BMKCloud Log in
条形banner-03

Produk

Urutan DNA/RNA -PacBio Sequencer

Platform sequencing PacBio mangrupikeun platform sekuen anu dibaca panjang, anu ogé katelah salah sahiji téknologi Sequencing Generasi Katilu (TGS).Téknologi inti, molekul tunggal sacara real-time (SMRT), nguatkeun generasi bacaan kalayan panjangna puluhan kilo-basa.Dina dasar "Sequencing-by-Synthesis", resolusi nukléotida tunggal kahontal ku Zero-mode waveguide (ZMW), dimana ukur volume kawates di handapeun (situs sintésis molekul), cahayana.Sajaba ti éta, sequencing SMRT sakitu legana ngahindarkeun bias runtuyan-spésifik dina sistem NGS, sabab lolobana léngkah amplifikasi PCR henteu diperlukeun dina prosés konstruksi perpustakaan.

 

Platform: Sequel II, Revio


Rincian Service

Hasil demo

Fitur

Dua mode sequencing on PacBio sequencer: Continuous Long Read (CLR) jeung Circular Consensus Read (CCS)

Mode Sequencing Ukuran Perpustakaan Data TéoritisNgahasilkeun (Per Sél) Dasar tunggalAkurasi Aplikasi
CLR 20 Kb, 30 Kb, jsb. 80 Gb ka 130 Gb Kira-kira.85% De novo, SV nelepon, jsb.
CCS 15-20 Kb

14 nepi ka 40 Gb/Sél (Sequel II)

70 nepi ka 110 Gb/Sél (Revio)

Gumantung kana sampel

Kira-kira.99% De novo, Telepon SNP/Indel/SV, Iso-Seq,

Ngabandingkeun kinerja sarta fitur Revio na Sequel II

Sarat

Sistem Sekuel II

Sistim Revo

Naékkeun

Kapadetan luhur

8 juta ZMWs

25 juta ZMWs

3x

Tahap mandiri

1

4

4x

waktos ngajalankeun pondok

30 jam

24 jam

1,25x

30X HiFi génom manusa / taun

88

1.300

15x sakabéh

Keunggulan Service

● Leuwih 8 taun pangalaman dina platform sequencing PacBio kalawan rébuan proyék katutup jeung sagala rupa spésiés.

● Pinuh dilengkepan platform PacBio Sequencing panganyarna, Revio pikeun ngajamin throughput sequencing cukup.

● Waktos péngkolan langkung gancang, ngahasilkeun data anu langkung luhur sareng data anu langkung akurat.

● Kontribusi dina ratusan publikasi dumasar-PacBio dampak luhur.

Syarat Sampel


Tipe Sampel Jumlah Konsentrasi (Qubit®) Jilid Kasucian Lain
DNA génomik Gumantung kana Sarat Data ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280 = 1.7-2.2;
OD260/230 = 1.8-2.5;
Puncak jelas dina 260 nm,euweuh contaminations
Konsentrasi kedah diukur ku Qubit sareng Qubit/Nanopore = 0.8-2.5
RNA total ≥1,2 μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280 = 1.7-2.5;
OD260/230 = 0,5-2,5;euweuh contaminations

nilai RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

Alur Palayanan

persiapan sampel

Persiapan sampel

Persiapan Perpustakaan

Pangwangunan perpustakaan

Sequencing

Sequencing

Analisis data

Analisis data

Sampel QC

Pangiriman proyék


  • saméméhna:
  • Teras:

  • 1.In-imah Data ngahasilkeun

    Data dihasilkeun tina 63 sél CCS (tina 26 spésiés)

    DATA-PacBio-CCS-15 Kb Rata-rata Max Min Median
    Ngahasilkeun - subreads (Gb) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Ngahasilkeun - CCS(Gb) 25.93 38.59 10.86 25.43
    Polimérase N50 145.651 175.430 118.118 144.689
    Subreads N50 17.509 23.924 12.485 17.584
    CCS N50 14.490 19.034 9.876 14.747
    Rata-rata panjangna-Polimérase 67.995 89.379 49.664 66.433
    Rata panjang-Subreads 15.866 21.036 11.657 16.012
    Rata-rata panjangna-CCS 14.489 19.074 8.575 14.655

    Data dihasilkeun tina 16 sél CLR (tina 76 spésiés)

    DATA-PacBio-CLR-30Kb Rata-rata Max Min Median
    Ngahasilkeun - subreads (Gb) 142.20 291.40 50.55 142.49
    Polimérase N50 39.456 121.191 15.389 35.231
    Subreads N50 28.490 41.012 14.430 29.063
    Rata-rata panjangna-Polimérase 22.063 48.886 8.747 21.555
    Rata panjang-Subreads 17.720 27.225 8.293 17.779

    2. Data QC - DemoStatistik dina ngahasilkeun data

    Sampel

    ccs Bacaan Num

    Total ccs Base (bp)

    ccs Bacaan N50 (bp)

    ccs Rata-rata Panjang (bp)

    ccs Bacaan Pangpanjangna (bp)

    Subbacaan Dasar (bp)

    laju ccs(%)

    PB_BMKxxx

    3.444.159

    54.164.122.586

    15.728

    15.726

    36.110

    863.326.330.465

    6.27

     

    meunang cutatan

    Tulis pesen anjeun di dieu sareng kirimkeun ka kami

    Kirim pesen anjeun ka kami: