживачким доменима, наш тим доноси богато искуство у сваки пројекат.
Захтеви за узорке и достава
| Библиотека | Платформа | Препоручени подаци | КЦ података |
| Одабрана величина | Иллумина СЕ50 | 10М-20М читања | К30≥85% |
Захтеви за пример:
нуклеотиди:
| Конц. (нг/μл) | Количина (μг) | Чистоћа | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | ОД260/280=1,7-2,5 ОД260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација протеина или ДНК приказана на гелу. | РИН≥6,5; 5.0≥28С/18С≥1.0; ограничена или никаква почетна висина |
● Биљке:
Корен, стабљика или латица: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Воће: 1,2 г
● Животиња:
Срце или црева: 450 мг
Унутрашњи органи или мозак: 240 мг
Мишићи: 600 мг
Кости, коса или кожа: 1,5 г
● Артроподи:
Инсекти: 9г
Ракови: 450 мг
● Пуна крв: 2 цеви
● Ћелије: 106 ћелије
● Серум и плазма:6 мЛ
Препоручена достава узорка
Контејнер:
2 мл епрувета за центрифугу (не препоручује се лимена фолија)
Означавање узорка: Група+репликација нпр. А1, А2, А3;Б1, Б2, Б3 ... ...
испорука:
1. Суви лед: Узорци се морају спаковати у вреће и закопати у суви лед.
2. РНК стабилне епрувете: Узорци РНК се могу осушити у епрувети за стабилизацију РНК (нпр. РНАстабле®) и послати на собној температури.
Ток рада услуге
Дизајн експеримента
Испорука узорка
Екстракција РНК
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Биоинформатика
Идентификација миРНА: структура и дубина
Диференцијална експресија миРНА – хијерархијско груписање
Функционална анотација циља различито експримираних миРНА
Истражите напредак у истраживању који омогућава БМКГене-ове услуге секвенцирања сРНА кроз одабрану колекцију публикација.
Цхен, Х. ет ал.(2023) 'Вирусне инфекције инхибирају биосинтезу и фотосинтезу сапонина у Панак нотогинсенг', Плант Пхисиологи анд Биоцхемистри, 203, стр.108038. дои: 10.1016/Ј.ПЛАПХИ.2023.108038.
Ли, Х. ет ал.(2023) „Протеин ФРЕЕ1 који садржи домен ФИВЕ биљке повезује се са компонентама микропроцесора ради сузбијања биогенезе миРНА“, извештава ЕМБО, 24(1).дои: 10.15252/ЕМБР.202255037/СУППЛ_ФИЛЕ/ЕМБР202255037-СУП-0004-СДАТАФИГ4.ТИФ.
Иу, Ј. ет ал.(2023) „МикроРНА Аме-Бантам-3п контролише развој кукуљице ларве циљајући на више гена 8 сличних епидермалног фактора раста (мегф8) у медоносној пчела, Апис меллифера“, Међународни часопис за молекуларне науке, 24(6), стр. .5726. дои: 10.3390/ИЈМС24065726/С1.
Зханг, М. ет ал.(2018) „Интегрисана анализа МиРНА и гена повезаних са квалитетом меса открива да Гга-МиР-140-5п утиче на интрамускуларно таложење масти код пилића“, Целлулар Пхисиологи анд Биоцхемистри, 46(6), стр. 2421–2433.дои: 10.1159/000489649.
