Analisis Asosiasi Génom-lega
1.Kaunggulan Service
● Kasus Proyék Loba pisan: saprak ngadegna taun 2009, BMKGENE geus réngsé ratusan proyék spésiés dina populasi panalungtikan GWAS, ditulungan panalungtik pikeun nyebarkeun leuwih ti 100 artikel, sarta faktor dampak kumulatif ngahontal 500.
● analis profésional.
● siklus analisis pondok.
● Pertambangan data anu akurat.
2. Spésifikasi Service
| Tipe | Skala Populasi | Sequencing strategi jeung jero |
| SLAF-GWAS | Jumlah sampel ≥200 | Ukuran génom <400M, kalawan ref-génome, WGS dianjurkeun |
| Ukuran génom ≤ 1G, 100K Tag jeung 10X | ||
| 1G ≤ Ukuran génom ≤ 2G, 200K Tag sareng 10X | ||
| Ukuran génom > 2G, 300K Tag jeung 10X | ||
| WGS-GWAS | Jumlah sampel ≥200 | 10X pikeun tiap sampel |
3. Pamilihan Bahan
Variétas béda, subspésiés, landraces / genebanks / kulawarga campuran / sumberdaya liar
Variétas béda, subspésiés, landraces
kulawarga satengah sib / kulawarga full-sib / sumberdaya liar
4. Analisis Bioinformation
● Analisis pakaitna génom-lega
● Analisis jeung screening of SNP signifikan
● annotation fungsi gén calon
5. Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
a.Phenotype QC
Histogram distribusi frékuénsi
Statistik fenotipe
b.Analisis asosiasi (Modél: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
Plot QQ
Manhattan Plot
| Taun | Jurnal | IF | Judul |
| 2022 | NC | 17.69 | Dasar génomik tina giga-kromosom sareng giga-génome tangkal peony Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7.43 | Doméstikasi footprints jangkar wewengkon génomik pentingna agronomic dina Kacang Kedelai |
| 2018 | MP | 9.32 | Resequencing sakabeh génom tina kumpulan aksési rapeseed sakuliah dunya nembongkeun dasar genetik divergénsi ecotype maranéhanana. |
| 2022 | HR | 7.29 | Analisis asosiasi génom-lega nyadiakeun wawasan molekular kana variasi alami ukuran siki samangka |
