-
Секвенцирање мРНА пуне дужине-Нанопоре
РНК секвенцирање је било непроцењиво средство за свеобухватну анализу транскриптома.Без сумње, традиционално секвенцирање кратког читања овде је постигло бројне важне помаке.Ипак, често наилази на ограничења у идентификацији изоформе пуне дужине, квантификацији, ПЦР пристрасности.
Секвенцирање нанопора се разликује од других платформи за секвенцирање по томе што се нуклеотиди читају директно без синтезе ДНК и генерише дуго читање на десетинама килобаза.Ово омогућава директно читање укрштањем транскрипата пуне дужине и суочавање са изазовима у студијама на нивоу изоформе.
Платформа:Нанопоре ПрометхИОН
библиотека:цДНА-ПЦР
-
Де ново Секвенцирање транскриптома пуне дужине -ПацБио
Де новосеквенцирање транскриптома пуне дужине, такође познато каоДе новоИсо-Сек користи предности ПацБио секвенцера у дужини читања, што омогућава секвенцирање цДНК молекула пуне дужине без икаквих прекида.Ово у потпуности избегава све грешке настале у корацима састављања транскрипта и конструише унигене скупове са резолуцијом на нивоу изоформе.Овај унигенски скуп пружа моћне генетске информације као „референтни геном“ на нивоу транскриптома.Поред тога, у комбинацији са подацима секвенцирања следеће генерације, ова услуга омогућава тачну квантификацију експресије на нивоу изоформе.
Платформа: ПацБио Секуел ИИБиблиотека: СМРТ звоно библиотека -
Секвенцирање еукариотске мРНК-Иллумина
Секвенцирање мРНК омогућава профилисање свих мРНК транскриптованих из ћелија под специфичним условима.То је моћна технологија за откривање профила генске експресије, генских структура и молекуларних механизама одређених биолошких процеса.До данас, секвенцирање мРНА је широко коришћено у фундаменталним истраживањима, клиничкој дијагностици, развоју лекова итд.
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
-
Нереферентно секвенционирање мРНК-Иллумина
Секвенцирање мРНК усваја технику секвенцирања следеће генерације (НГС) за хватање гласничке РНК (мРНК) из Еукариота у одређеном периоду када се неке посебне функције активирају.Најдужи транскрипт спојен је назван 'Унигене' и коришћен је као референтна секвенца за накнадну анализу, што је ефикасно средство за проучавање молекуларног механизма и регулаторне мреже врсте без референце.
Након састављања података транскриптома и унигене функционалне напомене
(1) СНП анализа, ССР анализа, ЦДС предвиђање и структура гена ће бити припремљени.
(2) Извршиће се квантификација експресије унигена у сваком узорку.
(3) Диференцијално изражени унигени између узорака (или група) биће откривени на основу унигене експресије
(4) Радиће се груписање, функционална анотација и анализа обогаћивања различито изражених унигена
-
Дуго некодирајуће секвенцирање-Иллумина
Дуге некодирајуће РНК (лнцРНА) су врста молекула РНК дужине преко 200 нт, које карактерише изузетно низак потенцијал кодирања.ЛнцРНА, као кључни члан некодирајућих РНК, углавном се налази у језгру и плазми.Развој технологије секвенцирања и биоинформтике омогућава идентификацију бројних нових лнцРНА и повезивање оних са биолошким функцијама.Акумулативни докази сугеришу да је лнцРНА широко укључена у епигенетску регулацију, регулацију транскрипције и пост-транскрипциону регулацију.
-
Секвенцирање малих РНК-Иллумина
Мала РНК се односи на класу некодирајућих РНК молекула који су обично мањи од 200 нт у дужини, укључујући микро РНК (миРНА), малу интерферентну РНК (сиРНА) и РНК са интеракцијом са пиви (пиРНА).
МикроРНА (миРНА) је класа ендогене мале РНК дужине од око 20-24нт, која игра низ важних регулаторних улога у ћелијама.миРНА је укључена у многе животне процесе који откривају ткиво – специфично и стадијумско – специфичну експресију и високо очувану код различитих врста.
-
секвенцирање цирцРНА-Иллумина
Секвенцирање целог транскриптома је дизајнирано да профилише све типове РНК молекула, укључујући кодирајуће (мРНА) и некодирајуће РНК (укључујући лнцРНА, цирцРНА и миРНА) које специфичне ћелије транскрибују у одређеном тренутку.Секвенцирање целог транскриптома, такође познато као „укупно секвенцирање РНК“ има за циљ откривање свеобухватних регулаторних мрежа на нивоу транскриптома.Користећи предности НГС технологије, секвенце целих производа транскриптома су доступне за цеРНА анализу и заједничку РНК анализу, што представља први корак ка функционалној карактеризацији.Откривање регулаторне мреже цеРНА засноване на цирцРНА-миРНА-мРНК.
-
Секвенцирање целог транскриптома – Иллумина
Секвенцирање целог транскриптома је дизајнирано да профилише све типове РНК молекула, укључујући кодирајуће (мРНА) и некодирајуће РНК (укључујући лнцРНА, цирцРНА и миРНА) које специфичне ћелије транскрибују у одређеном тренутку.Секвенцирање целог транскриптома, такође познато као „укупно секвенцирање РНК“ има за циљ откривање свеобухватних регулаторних мрежа на нивоу транскриптома.Користећи предности НГС технологије, секвенце целих производа транскриптома су доступне за цеРНА анализу и заједничку РНК анализу, што представља први корак ка функционалној карактеризацији.Откривање регулаторне мреже цеРНА засноване на цирцРНА-миРНА-мРНК.
-
Секвенцирање прокариотске РНК
Секвенцирање прокариотске РНК користи секвенцирање следеће генерације (НГС) да открије присуство и количину РНК у датом тренутку, анализом променљивог ћелијског транскриптома.Секвенцирање прокариотске РНК наше компаније, посебно има за циљ прокариоте са референтним геномима, пружајући вам профилисање транскриптома, анализу структуре гена, итд. Широко се примењује у основним научним истраживањима, истраживању и развоју лекова и још много тога.
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
-
Секвенцирање метатранскриптома
Секвенцирање метатранскриптома идентификује експресију гена микроба (и еукариота и прокариота) у природном окружењу (тј. земљиште, вода, море, измет и црева). Конкретно, ове услуге вам омогућавају да добијете профилисање целокупне експресије гена сложених микробних заједница, таксономску анализу врста, анализа функционалног обогаћивања различито изражених гена и друго.
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
