Analisis Asosiasi Sakumna Génom
Alur kerja
Kauntungan Layanan
●Catetan Kaahlian sareng publikasi anu legaKalayan pangalaman anu akumulasi dina GWAS, BMKGene parantos ngalengkepan ratusan proyék spésiés dina panalungtikan GWAS populasi, ngabantosan para panaliti pikeun nyebarkeun langkung ti 100 artikel, sareng faktor dampak kumulatif ngahontal 500.
● Analisis bioinformatika anu komprehensif: alur kerja ngawengku analisis asosiasi sipat SNP, nganteurkeun sakumpulan gén calon sareng anotasi fungsional anu saluyu.
●Tim bioinformatika anu terampil pisan sareng siklus analisis pondokKalayan pangalaman anu hébat dina analisis genomik canggih, tim BMKGene nganteurkeun analisis anu komprehensif kalayan waktos penyelesaian anu gancang.
●Dukungan Pasca-Penjualan:Komitmen kami henteu ngan ukur ngalengkepan proyék kalayan periode layanan purna jual 3 bulan. Salila waktos ieu, kami nawiskeun tindak lanjut proyék, bantosan ngungkulan masalah, sareng sesi tanya jawab pikeun ngawaler patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasilna.
Spésifikasi sareng sarat layanan
| Jenis sekuensing | Skala populasi anu disarankeun | Strategi sekuensing | Sarat nukléotida |
| Sekuensing Génom Sakabéhna | 200 sampel | 10x | Konsentrasi: ≥ 1 ng/µL Jumlah total ≥ 30ng Degradasi atanapi kontaminasi terbatas atanapi henteu aya |
| Fragmen Amplifikasi Lokus Spésifik (SLAF) | Jerona tag: 10x Jumlah tag: < 400 Mb: WGS disarankeun < 1Gb: 100K tag 1Gb > 2Gb: 300K tag Tag maksimal 500k | Konsentrasi ≥ 5 ng/µL Jumlah total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Gel agarose: teu aya atanapi degradasi atanapi kontaminasi terbatas
|
Pilihan Bahan
Rupa-rupa variétas, subspésiés, landrace/bank gén/kulawarga campuran/sumber daya liar
Rupa-rupa variétas, subspésiés, landraces
Kulawarga sadulur/kulawarga sadulur lengkep/sumber daya liar
Aliran Padamelan Layanan
Desain ékspérimén
Pangiriman conto
Ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Urutan
Analisis data
Layanan saatos penjualan
Ngawengku analisis ieu:
- Analisis asosiasi sakumna génom: modél LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Anotasi fungsional tina calon gén
Analisis asosiasi sipat SNP - plot Manhattan
Analisis asosiasi sipat SNP – plot QQ
Jelajah kamajuan anu difasilitasi ku layanan de GWAS BMKGene ngalangkungan koleksi publikasi anu dikuratori:
Lv, L. et al. (2023) 'Wawasan kana dasar genetik tina toleransi amonia dina kerang silet Sinonovacula constricta ku studi asosiasi sakumna génom',Budidaya Akuatik, 569, kc. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Analisis multi-omics tina 398 aksési jawawut buntut rubah ngungkabkeun daérah génomik anu aya hubunganana sareng domestikasi, sipat metabolit, sareng épék anti radang',Tutuwuhan Molekul, 15(8), kaca 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Pemetaan Asosiasi Sakumna Génom tina Fenotipe Hulless Barely dina Lingkungan Halodo',Wates dina Élmu Tutuwuhan, 13, kc. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, anu ngodekeun sulfotransferase, masihan résistansi kana galur virus mosaik kacang kedelai G2 sareng G3',Tutuwuhan, Sél & Lingkungan, 44(8), kaca 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
