page_head_bg

Производи

Секвенцирање малих РНК-Иллумина

Мала РНК се односи на класу некодирајућих РНК молекула који су обично краћи од 200 нт у дужини, укључујући микро РНК (миРНА), малу интерферентну РНК (сиРНА) и РНК у интеракцији са пиви (пиРНА).

МикроРНА (миРНА) је класа ендогене мале РНК дужине од око 20-24нт, која игра низ важних регулаторних улога у ћелијама.миРНА је укључена у многе животне процесе који откривају ткиво – специфично и стадијумско – специфичну експресију и високо очувану код различитих врста.


Детаљи услуге

Биоинформатика

Демо Ресултс

Истраживање случаја

Предности услуге

Øпрва база на 5' крају има снажну преференцију за У да добије специфичне РНК
Øпредвиђање циљног гена миРНА
ØПодаци се користе за заједничку анализу са мРНА
Øдиференцијална експресија миРНА
Øпредвиђање циљног гена миРНА
ØИспорука резултата заснована на БМКЦлоуд-у: Прилагођено рударење података доступно на платформи.
ØУслуге након продаје важе 3 месеца по завршетку пројекта

Захтеви за узорке и достава

Захтеви за пример:

нуклеотиди:

Чистоћа Интегритет Контаминација Износ
ОД260/280≥1,7-2,5; ОД260/230≥0,5-2,5; За биљке: РИН≥6,5;За животиње: РИН≥7;28С/18С≥1.0;ограничена или никаква почетна висина Ограничена или никаква контаминација протеина или ДНК приказана на гелу. Цонц.≥300 нг/μл;Запремина ≥ 10 μл;Укупно ≥ 3 μг

Ткиво: Тежина (суво): ≥1 г
*За ткиво мање од 5 мг, препоручујемо да пошаљете флеш замрзнут (у течном азоту) узорак ткива.

Суспензија ћелија: Број ћелија = 3×107
*Препоручујемо да пошаљете замрзнути лизат ћелија.У случају да та ћелија броји мањи од 5×105, препоручује се брзо замрзавање у течном азоту.

Узорци крви:
ПА×генеБлоодРНАТубе;
6мЛТРИзола и 2мЛ крви (ТРИзол:Крв=3:1)

Препоручена достава узорка

Контејнер:
2 мл епрувета за центрифугу (не препоручује се лимена фолија)
Означавање узорка: Група+репликација нпр. А1, А2, А3;Б1, Б2, Б3... ...

испорука:
1. Суви лед: Узорци се морају спаковати у вреће и закопати у суви лед.
2. РНК стабилне епрувете: Узорци РНК се могу осушити у епрувети за стабилизацију РНК (нпр. РНАстабле®) и послати на собној температури.

Ток рада услуге

logo_01

Дизајн експеримента

logo_02

Испорука узорка

logo_03

Екстракција РНК

logo_04

Изградња библиотеке

logo_05

Секвенцирање

logo_06

Анализа података

logo_07

Услуге након продаје


  • Претходна:
  • Следећи:

  • Биоинформатика

    CircRNA-sequencing-analysis-workflow

    1.миРНА идентификација

    Сваки кандидат прекурсор нових миРНА које предвиђа миРДееп2 има пдф слику која показује његову структуру и дубину секвенцирања.

     miRNA-precursor-structure-and-sequencing-depth

    структура прекурсора миРНА и дубина секвенцирања

    2.КЕГГ Обогаћивање ДЕ-миРНА циљаних гена

    У овој сесији, Биомаркер је прво испитао да ли су путеви прекомерно представљени са ДЕ-миРНА циљаним генима.У одређивању степена обогаћивања и значаја пута примењени су фактори обогаћивања и Фишер тест.Једначина прорачуна обогаћивања је приказана у наставку.

    KEGG-pathway-enrichment-on-DE-miRNA-targeted-genes

    Обогаћивање КЕГГ пута на ДЕ-миРНА циљаним генима

    3. ГО анализа обогаћивања на ДЕ-миРНА циљаним генима

    цлустерПрофилер је коришћен у анализи ГО обогаћивања на ДЕ-миРНА циљаним генима.Усмерени ациклични граф обогаћених појмова је генерисан да покаже хијерархијску структуру појмова.На слици, смер стрелица представља инклузивне односе између појмова, односно чворови су специфичнији од својих горњих чворова.Усмерени ацилни графикон ДЕ-миРНА циљаних гена приказан је на слици испод.

    TopGO-directed-acyclic-graph-of-DE-miRNA-targeted-genes

    ТопГО усмерен ациклични граф ДЕ-миРНА циљаних гена

    БМК Цасе

    Интегрисана анализа МиРНА и гена повезаних са квалитетом меса открива да Гга-МиР-140-5п утиче на интрамускуларно таложење масти код пилића

    Објављено:Ћелијска физиологија и биохемија,2018

    Кључни резултати

    Кокошке у касном периоду несности показале су ниже глобалне нивое експресије миРНА него младе кокоши.
    Изграђена је регулаторна мрежа мирНА-мрна која може утицати на квалитет меса
    гга-миР-140-5п промовише диференцијацију адипоцита тако што наниже регулише РКСРГ.

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    гга-миР-140-5п промовише интрамускуларну диференцијацију преадипоцита пилетине циљајући 3'УТР РКСРГ

    Референца

    Зханг М, Ли ДХ, Ли Ф, ет ал.Интегрисана анализа МиРНА и гена повезаних са квалитетом меса открива да Гга-МиР-140-5п утиче на интрамускуларно таложење масти код пилића[Ј].Целлулар Пхисиологи анд Биоцхемистри, 2018: 2421-2433.ДОИ: 10.1159/000489649

    добили Цитат

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: