BMKCloud Log in
条形баннер-03

Производи

Специфично локусно појачано секвенцирање фрагмената (СЛАФ-Сек)

Генотипизација високе пропусности, посебно на великој популацији, је фундаментални корак у студијама генетских асоцијација, који пружа генетску основу за откривање функционалних гена, еволуциону анализу, итд. ) се уводи како би се минимизирали трошкови секвенцирања по узорку, а да би се одржала разумна ефикасност у откривању генетских маркера.Ово се обично постиже издвајањем рестрикционог фрагмента унутар датог опсега величине, који се назива библиотека редуковане репрезентације (РРЛ).Секвенцирање фрагмента појачаног специфичног локуса (СЛАФ-Сек) је саморазвијена стратегија за СНП генотипизацију са или без референтног генома.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа


Детаљи услуге

Демо Ресултс

Феатуред Публицатионс

Детаљи услуге

Тецхницал Сцхеме

111

Процес рада

流程图

Предности услуге

Висока ефикасност откривања маркера- Технологија секвенцирања високе пропусности помаже СЛАФ-Сек-у у откривању стотина хиљада ознака унутар целог генома.

Ниска зависност од генома- Може се применити на врсте са или без референтног генома.

Дизајн флексибилне шеме- Једно-ензимска, двострука ензимска, мулти-ензимска пробава и разне врсте ензима, сви се могу одабрати како би задовољили различите циљеве истраживања или врсте.Пре-евалуација у силикону се користи да би се обезбедио оптималан дизајн ензима.

Ефикасно ензимско варење- Предексперимент је спроведен ради оптимизације услова, што формални експеримент чини стабилним и поузданим.Ефикасност сакупљања фрагмената може достићи преко 95%.

Равномерно распоређене СЛАФ ознаке- СЛАФ ознаке су у највећој мери равномерно распоређене у свим хромозомима, постижући у просеку 1 СЛАФ на 4 кб.

Ефикасно избегавање понављања- Репетитивна секвенца у СЛАФ-Сек подацима је смањена на мање од 5%, посебно код врста са високим нивоом понављања, као што су пшеница, кукуруз, итд.

Дугогодишње искуство- Преко 2000 затворених СЛАФ-Сек пројеката на стотине врста које покривају биљке, сисаре, птице, инсекте, водене организме итд.

Саморазвијен биоинформатички ток рада- БМКГЕНЕ је развио интегрисани биоинформатички радни ток за СЛАФ-Сек како би се осигурала поузданост и тачност крајњег резултата.

 

Спецификације услуге

 

Платформа

Конц. (нг/гл)

Укупно (ug)

ОД260/280

Иллумина НоваСек

>35

>1.6(Волум>15μl)

1.6-2.5

Напомена: Три узорка, сваки са три шеме ензима, биће изведена за пре-експеримент.

Препоручена стратегија секвенцирања

Дубина секвенцирања: 10Кс/Таг

Величина генома

Препоручене СЛАФ ознаке

< 500 Мб

100К или ВГС

500 Мб- 1 Гб

100 К

1 Гб -2 Гб

200 К

Џиновски или сложени геноми

300 - 400 хиљада

 

Апликације

 

Препоручено

Популациона скала

 

Стратегија секвенцирања и дубина

 

Дубина

 

Ознака број

 

ГВАС

 

Број узорка ≥ 200

 

10Кс

 

 

 

 

 

Према

величина генома

 

Генетска еволуција

 

Појединци сваке

подгрупа ≥ 10;

укупно узорака ≥ 30

 

10Кс

 

Препоручена достава узорка

Контејнер: епрувета за центрифугирање од 2 мл

За већину узорака препоручујемо да се не чувају у етанолу.

Означавање узорка: Узорци морају бити јасно означени и идентични са достављеним обрасцима са информацијама о узорку.

Испорука: Суви лед: Узорци се прво морају спаковати у вреће и закопати у суви лед.

Ток рада услуге

Узорак КЦ
Пилот експеримент
СЛАФ експеримент
Припрема библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје

Узорак КЦ

Пилот експеримент

СЛАФ-експеримент

Припрема библиотеке

Секвенцирање

Анализа података

Услуге након продаје


  • Претходна:
  • Следећи:

  • 1. Статистика резултата карте

    имаге1

    А1

    2. Развој СЛАФ маркера

    А2

    3. Белешка варијације

    А3

    Година

    Јоурнал

    IF

    Наслов

    Апликације

    2022

    Комуникације у природи

    17.694

    Геномска основа гига-хромозома и гига-генома дрвећа божура

    Паеониа остии

    СЛАФ-ГВАС

    2015

    Нови фитолог

    7.433

    Отисци припитомљавања усидре геномске регионе од агрономског значаја

    соја

    СЛАФ-ГВАС

    2022

    Часопис за напредна истраживања

    12.822

    Вештачке интрогресије Госсипиум барбаденсе на нивоу генома у Г. хирсутум

    откривају супериорне локусе за истовремено побољшање квалитета и приноса памучних влакана

    особине

    СЛАФ-Еволуциона генетика

    2019

    Молецулар Плант

    10.81

    Популациона геномска анализа и Де Ново скупштина откривају порекло корова

    Пиринач као еволуциона игра

    СЛАФ-Еволуциона генетика

    2019

    Природна генетика

    31.616

    Секвенца генома и генетска разноликост обичног шарана, Ципринус царпио

    СЛАФ-Линкаге мап

    2014

    Природна генетика

    25.455

    Геном култивисаног кикирикија пружа увид у кариотипове махунарки, полиплоид

    еволуција и припитомљавање усева.

    СЛАФ-Линкаге мап

    2022

    Плант Биотецхнологи Јоурнал

    9.803

    Идентификација СТ1 открива селекцију која укључује стопирање морфологије семена

    и садржај уља током припитомљавања соје

    СЛАФ-Маркер развој

    2022

    Међународни часопис за молекуларне науке

    6.208

    Идентификација и развој ДНК маркера за Вхеат-Леимус моллис 2Нс (2Д)

    Дисомична замена хромозома

    СЛАФ-Маркер развој

    добили Цитат

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: