page_head_bg

Производи

Секвенцирање целог транскриптома – Иллумина

Секвенцирање целог транскриптома је дизајнирано да профилише све типове РНК молекула, укључујући кодирајуће (мРНК) и некодирајуће РНК (укључујући лнцРНА, цирцРНА и миРНА) које специфичне ћелије транскрибују у одређено време.Секвенцирање целог транскриптома, такође познато као „укупно секвенцирање РНК“ има за циљ откривање свеобухватних регулаторних мрежа на нивоу транскриптома.Користећи предности НГС технологије, секвенце целих производа транскриптома су доступне за цеРНА анализу и заједничку РНК анализу, што представља први корак ка функционалној карактеризацији.Откривање регулаторне мреже цеРНА засноване на цирцРНА-миРНА-мРНК.


Детаљи услуге

Биоинформатика

Демо Ресултс

Истраживање случаја

Предности услуге

ØПроцена свих типова РНК у смислу бројања, експресије и релативне експресије засноване на хромозомима
ØИдентификација различито експримираних РНК и одговарајућа експресија
ØАнализа коекспресије гена
ØцеРНА анализа мреже
ØКључни гени су укључивали анализу пута
ØИспорука резултата заснована на БМКЦлоуд-у: Прилагођено рударење података доступно на платформи.
ØУслуге након продаје важе 3 месеца по завршетку пројекта

Захтеви за узорке и достава

Захтеви за пример:

нуклеотиди:

Чистоћа Интегритет Контаминација Износ
ОД260/280≥1,7-2,5; ОД260/230≥0,5-2,5; За биљке: РИН≥6,5;За животиње: РИН≥7;28С/18С≥1.0;ограничена или никаква почетна висина Ограничена или никаква контаминација протеина или ДНК приказана на гелу. Цонц.≥100 нг/μл;Запремина ≥ 10 μл;Укупно ≥ 2 μг

Ткиво: Тежина (суво): ≥1 г
*За ткиво мање од 5 мг, препоручујемо да пошаљете флеш замрзнут (у течном азоту) узорак ткива.

Суспензија ћелија: Број ћелија = 3×107
*Препоручујемо да пошаљете замрзнути лизат ћелија.У случају да је број ћелија мањи од 5×105, препоручује се брзо замрзавање у течном азоту.

Узорци крви:
ПА×генеБлоодРНАТубе;
6мЛТРИзола и 2мЛ крви (ТРИзол:Крв=3:1)

Препоручена достава узорка

Контејнер:
2 мл епрувета за центрифугу (не препоручује се лимена фолија)
Означавање узорка: Група+репликација нпр. А1, А2, А3;Б1, Б2, Б3... ...

испорука:
1. Суви лед: Узорци се морају спаковати у вреће и закопати у суви лед.
2. РНК стабилне епрувете: Узорци РНК се могу осушити у епрувети за стабилизацију РНК (нпр. РНАстабле®) и послати на собној температури.

Ток рада услуге

logo_01

Дизајн експеримента

logo_02

Испорука узорка

logo_03

Екстракција РНК

logo_04

Изградња библиотеке

logo_05

Секвенцирање

logo_06

Анализа података

logo_07

Услуге након продаје


  • Претходна:
  • Следећи:

  • Биоинформатика

    CircRNA-sequencing-analysis-workflow

    1. Процена релативне експресије на основу свих типова РНК
    Circos-on-the-significancy-of-the-differences-in-RNA-expression

    Циркос о значају разлика у експресији РНК

    2. Интегрисана КЕГГ мрежа путева

    Integrated-KEGG-pathway-network

    Интегрисана КЕГГ мрежа путева

    3.цеРНА анализа мреже

    ceRNA-Network-based-DE-circRNA-miRNA-mRNA-Interactions

    Интеракције ДЕ-цирцРНА-миРНА-мРНК засноване на мрежи цеРНА

    БМК Цасе

    ЦирцРНА експресиони образац и мреже цеРНА и миРНА-мРНА укључене у развој антера у ЦМС линији Брассица цампестрис

    Објављено:Међународни часопис за молекуларне науке,2019

    НОНММУТ015812-кноцкдовн КП (схРНА-2) ћелије и ћелије негативне контроле (сх-Сцр) су добијене 6. дана специфичне вирусне инфекције.

    Кључни резултати

    Овом студијом је установљена полима цитоплазма мушка стерилност (ЦМС) линија „Бцпол97-05А” и плодна линија, „Бцајх97-01Б”, у Брассица цампестрис Л. ссп.цхиненсис Макино, син.Б. рапа ссп.цхиненсис, и извршио поређења профилисања РНК експресије између цветних пупољака стерилне линије и плодне линије секвенцирањем целог транскриптома.
    1. Укупно је идентификована 31 различито експримирана (ДЕ) цирцРНА, 47 ДЕ миРНА и 4779 ДЕ мРНК.
    2. Анализа онтологије гена (ГО) је показала да је већина гена ДЕ била укључена у развој зида полена
    3. Анализа КЕГГ пута обогаћивања ДЕ мРНК (укључујући мРНА регулисане навише и наниже у стерилној линији у поређењу са плодном линијом) показала је да „метаболизам скроба и сахарозе“, „биосинтеза фенилпропаноида“ и „интерконверзије пентозе и глукуроната ” су били најбогатији метаболички путеви.

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    Анализа КЕГГ пута обогаћивања различито експримираних мРНК

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    Онтолошка класификација гена (ГО) за различито експримиране мРНК

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    Поглед на троструку мрежу ДЕцирцРНА-ДЕмиРНА-ДЕмРНА

    Референца

    Лианг И, Зханг И, Ксу Л, ет ал.ЦирцРНА експресиони образац и мреже цеРНА и миРНА-мРНА укључене у развој антера у ЦМС линији Брассица цампестрис [Ј].Међународни часопис за молекуларне науке, 2019, 20(19):4808-.ДОИ: 10.3390/ијмс20194808

    добили Цитат

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: